1) 購買的限制性內(nèi)切酶帶有兩種不同的酶切緩沖液,,該用哪一種,? 每種限制性內(nèi)切酶帶有一管酶的zui適反應(yīng)液(通常是一種4-CORE反應(yīng)液),可能還帶有一只MULTI-CORE反應(yīng)液。 |
|
2) 4-CORE酶切緩沖液體系是什么,? 大多數(shù)(大約75%)Promega公司的限制性內(nèi)切酶有一種zui適酶切緩沖液,即4-CORE酶切緩沖液,,分別叫作A,、B、C和D,。其余的25%的限制性內(nèi)切酶帶有一種特定的酶切緩沖液(酶切緩沖液E-L),。每一種限制性內(nèi)切酶帶有一只zui適酶切緩沖液。 |
|
3) MULTI--CORE酶切緩沖液體系是什么,? MULTI--CORE酶切緩沖液適用于雙酶切,。每一種Promega公司的限制性內(nèi)切酶都測試了在MULTI--CORE酶切緩沖液中的活力,如果酶切活力達(dá)25%,就提供一只MULTI--CORE酶切緩沖液,。作雙酶切時(shí),,如果兩個(gè)酶在MULTI--CORE酶切緩沖液中的活力達(dá)到50-100%,就可替代A-L酶切緩沖液,。應(yīng)選用酶活力zui高的酶切緩沖液,。 |
|
4) 如何保存限制性內(nèi)切酶? 不太常用的限制性內(nèi)切酶多保存在-70oC,每周或每天用的酶保存在-20oC,。有一些酶需要不同的保存條件,。每一種Promega公司的限制性內(nèi)切酶都提供一份分析說明以供查訊。使用限制性內(nèi)切酶時(shí),,應(yīng)將酶保存在冰上,。 |
|
5) 一般的限制性內(nèi)切酶反應(yīng)中(也叫消化),應(yīng)用多少內(nèi)切酶,? 所用的酶量取決于DNA的純度,、量和型態(tài)。限制性內(nèi)切酶的活力單位定義為在適當(dāng)?shù)臏囟认?,?小時(shí)內(nèi),,1ugDNA在50ul體積中,被*消化所需的限制性內(nèi)切酶的量,。一般說來,,線性DNA比超螺旋DNA更易消化。比如,,酶切1uglambdaDNA,,需要1-2單位的酶,而酶切1ug質(zhì)粒DNA,,需要3-5單位的酶,。 |
|
6) 使用限制性內(nèi)切酶的一般步驟是什么? 一般步驟如下: A)測試酶切DNA的量 B)計(jì)算*酶切所需的酶量,。為使終體積中甘油的濃度低于8%,,計(jì)算能加的酶量,zui多能加終體積的10%(甘油的濃度為5%),。 C)10X反應(yīng)液的體積應(yīng)為終體積的1/10,;10X反應(yīng)液的體積不應(yīng)小于酶的體積。 D)加入計(jì)算好的DNA,,10X反應(yīng)液,,酶。 加入水到終體積(20-50 ul),,輕輕混勻,,在適當(dāng)?shù)臏囟认卤?。一般酶的zui適溫度為37 oC,但有例外,。應(yīng)查訊分析說明,。 比如: 質(zhì)粒DNA (2ug/ ul) 5 ul 10X反應(yīng)液 5 ul 酶(5ug/ ul) 5 ul dH2O 35 ul 50 ul 37 oC保溫2-3小時(shí)。 應(yīng)zui后加酶,。 |
|
7) 一次使用兩個(gè)限制性內(nèi)切酶的一般步驟是什么(比如雙酶切),? 一次使用兩個(gè)限制性內(nèi)切酶的一般步驟,如同使用一個(gè)限制性內(nèi)切酶的一般步驟,。但要注意兩個(gè)限制性內(nèi)切酶在同一種緩沖液中都要有活力,。甘油的濃度不應(yīng)超過終體積的8%。應(yīng)注意有些酶對末端敏感,,活力差,。 |
|
8) 能否在一次反應(yīng)中用很多的限制性內(nèi)切酶? 可以,,一般而言,,甘油濃度超過8%對酶切有抑制。有些酶在高的甘油濃度中會(huì)產(chǎn)生星活力,。限制性內(nèi)切酶提供在50%的甘油中,,故10 ul反應(yīng)體積中不應(yīng)加入超過1.6 ul的酶。 |
