凝膠遷移貨電泳遷移率實驗（EMSA）是一種研究DNA結(jié)合蛋白和其相關(guān)的DNA結(jié)合序列相互作用的技術(shù),，可用于定性和定量分析,。目前這一技術(shù)還可以用于研究RNA結(jié)合蛋白和特定的RNA序列的相互作用,。其基本流程是將純化的蛋白和同位素生物素?zé)晒馑貥?biāo)記的DNA或RNA探針進行孵育,，在非變性的聚丙烯凝膠電泳上,，分離復(fù)合物和非結(jié)合的探針,。

DNA復(fù)合物或RNA復(fù)合物比非結(jié)合的探針移動的慢,。競爭試驗中采用含蛋白結(jié)合序列的DNA或RNA的片段和寡核苷酸片段（特異），和其他非相關(guān)片段（非特異）,，來確定DNA或RNA結(jié)合蛋白的特異性,。還可以通過在體系中加入目的蛋白的特異性抗體，發(fā)生超遷移（super-shift）,，確定目的蛋白與基因片段的結(jié)合,。在競爭的特異性和非特異性前段的存在下，依據(jù)復(fù)合物的特點和強度來確定特異結(jié)合,。

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EMSA實驗    

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EMSA ( Electrophoretic Mobility Shift Assay ) 凝膠遷移實驗是一種研究DNA與蛋白質(zhì)或RNA與蛋白質(zhì)相互作用的常用技術(shù),。這項技術(shù)是基于DNA/蛋白質(zhì)或RNA/蛋白質(zhì)復(fù)合體在聚丙烯酰胺凝膠電泳（PAGE）中有不同遷移率的原理。當(dāng)核轉(zhuǎn)錄因子與一條人工合成的特異的DNA或RNA結(jié)合后,，其在PAGE中的遷移率將小于未結(jié)合核蛋白轉(zhuǎn)錄因子的DNA,，從而檢測到活化的與DNA或RNA結(jié)合的蛋白轉(zhuǎn)錄或調(diào)節(jié)因子。