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翌圣ZymeEditor平臺RPA核心酶原料助力恒溫擴增技術(shù)升級,!

2023-7-18  閱讀(203)

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重組酶聚合酶擴增(Recombinase Polymerase Amplification,,RPA)是Piepenburg等人在2006年利用參與細(xì)胞DNA合成的蛋白重組和修復(fù)開發(fā)出的一種新的核酸恒溫擴增技術(shù),。該技術(shù)可以在37~42 ℃條件下實現(xiàn)待測靶標(biāo)的快速檢測,。它具有反應(yīng)靈敏度高,、特異性強,、對儀器依賴程度低且可整合多種檢測模式等優(yōu)點,特別適用于基層和現(xiàn)場即時檢測,,可廣泛應(yīng)用于體外診斷,、獸醫(yī)、食品安全,、生物安全,、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域[1]


 

一,、RPA技術(shù)原理

RPA技術(shù)主要依賴于能結(jié)合寡核苷酸引物的T4噬菌體來源的重組酶T4 UvsX,、單鏈結(jié)合蛋白gp32和鏈置換Bsu DNA 聚合酶以及兩條特異性的上下游引物實現(xiàn)擴增,具體擴增原理如圖1所示:

1.重組酶聚合酶擴增RPA技術(shù)擴增原理圖[2]

1.重組酶引物復(fù)合體的形成:重組酶T4 UvsX在ATP的參與和定位因子(T4 UvsY)的幫助下與擴增引物結(jié)合形成重組酶引物復(fù)合體,,并在雙鏈DNA中尋找同源序列,;

2.重組酶引物復(fù)合體定位至同源序列:重組酶引物復(fù)合體一旦定位到同源序列,則會插入雙鏈DNA形成D-環(huán)結(jié)構(gòu),,啟動鏈置換反應(yīng),,單鏈結(jié)合蛋白gp32會與解開的DNA鏈結(jié)合防止進一步被置換,。

3.鏈置換擴增啟動:重組酶T4 UvsX從重組酶引物復(fù)合體中被水解,3'端引物暴露并與Bsu DNA聚合酶結(jié)合,,DNA開始復(fù)制延伸,,最終兩條母鏈分離,形成兩條新的互補雙鏈DNA,。該反應(yīng)在37-42℃下進行,,可在30 min內(nèi)實現(xiàn)目標(biāo)序列1012倍的擴增。

 

二,、RPA技術(shù)優(yōu)勢
1. 檢測靈敏度高:可將痕量的核酸模板(低至單拷貝)擴增至可以檢出的水平,,且通常無需進行核酸純化。
2. 無需昂貴的配套儀器設(shè)備:37~42°C恒溫反應(yīng),,無須熱循環(huán),,擺脫儀器束縛,方便快捷,。
3. 樣本耐受性高:適合復(fù)雜樣本的擴增檢測,。例如未經(jīng)核酸純化的血液或鼻拭子,只需要通過熱或堿進行預(yù)處理促進核酸釋放即可,。
4. 檢測方法多樣化:包括電泳法檢測,、熒光探針法檢測、側(cè)流層析試紙條檢測等,。

 

三,、RPA技術(shù)應(yīng)用
RPA技術(shù)可用于不同種類的目標(biāo)生物檢測,如細(xì)菌,、真菌,、病毒、原生動物等的雙鏈DNA,、單鏈DNA,、甲基化DNA以及通過RNA或miRNA反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的cDNA等核酸樣本。RPA技術(shù)目前已被成功應(yīng)用于農(nóng)業(yè),、醫(yī)學(xué),、食品、疫病防控等領(lǐng)域,,具有廣闊的應(yīng)用前景,。

 

圖2.RPA技術(shù)應(yīng)用

 

四、RPA技術(shù)核心酶原料
翌圣ZymeEditor™酶改造平臺針對RPA技術(shù),,目前已獲得RPA全系列性能優(yōu)良的產(chǎn)品,,包括鏈置換Bsu DNA polymerase、T4 UvsX Recombinase,、T4 UvsY protein,、T4 gene 32 protein,、肌酸激酶Creatine Kinase和Exonuclease III。

 

翌圣RPA產(chǎn)品選擇指南

 

產(chǎn)品名稱產(chǎn)品貨號產(chǎn)品作用
Bsu DNA polymerase (Large fragment, 5 U/μL)11078ES結(jié)合引物與原始靶核酸序列互補合成新的DNA模板
T4 UvsX Recombinase (2 μg/μL)11079ES具有配對和鏈轉(zhuǎn)移活性的重組酶
T4 UvsY protein (2 μg/μL)11080ES重組酶輔助因子,,刺激T4 UvsX的單鏈DNA依賴性ATP酶活性并降低活性所需的T4 UvsX臨界濃度
T4 gene 32 protein (gp 32) T4噬菌體基因32編碼蛋白11081ES參與DNA復(fù)制,、修復(fù)、重組與解鏈后的單鏈DNA結(jié)合,,防止自雜交
Creatine Kinase (2 μg/μL) 肌酸激酶14502ES刺激ATP和肌酸分解為磷酸肌酸和ADP,釋放能量
Exonuclease III (100 U/μL)14525ES具有3’→5’外切酶活性,,切斷熒光探針中淬滅基團,,釋放熒光

 

客戶測試案例展示

 

客戶采用翌圣Bsu DNA polymerase (Large fragment, 5 U/μL)、T4 UvsX Recombinase (2 μg/μL),、T4 UvsY protein (2 μg/μL),、T4 gene 32 protein (gp 32)、肌酸激酶Creatine Kinase (2 μg/μL) 進行RPA擴增反應(yīng),,得到正確的目的條帶,,且條帶清晰、明亮,,結(jié)果表明,,PRA技術(shù)核心酶原料可實現(xiàn)高效RPA等溫擴增。

圖3 客戶測試翌圣重組酶聚合酶核心酶原料擴增結(jié)果圖

注:2,、4為陽性實驗組,;1、3為陰性對照組

 

參考文獻(xiàn)

[1] Zhao Y, Chen F, Li Q, Wang L, Fan C. Isothermal Amplification of Nucleic Acids. Chem Rev. 2015 Nov 25;115(22):12491-545. doi: 10.1021/acs.chemrev.5b00428. Epub 2015 Nov 9. PMID: 26551336.

[2] 王亞楠, 陳昌國. 重組酶聚合酶擴增技術(shù)研究進展[J]. 醫(yī)學(xué)雜志, 2021, 46(5):8.



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