|
9) 消化反應(yīng)中是否需要加牛血清白蛋白(BSA),? 不需要,。酶切不需要加BSA。但Promega公司的限制性內(nèi)切酶活力測定時(shí),,均加入乙?;腂SA達(dá)0.1mg/ml,。BSA可以提高許多限制性內(nèi)切酶活力,。Promega公司的限制性內(nèi)切酶均提供一管乙酰化的BSA(R396D,,E,,F(xiàn)),并建議酶切時(shí)加入BSA達(dá)0.1mg/ml,。 |
|
10) 星活力是什么,? 星活力是指在保溫條件改變,如NaCl過多存在于反應(yīng)液中,,使酶切的核酸序列不同于它特定的識(shí)別序列,。 |
|
11) 什么是同切酶? 同切酶指兩個(gè)酶的識(shí)別位點(diǎn)和酶切位點(diǎn)相同,,如 Sph I(CGTAC'G)和 Bbu I(CGTAC'G)互為同切酶,。 |
|
12) 什么是neoschizomer? Neoschizomer指兩個(gè)酶的識(shí)別序列相同,但酶切位點(diǎn)不同,,如 Sma I(GGG'CCC)和 Xma I(G'GGCCC)互為neoschizomer,。 |
|
13) 基因組規(guī)格指的是什么? 基因組規(guī)格的酶適用于酶切包裹在瓊脂中的基因組DNA,。另外,,染色體DNA的制備、酶切和凝膠分離的條件對基因組規(guī)格的酶作了優(yōu)化,。 |
|
14) 如果一個(gè)限制性內(nèi)切酶不是基因組規(guī)格,,是否表明它不能用于處理染色體DNA? 不一定,。如果一個(gè)限制性內(nèi)切酶不是基因組規(guī)格,Promega公司沒有測試它能否處理包裹的基因組DNA,。因此需作一些測試來決定酶是否會(huì)切割底物。 |
|
15) 需要用多少單位的限制性內(nèi)切酶對瓊脂包裹的染色體DNA進(jìn)行酶切,? 切割包裹的DNA比普通底物需要更多的酶,,一般需要多2倍。 |
|
16) 什么是藍(lán)/白克隆測試,? 藍(lán)/白克隆測試是一種確定酶切樣品中,,存在的少量外切核酸酶活力的質(zhì)量檢查過程。通過測定一個(gè)功能基因(Beta-半乳糖苷酶)酶切和重新連接后,,藍(lán)/白斑的比例,,來確定外切核酸酶活力。如果存在少量外切核酸酶活力,,或不存在外切核酸酶活力,,得到的是藍(lán)色菌落。產(chǎn)生粘性末端的酶實(shí)驗(yàn)產(chǎn)生的白色菌落應(yīng)小于2%,,而產(chǎn)生平頭末端的酶實(shí)驗(yàn)產(chǎn)生的白色菌落應(yīng)小于5%,。這個(gè)方法的靈敏度很高,可以檢測出缺失一個(gè)堿基的酶切末端,。 |
|
17) 限制性內(nèi)切酶是如何命名的,? 限制性內(nèi)切酶命名的次序如下: A) 用3個(gè)字母代表來源的生物(如 Bam 代表 Bacillus amyloliquefaciens ) B) 1個(gè)字母或阿拉伯?dāng)?shù)字代表菌株( Bam H) C) 1個(gè)羅馬字母代表發(fā)現(xiàn)或鑒定的次序( Bam HI) |
|
18) 如何稀釋限制性內(nèi)切酶? 如果1小時(shí)內(nèi)會(huì)使用限制性內(nèi)切酶,,可用補(bǔ)充有0.5mg/ml BSA的1X反應(yīng)液稀釋,,如果在更長的時(shí)間內(nèi)才會(huì)使用限制性內(nèi)切酶,用酶貯存液稀釋,。 |
|
19) 如何查訊一種限制性內(nèi)切酶在特定條件下活力的資料,? 請查尋 Restriction Enzyme Properties 。 |