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轉(zhuǎn)染效率低?小翊手把手教你做轉(zhuǎn)染實驗
細胞膜是由磷脂雙分子層和鑲嵌蛋白組成的,,帶有負電荷,。因此帶有負電荷的DNA或RNA無法通過細胞膜。為了讓核酸(DNA或RNA)通過細胞膜,,研究人員利用不同的方法,,包括使用化學物質(zhì)和包被核酸的載體分子進行中和,以及在細胞膜上開孔等物理方法,,將核酸(DNA或RNA)直接運輸?shù)郊毎麅?nèi),。這些就是轉(zhuǎn)染的過程,轉(zhuǎn)染的目的是促進蛋白合成,,調(diào)節(jié)基因表達,,促進細胞生長與發(fā)育等,目前越來越多地被用到功能研究中,。
圖1 DNA/RNA轉(zhuǎn)染過程(圖片來源:圖片來源于網(wǎng)絡(luò))
1.常見轉(zhuǎn)染方法
根據(jù)導入的核酸在目的細胞中存活時間的長短,,可以將轉(zhuǎn)染技術(shù)分為瞬時轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染。也可以根據(jù)轉(zhuǎn)染方式的不同,,分為化學轉(zhuǎn)染,,物理轉(zhuǎn)染、和生物轉(zhuǎn)染方法,。例如脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染,、陽離子聚合物PEI轉(zhuǎn)染、電轉(zhuǎn),、顯微注射,、以及慢病毒包裝轉(zhuǎn)染等等。
但是,,沒有一種轉(zhuǎn)染試劑可以滿足所有的實驗要求,。必須根據(jù)您的細胞類型(原代細胞、貼壁細胞,、懸浮細胞),、外源核酸種類(DNA、RNA),、基因表達時間,、細胞毒性、轉(zhuǎn)染效率等,,操作是否簡便等因素,,挑選出///理想的轉(zhuǎn)染試劑,。
圖2不同轉(zhuǎn)染方法的原理和優(yōu)點
在轉(zhuǎn)染過程中,即使選對了合適的轉(zhuǎn)染試劑,,還是不可避免會出現(xiàn)各種令人頭疼的問題,,例如,轉(zhuǎn)染效率低,,細胞死亡,,重復性差等問題。對于這些問題,,我們接下來會詳細剖析,。
2.轉(zhuǎn)染效率低
2.1轉(zhuǎn)染前
1)核酸純度不夠,比如DNA/RNA不純,、質(zhì)粒中含有內(nèi)毒素,、核酸不完整、核酸濃度過低均會導致轉(zhuǎn)染效率低,。建議使用高純度的DNA或RNA有助于獲得較高的轉(zhuǎn)染效率,。
2)要檢測所用的無血清培養(yǎng)基與轉(zhuǎn)染試劑的相容性,已知CD293, SFMII, VP-SFM 與轉(zhuǎn)染試劑不相容,。
3)用了含有血清的培養(yǎng)基制備轉(zhuǎn)染復合物,。血清會降低復合物的形成。建議用無血清培養(yǎng)基稀釋DNA/RNA和轉(zhuǎn)染試劑,。
4)DNA或RNA的復合物形成的比例,,一般DNA(µg):轉(zhuǎn)染試劑(µL)=1:2~1:3;而RNA(ng):轉(zhuǎn)染試劑(µL)=9:1~3:1,。
5)復合物孵育時間過短,,未能充分形成復合物。建議復合物孵育時間10~20 min,。
6)轉(zhuǎn)染試劑保存不當,,降低轉(zhuǎn)染效率。保存在4 ºC冰箱,,不可凍存,,避免反復長時間開蓋。
2.2轉(zhuǎn)染時
7)細胞密度過低或過高,。DNA轉(zhuǎn)染細胞密度90%~95%,,RNA轉(zhuǎn)染細胞密度30%~50%。
8)細胞生長狀態(tài)不佳,。清除支原體,、真菌、細菌等污染,,保證提供新鮮的生長培養(yǎng)基,。
9)轉(zhuǎn)染時細胞上清液中含有抗生素、生長因子等,,大大降低轉(zhuǎn)染效率,。
2.3轉(zhuǎn)染后
10) 轉(zhuǎn)染時間過短。一般質(zhì)粒表達水平在24~48h,,mRNA表達水平在24~72 h,,蛋白表達水平在48~96 h。
3.細胞毒性大
3.1轉(zhuǎn)染前
1)核酸純度不純也會造成細胞毒性,。要確保質(zhì)粒中無內(nèi)毒素,,使用高純度的DNA或RNA會降低細胞毒性。
