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Qubit核酸濃度檢測,,資料匯總(包含實(shí)驗(yàn)常見問題解析)

2020-5-13  閱讀(4352)

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Qubit核酸濃度檢測,小翊送你資料匯總

(包含實(shí)驗(yàn)常見問題解析)

背景簡介:

目前,,實(shí)驗(yàn)室大多采用分光光度計來對DNA和RNA進(jìn)行定量,。雖然這種方法被廣泛采用,但并不意味著它的讀數(shù)是準(zhǔn)確而可靠的,。因?yàn)?/span>紫外吸光度測量不具有選擇性,,無法區(qū)分DNA、RNA或蛋白質(zhì),,同時一些游離核苷酸或多余的鹽離子也會影響檢測的數(shù)值,。此外,,紫外分光光度計的靈敏度不足,無法完成低濃度DNA和RNA的定量,。

基于此,,Life Technologies(賽默飛世爾旗下)推出了Qubit,我們一起來探索一下qubit的神奇之處,。


Qubit熒光計

Qubit熒光計是新一代核酸和蛋白定量儀,,Thermo研發(fā)生產(chǎn)的一種檢測核酸質(zhì)量和數(shù)量,并對RNA,、ssDNA,、dsDNA、蛋白質(zhì)等進(jìn)行定量的小型儀器,,主要用于需要進(jìn)行高靈敏性,、高特異性及高度測量的實(shí)驗(yàn)應(yīng)用。 目前主要是以qubit3.0和qubit4.0為主,。


儀器原理

采用熒光染料檢測特定目標(biāo)分子的濃度,,配套只有與DNA,、RNA或蛋白質(zhì)結(jié)合后才發(fā)出熒光的特異性熒光染料,。這些熒光染料只有與特異性的靶分子結(jié)合時才能發(fā)出熒光信號,采用專門的熒光檢測技術(shù),,檢測特定目標(biāo)分子的濃度,,從而對DNA和RNA進(jìn)行定量


實(shí)驗(yàn)操作

簡單兩步

1. 配置標(biāo)準(zhǔn)品并測量,,儀器自動校正并生成標(biāo)準(zhǔn)曲線,;

2. 配置檢測樣本,上機(jī)檢測

2. Qubit實(shí)驗(yàn)操作流程圖


特點(diǎn)

Qubit技術(shù)只檢測靶分子而不是污染物的濃度,,比如:Qubit檢測雙鏈DNA濃度時,,特異性檢測待測樣本中的的雙鏈DNA,對于樣本中存在的單鏈DNA或者RNA不檢測,。

這種特異性可以獲得十分的結(jié)果,,對于芯片分析(Microarray)和實(shí)時定量PCR(qPCR)而言,測定樣本中的DNA或RNA是必需的,。同時在新一代測序(NGS)實(shí)驗(yàn)中,,對我們后續(xù)的建庫過程也是很必要的。


常見問題匯總

1.Qubit檢測能否指示核酸樣品中的樣品質(zhì)量,?

能,,Qubit 檢測 樣品中DNA/RNA的量。 Qubit熒光計不能獲取吸光度讀數(shù)以提供A260 / A280比率或檢測核酸樣品中的蛋白質(zhì),。質(zhì)量情況可以使用NanoDrop儀器完成,。

2. 產(chǎn)品成分只有兩個標(biāo)準(zhǔn)品,,制作標(biāo)準(zhǔn)曲線的時候需要對standard 2進(jìn)行稀釋嗎?

使用產(chǎn)品時可直接用兩個標(biāo)準(zhǔn)品測定熒光值后做標(biāo)準(zhǔn)曲線,,即兩點(diǎn)連成直線,。

如果想稀釋多個梯度制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,也可以使用1×TE對standard 2 進(jìn)行梯度稀釋,。

另如果擔(dān)心96孔板測試時候熒光相互干擾,,可選擇黑色的底部透明板。

3.使用酶標(biāo)儀做Qubit檢測,,Ex值480 nm,,Em值520 nm,但是我用的儀器沒有這兩個波長設(shè)置,,其他的波長測定可以嗎,?準(zhǔn)確度和靈敏度與酶標(biāo)儀相比如何?

