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不讓您寶貴的克隆留下“疤痕”,!
提起傳統(tǒng)酶切連接克隆或載體構(gòu)建,什么讓大家苦不堪言,?
小A:每次都要糾結(jié)于各種限制性內(nèi)切酶的選擇。
小B:操作步驟繁瑣,,耗時長,,至少需三四天才能完成。
小C:每次只能克隆1個目的片段,。
小D:片段結(jié)合位置上有時會留下“疤痕”,。
······
忘記苦難,今天小編給大家介紹一種新的克隆方法—一步法同源重組技術(shù),,帶你們脫離苦惱,!
一步法同源重組是一種利用同源重組的原理,進行無縫克隆的技術(shù),。該技術(shù)無需考慮酶切位點,,幾乎適用于任何載體與任何片段的定向克隆。操作過程簡單快速,,只需50℃,,20min即可完成反應(yīng)。勁爆的是,,多個片段也可以同時克隆哦,!
激動寶寶小C:如此厲害,是如何做到呢,?
【秘】一步法同源重組的關(guān)鍵在于重組酶,。它由三種酶混合而成。分別是外切酶,,DNA聚合酶和連接酶,。
外切酶活性:該酶能沿著5’→3’方向,降解雙鏈DNA,,從而產(chǎn)生黏性末端,,這樣便于與另外的同源末端進行配對結(jié)合(兩個同源序列通過外切酶的切割,能產(chǎn)生幾乎一致的黏性末端),。
DNA聚合酶活性:外切酶作用后,,并不能保證將每一個片段的5’末端都降解成一樣長的黏性末端,同源末端退火配對后,,極可能存在缺失的堿基,。此時需要借助DNA聚合酶進行修復(fù)缺口。
連接酶活性:催化形成磷酸二酯鍵,,將所有缺口補齊,,實現(xiàn)無“疤痕”拼接,即無縫克隆,。
好奇寶寶小D:外切酶降解雙鏈DNA多長呢,?是否會把雙鏈DNA切割成單鏈導(dǎo)致無法進行片段重組呢,?
莫擔心,自有妙招,!的重組反應(yīng)溫度是50℃,,遠高于外切酶的zui適溫度(37℃),此外,,外切酶的含量較低,,故重組反應(yīng)體系中很快會失去外切酶活性。對于200bp以上的雙鏈DNA-片段都是*不用擔心的,,當然,,幾十bp的小片段是不適合同源重組的。
心急寶寶小B:這么牛掰的,,快給我們講講怎么操作吧,。
步驟1:制備載體
需將線性化載體的制備好,既可以選擇酶切,,也可以選擇PCR的方式制備線性化載體,。
步驟2:設(shè)計目的片段引物
在目的片段上下游引物的5’端引入15-25bp左右載體末端同源序列。
步驟3:擴增目的片段
通過PCR的方法,,使目的片段的兩端加上了與載體末端相應(yīng)的同源序列,。
步驟4:重組反應(yīng)
按比例混合線性化載體和目的片段,50℃反應(yīng)20 min,。
步驟5:轉(zhuǎn)化,,鑒定
將重組產(chǎn)物直接轉(zhuǎn)化后涂平板,挑取克隆進行陽性鑒定,。
機智寶寶小A:有啥應(yīng)用呢,?
可以應(yīng)用于定點突變,CRISPR,,構(gòu)建多順反子表達載體等等,。
看完有收獲,記得點完贊再走,!
有想法,,歡迎下方留言評論!
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