詳細介紹
上海RNA操作步驟:
1. 勻漿處理:
a.組織 將組織在液氮中磨碎,每50-100mg組織加入1ml TRIzol,用勻漿儀進行勻漿處理,。樣品體積不應超過TRIzol體積10℅,。
b.單層培養(yǎng)細胞 直接在培養(yǎng)板中加入TRIzol裂解細胞,每10cm2面積(即3.5cm直徑的培養(yǎng)板)加1ml,,用移液器吸打幾次,。TRIzol的用量應根據(jù)培養(yǎng)板面積而定,不取決于細胞數(shù),。TRIzol加量不足可能導致提取的RNA有DNA污染,。
c.細胞懸液 離心收集細胞,每5-10×106動物,、植物,、酵母細胞或1×107細菌細胞加入1ml TRIzol,反復吸打,。加TRIzol之前不要洗滌細胞以免mRNA降解,。一些酵母和細菌細胞需用勻漿儀處理。
上海RNA將勻漿樣品在室溫(15-30℃)放置5分鐘,,使核酸蛋白復合物*分離,。
1.可選步驟:如樣品中含有較多蛋白質(zhì),脂肪,,多糖或胞外物質(zhì)(肌肉,,植物結節(jié)部分等)可于2-8℃10000×g離心10分鐘,取上清,。離心得到的沉淀中包括細胞外膜,,多糖,高分子量DNA,上清中含有RNA,。處理脂肪組織時,,上層有大量油脂應去除。取澄清的勻漿液進行下一步操作,。
2. 2-8℃10000×g離心15分鐘,。樣品分為三層:底層為黃色有機相,上層為無色水相和一個中間層,。RNA主要在水相中,,水相體積約為所用TRIzol試劑的60℅。
. 把水相轉(zhuǎn)移到新管中,,如要分離DNA和蛋白質(zhì)可保留有機相,,進一步操作見后。用異丙醇沉淀水相中的RNA,。每使用1ml TRIzol加入0.5ml異丙醇,,室溫放置10分鐘。
1. 2-8℃10000×g離心10分鐘,,離心前看不出RNA沉淀,,離心后在管側(cè)和管底出現(xiàn)膠狀沉淀。移去上清,。
2. 用75℅乙醇洗滌RNA沉淀,。每使用1ml TRIzol至少加1ml 75℅乙醇。2-8℃不超過7500×g離心5分鐘,,棄上清,。
3.室溫放置干燥或真空抽干RNA沉淀,大約晾5-10分鐘即可.不要真空離心干燥,,過于干燥會導致RNA的溶解性大大降低,。加入25-200μl無RNase的水或0.5℅SDS,用槍頭吸打幾次,55-60℃放置10分鐘使RNA溶解.如RNA用于酶切反應,勿使用SDS溶液。RNA也可用100℅的去離子甲酰胺溶解,,-70℃保存,。