可以,,picogreen的吸收峰如下圖,,可知Ex在480nm處有大吸收峰,Em在520nm處有大吸收峰,,而如果儀器波長不在這兩個上面,,也是可以測定的,只不過熒光值會低一點(diǎn)的,。

Qubit定量分析的準(zhǔn)確度和靈敏度與酶標(biāo)儀的準(zhǔn)確度和靈敏度相同,。 這是產(chǎn)品開發(fā)過程中的一項(xiàng)要求。

4. 為什么要做復(fù)孔,?

Qubit是一個靈敏度比較高的濃度測定儀器,,測量值與樣本的質(zhì)量和外界的溫度都有關(guān)系,增加復(fù)孔可以有效降低測量過程中帶來的誤差,,保證數(shù)據(jù)的可準(zhǔn)確性,。

5. 復(fù)孔對應(yīng)的數(shù)據(jù)不一致?

1)操作誤差,;2)樣本質(zhì)量差,,濃度低對應(yīng)的誤差較大;3)片段長度不均一(Qubit里面的染料對于不同長度的DNA結(jié)合能力有差別,,重復(fù)對應(yīng)的時間不同,,熒光值不同)

6. 環(huán)境溫度不同,測試的值會不同嗎,?

會的,,Qubit里面對應(yīng)的熒光染料在不同的溫度下對應(yīng)的熒光信號強(qiáng)弱會有偏差的,一般在低溫測出的值會偏大大,,高溫測出的值偏?。ㄔ谠噭┖兄袠?biāo)準(zhǔn)品恢復(fù)室溫測試時,,整體誤差范圍在10%左右,極限誤差在15%左右)

7.測試復(fù)孔的時候,,連續(xù)測,,不取出來,為什么值越來越???

連續(xù)在激發(fā)光激發(fā)的情況下,熒光染料的半衰期會降低,,此時對應(yīng)收集的熒光信號會降低,,對應(yīng)的數(shù)據(jù)會偏低,建議讀取完數(shù)據(jù)之后,,從儀器中取出,,5min左右再去測量,基本不會有什么偏差

8. 如何檢測Qubit試劑的測試準(zhǔn)確性,?

1)相對準(zhǔn)確,,參考life對應(yīng)試劑測量,對比結(jié)果分析,;

2)準(zhǔn)確,,試劑盒中配套的標(biāo)準(zhǔn)品,經(jīng)過適當(dāng)稀釋之后,,上機(jī)測試,,對比結(jié)果分析


對應(yīng)產(chǎn)品

dsDNA HS Assay Kit for Qubit®

                                           ——5min準(zhǔn)確定量結(jié)果

dsDNA Assay Kit for Qubit®Yeasen生物開發(fā)的專門用于Qubit®熒光儀或熒光酶標(biāo)儀的試劑盒,,線性范圍0.2-100 ng,,即使在存在ssDNARNA和單體核苷酸的條件下,,也可以選擇性的檢測dsDNA,,且耐受較高濃度的蛋白質(zhì)、鹽類,、洗滌劑等污染物,。

簡便:實(shí)驗(yàn)操作簡單,5min之內(nèi)出結(jié)果,;

靈敏: 0.2-100ng的樣本,,都能準(zhǔn)確定量;

準(zhǔn)確:競品同比誤差小,,均控制在10%以內(nèi)批間差異?。?/span>

穩(wěn)定:不同生產(chǎn)批次之間無差異,。


訂購信息

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品編號

規(guī)格

價格(元)

dsDNA HS Assay Kit for Qubit®

12640ES60/76

100/500 T

686/2696


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