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HTR8-SVneo細(xì)胞株

時(shí)間:2016-4-26閱讀:2278

產(chǎn)品標(biāo)題:HTR8-SVneo細(xì)胞株

關(guān)鍵詞:HTR8-SVneo細(xì)胞,,HTR8-SVneo細(xì)胞培養(yǎng),,HTR8-SVneo細(xì)胞形態(tài),HTR8-SVneo細(xì)胞價(jià)格

簡(jiǎn)介:全國(guó)統(tǒng)一價(jià)格,,全國(guó)各地均可發(fā)貨

lncRNA 的研究已經(jīng)在世界范圍內(nèi)變得越愛越熱門,,通過這些年的研究,lncRNA的機(jī)制研究也形成了一定的套路:

1)高通量分析lncRNA的表達(dá),;

2)驗(yàn)證高通量篩選后的結(jié)果,;

3)研究lncRNA與蛋白之間的相互作用。

接下來的文章中,,慧穎生物會(huì)和大家一起討論lncRNA機(jī)制研究中常用的方法,,歡迎小伙伴們積極參與討論。

(一)高通量分析lncRNA 的表達(dá)

隨著lncRNA研究的不斷深入,,現(xiàn)在已經(jīng)有了很多很成熟的lncRNA芯片產(chǎn)品,,可供選擇。另外二代測(cè)序的興起,,也使得RNA-seq成為分析lncRNA表達(dá)譜的有效手段,。當(dāng)然從費(fèi)用的角度講,lncRNA 的芯片更便宜,,二代測(cè)序RNA-seq的成本更高,。不過土豪請(qǐng)隨意!

應(yīng)用lncRNA芯片或者RNA-seq進(jìn)行l(wèi)ncRNA表達(dá)譜分析的研究已經(jīng)有了很多,。例如,,Orom等人在人類的細(xì)胞系中通過lncRNA的芯片篩選,鑒定了3019條lncRNA的表達(dá)分布,。另外,,Ng等通過定制化的lncRNA芯片(customized microarray)研究了人胚胎干細(xì)胞(human embryonic stem cell,hESCs)內(nèi)的lncRNA表達(dá)譜(expression profile),。他們發(fā)現(xiàn)有一些胚胎干細(xì)胞特異性的lncRNA對(duì)于維持干細(xì)胞的多能性(pluripotency)有非常重要的作用。在腫瘤研究(乳腺癌,、胰腺癌,、肝癌等)中,,lncRNA芯片的應(yīng)用也是非常地廣泛。

相對(duì)于lncRNA芯片在表達(dá)譜研究方面的廣泛應(yīng)用,,RNA-seq方法的應(yīng)用領(lǐng)域則明顯地不同,。RNA-seq 主要用于研究轉(zhuǎn)錄組。應(yīng)用該方法,,獲得的結(jié)果受到的干擾信號(hào)(background signal)比較低,,更重要的是,通過RNA-seq有可能獲得全新的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(當(dāng)然包括lncRNA在內(nèi),,但是不局限于lncRNA,。例如在腫瘤研究中,常用RNA-seq去發(fā)現(xiàn)新的融合基因,。利用RNA-seq技術(shù),,研究人員發(fā)現(xiàn)某些lncRNA分子在神經(jīng)精神疾病(neuropsychiatric disorder)中發(fā)揮重要作用,。另有研究者通過RNA-seq技術(shù),,分析了肝細(xì)胞癌(HCC)中的整個(gè)轉(zhuǎn)錄組,當(dāng)然也包括了lncRNA,。

(二)對(duì)于高通量數(shù)據(jù)的驗(yàn)證

常用的驗(yàn)證高通量數(shù)據(jù)的實(shí)驗(yàn)手段有:Northern blot,、qRT-PCR、FISH及RNAi 等方式,。

目前zui為常用的檢測(cè)lncRNA表達(dá)的手段是qRT-PCR,,它的操作簡(jiǎn)單,自動(dòng)化程度高,,在實(shí)驗(yàn)室普遍使用,。FISH的實(shí)驗(yàn)方法,使用的實(shí)驗(yàn)室就相對(duì)較少,。FISH和Northern 類似的地方是,,它同樣是基于分子雜交的原理。使用FISH的一大優(yōu)勢(shì)是,,它不僅可以表征lncRNA表達(dá)量的多少,,更可以直觀地告訴研究者lncRNA在亞細(xì)胞/組織中的定位。

研究者成功地使用該方法研究了多條lncRNA,,包括Xist,、MALAT1、MENε/β和Kcnq1ot1等,。RNAi是另一種廣泛使用的實(shí)驗(yàn)手段,,在細(xì)胞中特異性地敲減lncRNA,是檢測(cè)lncRNA功能時(shí),,zui常用的實(shí)驗(yàn)方法,。例如,,HOTAIR的5'區(qū)域和3'區(qū)域可以分別結(jié)合PRC2和LSD1,并起到一個(gè)腳手架(Scaffold)的作用,。研究者通過RNAi的方式,,敲減細(xì)胞內(nèi)源性HOTAIR分子,證實(shí)了該分子在結(jié)構(gòu)上的作用和功能,。需要注意的是,,以上的多種方法可以相互結(jié)合,以驗(yàn)證篩選獲得的lncRNA的表達(dá)及其可能發(fā)揮的功能,。

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