2)轉(zhuǎn)染試劑過量,。優(yōu)化轉(zhuǎn)染試劑的用量,,以及優(yōu)化復合物的比例。
3)要檢查稀釋復合物的培養(yǎng)基與細胞的相容性,,已知DMEM培養(yǎng)基對一些昆蟲細胞系有毒性,。建議選擇合適的培養(yǎng)基。
3.2轉(zhuǎn)染時
4)細胞密度過低,,會導致部分細胞死亡,。DNA轉(zhuǎn)染細胞密度90%~95%,RNA轉(zhuǎn)染細胞密度30%-50%,。
5)細胞生長狀態(tài)不佳,。清除支原體、真菌,、細菌等污染,,保證提供新鮮的生長培養(yǎng)基。
3.3轉(zhuǎn)染后
6)轉(zhuǎn)染后目的蛋白的過度表達對細胞產(chǎn)生毒性,。建議及時更換新鮮培養(yǎng)基,,或者添加一些營養(yǎng)物質(zhì)。
7)轉(zhuǎn)染后表達蛋白對細胞產(chǎn)生毒性,。建議換一種細胞系重新轉(zhuǎn)染,。
8)轉(zhuǎn)染時間過短,就進行抗性篩選,。一般質(zhì)粒表達水平在24~48h,,mRNA表達水平在24~72 h,蛋白表達水平在48~96 h,。
9)抗性篩選時,,加入的抗生素濃度過高。適當降低抗生素的濃度,。
4.重復性差
4.1轉(zhuǎn)染前
1)移液誤差,。將DNA/RNA和轉(zhuǎn)染試劑充分打勻后,,用移液器緩慢均勻的吸取,避免產(chǎn)生誤差,。
2)制備復合物時,,未充分混勻。將DNA/RNA和轉(zhuǎn)染試劑輕輕混勻,,并保證相同的孵育時間,。
4.2轉(zhuǎn)染時
3)細胞密度存在差異。一般在特定的密度范圍內(nèi),,細胞密度越低,,轉(zhuǎn)染效率越低,相反越高,。
4)細胞生長狀態(tài)存在差異,。好的細胞狀態(tài),轉(zhuǎn)染效率越高,。
5)細胞傳代次數(shù)不同,。對于多次傳代的細胞,細胞的基因組和表型都會發(fā)生變化,,不建議使用傳代次數(shù)過多的細胞進行轉(zhuǎn)染實驗,。
4.3轉(zhuǎn)染后
6)轉(zhuǎn)染時間不一致,表達的蛋白水平會有差異,。
5.相關(guān)文獻及產(chǎn)品
已發(fā)表文章
[1] Chen T, Chen Y, Chen H, et al. Dual-enzyme-propelled unbounded DNA walking nanomachine for intracellular imaging of lowly expressed microRNA[J]. Nano Research, 2019, 12(5): 1055-1060. (IF 8.21)
[2] Zhang X, Qi Z, Yin H, et al. Interaction between p53 and Ras signaling controls cisplatin resistance via HDAC4-and HIF-1α-mediated regulation of apoptosis and autophagy[J]. Theranostics, 2019, 9(4): 1096. (IF 8.12)
[3] Zhang K, Zhao X, et al. Enhanced Therapeutic Effects of Mesenchymal Stem Cell-Derived Exosomes with an Injectable Hydrogel for Hindlimb Ischemia Treatment. ACS Appl Mater Interfaces. 2018 Sep 12;10(36):30081-30091.(IF 8.09)
[4] Chen Y, Hao Q, Wang J, et al. Ubiquitin ligase TRIM71 suppresses ovarian tumorigenesis by degrading mutant p53[J]. Cell Death and Disease, 2019, 10(10): 1-14. (IF 5.72)
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