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Taq DNA聚合酶的非特異擴增是PCR實驗中的常見問題,,非特異擴增直接影響檢測結(jié)果的判讀并且會導(dǎo)致擴增靈敏度下降,,甚至目標(biāo)片段的得率下降等,。利用酶修飾劑在常溫下封閉Taq DNA聚合酶酶活中心,抑制常溫下Taq酶的DNA聚合酶活性,,是目前抑制非特異性擴增的方式,。翌圣開發(fā)的雙封閉抗體,不僅可以封閉Taq DNA聚合酶的聚合酶活性,,還能同時封閉Taq DNA聚合酶的外切酶活性,,雙管齊下,既能有效防止錯配或引物二聚體引起的非特異性擴增,,又能防止物料降解產(chǎn)生非特異信號,,雙重提升試劑特異性,使檢測試劑在運輸或室溫使用過程中都能夠從容應(yīng)對,。
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圖1.Yeasen雙封閉熱啟動Taq酶抗體產(chǎn)品
注:產(chǎn)品號 - CN202010666417.7
擴增特異性——雙封閉抗體可在低溫時同時封閉聚合酶和外切酶活性,,能有效避免非特異性擴增,提高擴增特異性
檢測靈敏度——熱啟動形式增加了引物與微量的正確模板碰撞退火的效率,,從而可保證低豐度基因有效檢出,,靈敏度更高
優(yōu)秀產(chǎn)品穩(wěn)定性——37℃放置5天、4℃放置10天性能穩(wěn)定
基線平穩(wěn)線性好——解決了基線上漂問題,,線性好
酶活釋放速度快——95℃下加熱20 s即可釋放95%以上酶活
酶類適用范圍廣——野生型和突變型Taq酶均適用,,每mg抗體可封閉4-10 KU Taq酶(針對不同類型的Taq酶略有不同)
將合成的引物探針分別配于未封閉以及雙封閉抗體封閉的Taq DNA聚合酶的反應(yīng)液中,40℃反應(yīng),,檢測兩者熒光信號,,發(fā)現(xiàn)雙封閉抗體可有效封閉Taq DNA聚合酶的外切酶活性。
圖2.雙封閉抗體外切酶活性封閉效率檢測
分別用翌圣雙封閉抗體以及T公司抗體對Taq 酶封閉后通過ARMS-PCR技術(shù)檢測陽性樣本,,發(fā)現(xiàn)翌圣雙封閉抗體封閉的Taq酶在ARMS-PCR擴增中分型準(zhǔn)確,,靈敏度更高。
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圖3.ARMS-PCR擴增曲線圖
用傳統(tǒng)封閉抗體與雙封閉抗體分別封閉Taq DNA聚合酶,配置成含引物探針的全預(yù)混液,,在4℃放置10天或在37℃放置1,、3、5天,,擴增10000拷貝ASF質(zhì)粒,,發(fā)現(xiàn)擴增曲線和Ct值無明顯變化。
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圖4.4℃?zhèn)鹘y(tǒng)封閉抗體(A),、雙封閉抗體(B)封閉反應(yīng)液擴增10000拷貝ASF質(zhì)粒擴增曲線圖
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圖5.37℃?zhèn)鹘y(tǒng)封閉抗體(A),、雙封閉抗體(B)封閉反應(yīng)液擴增10000拷貝ASF質(zhì)粒擴增曲線圖
某些引物配合特定buffer和儀器時,會出現(xiàn)基線上漂的情況,,但雙封閉抗體能解決基線上漂問題,,更有利于基線平穩(wěn),。
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圖6.N基因(A)、ACT基因(B)擴增曲線圖
用雙封閉抗體封閉的反應(yīng)液擴增100000,、10000,、1000、100拷貝ASFV/ACT雙質(zhì)粒,,制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,。由圖7可以看到,兩者線性均良好,。
圖7. 雙封閉反應(yīng)液制作ASFV基因,、ACT基因標(biāo)準(zhǔn)曲線圖
分別用進口T公司抗體和翌圣雙封閉抗體(Cat#31303)封閉Taq酶,并在95℃下熱激20 s,,檢測酶活,。可以看到95℃熱激20 s后,,31303可釋放95%以上的酶活,,與T公司抗體相當(dāng)。
表1.95℃下熱激20 s酶活
翌圣雙封閉抗體(Cat#31303)分別封閉三種類型Taq酶(野生型+2種突變型),,封閉比例為1μg : 5U,,測量熒光值以及封閉效率。發(fā)現(xiàn)對于不同類型的Taq酶,,翌圣雙封閉抗體(Cat#31303)封閉效果均較好,。
表2.不同類型Taq酶的封閉效率
以水為模板作為陰性對照,小鼠基因組為模板作為陽性對照,,擴增不同批次的31303,,觀察條帶,發(fā)現(xiàn)樣品未擴增出目的片段,,說明抗體不存在小鼠基因組殘留,。
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圖8 小鼠基因組殘留檢測圖
注:-為陰性對照,+為陽性對照,,1-5為31303不同批次樣品
產(chǎn)品定位 | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號 |
聚合酶與外切酶活性雙封閉抗體 | Hieff® Double-Block anti-Taq DNA Polymerase Antibody Taq 酶單克隆抗體 | 31303ES |
聚合酶活性封閉抗體 | Hieff® anti-Taq DNA Polymerase Antibody Taq酶單克隆抗體 | 31301ES |
外切酶活性封閉抗體 | Hieff® anti-exonuclease of Taq Antibody Taq酶5'→3'外切酶單克隆抗體 | 31302ES |