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結(jié)合QCL紅外技術(shù)的多模態(tài)質(zhì)譜成像解決方案

時(shí)間:2024-8-5 閱讀:409
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空間組學(xué)技術(shù)(Spatial-Omics)是近年來興起的一種新型分析策略,,自其誕生以來,,備受關(guān)注,。隨著其熱度的升高,, 2022年的《Nature》雜志將空間組學(xué)技術(shù)列為“關(guān)注的七大技術(shù)"之一,進(jìn)一步凸顯出其在學(xué)術(shù)界的地位和受認(rèn)可度,。在空間組學(xué)概念的加持之下,,逐漸形成了以質(zhì)譜成像技術(shù)為核心的空間組學(xué)實(shí)驗(yàn)方案。

順應(yīng)空間組學(xué)發(fā)展的新趨勢(shì),,布魯克推出了空間組學(xué)質(zhì)譜儀 – timsTOF fleX,,它同時(shí)具備MALDI質(zhì)譜成像功能和基于LC-MS/MS的4D-組學(xué)分析功能,可在一臺(tái)儀器上同時(shí)實(shí)現(xiàn)空間組學(xué)工作流程所需的兩大核心步驟,。這臺(tái)儀器還可以搭配一系列的選配功能模塊,,如MALDI-2、microGRID等,,可以進(jìn)一步提升其分析維度和分析精度,。

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圖1. 布魯克timsTOF fleX空間組學(xué)質(zhì)譜儀


MALDI-2 技術(shù)

MALDI-2 是布魯克推出的、可商業(yè)化的二次離子電離技術(shù),。首先進(jìn)行常規(guī)MALDI離子化,,之后用第二束激光照射未電離的中性分子、以促使其進(jìn)一步發(fā)生電離,,從而有效地提高了離子化效率,。與傳統(tǒng)MALDI技術(shù)相比,MALDI-2使生物分子的檢測(cè)靈敏度呈現(xiàn)1-3個(gè)數(shù)量級(jí)的提升,。MALDI-2技術(shù)有效地拓展了原位質(zhì)譜技術(shù)可覆蓋化合物的類型,,提升了timsTOF fleX質(zhì)譜成像的分析維度和覆蓋深度。

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圖2. 布魯克MALDI-2激光后電離技術(shù)


microGRID 技術(shù)

在進(jìn)行高空間分辨質(zhì)譜成像實(shí)驗(yàn)時(shí),,由于采樣面積的急劇縮小,,激光束的移動(dòng)精度對(duì)于最終成像熱圖的分辨精度有著舉足輕重的影響。布魯克的microGRID技術(shù)可將MALDI平臺(tái)的移動(dòng)精度提高到亞微米級(jí),,對(duì)激光束在在組織表面5-25 μm格柵的定位做實(shí)時(shí)校準(zhǔn),,有效地消除了質(zhì)譜成像熱圖中常出現(xiàn)的條帶狀痕跡(stripping)、過度采樣(oversampling),、偽影(artifact)等問題,,極大地改善了成像熱圖的分辨精度。

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圖3. 布魯克microGRID選配模塊


結(jié)合QCL紅外技術(shù)多模態(tài)質(zhì)譜成像實(shí)驗(yàn)方案

針對(duì)高空間分辨成像實(shí)驗(yàn)中整體工作效率偏低這一問題,,布魯克于今年推出了“結(jié)合QCL紅外技術(shù)的多模態(tài)質(zhì)譜成像實(shí)驗(yàn)方案",,它以QCL(量子聯(lián)機(jī)激光器)紅外成像技術(shù)為先導(dǎo),以超快的成像采集速度,、對(duì)大塊的組織切片進(jìn)行高分辨的紅外成像采集,,之后依據(jù)組織中分子的紅外吸收譜峰特征做空間聚類分析,,找出感興趣的目標(biāo)區(qū)域,再針對(duì)該區(qū)域進(jìn)行高分辨的MALDI質(zhì)譜成像數(shù)據(jù)采集,,有效地減少了冗余數(shù)據(jù)的采集,極大地提升了亞細(xì)胞分辨成像實(shí)驗(yàn)的整體工作效率,。

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圖4. 多模態(tài)成像方案的工作流程

圖5展示的是利用“結(jié)合QCL紅外技術(shù)的多模態(tài)質(zhì)譜成像實(shí)驗(yàn)方案",、對(duì)胰腺癌腫瘤移植模型小鼠的胰腺組織的分析流程和實(shí)驗(yàn)結(jié)果。整塊胰腺組織切片的大小約為2.4cm×1cm,,若將其劃分為5µm×5µm的采樣格柵,,所對(duì)應(yīng)的像素點(diǎn)超過1000萬個(gè)。面對(duì)這樣龐大的成像采集任務(wù),,QCL紅外技術(shù)僅需21分鐘即可完成整塊組織切片的數(shù)據(jù)采集,。此外,基于QCL紅外譜峰的segmentation(空間區(qū)域分割)可提供精準(zhǔn)的病理區(qū)域邊界信息,。結(jié)合該信息,,再利用timsTOF fleX進(jìn)行7µm空間分辨率的質(zhì)譜成像數(shù)據(jù)采集,實(shí)現(xiàn)了從病理區(qū)域到特征性標(biāo)志物的分子信息挖掘,。

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圖5. 胰腺癌腫瘤移植模型小鼠的多模態(tài)成像分析案例

布魯克的timsTOF fleX質(zhì)譜儀以其綜合性的功能集成及優(yōu)異分析性能,,已成為空間組學(xué)研究領(lǐng)域重要的研究工具。選配模塊MALDI-2和microGRID的引入,,將空間組學(xué)的分辨精度向亞細(xì)胞乃至細(xì)胞水平進(jìn)一步推進(jìn),。為了改善高空間分辨實(shí)驗(yàn)中工作時(shí)長(zhǎng)過長(zhǎng)的問題,布魯克于今年推出了“結(jié)合QCL紅外技術(shù)的多模態(tài)質(zhì)譜成像方案",,通過將紅外成像與質(zhì)譜成像聯(lián)合使用,,兩者優(yōu)勢(shì)互補(bǔ),一方面提高了高分辨實(shí)驗(yàn)的整體工作效率,;另一方面,,將多個(gè)模態(tài) (維度) 的數(shù)據(jù)有機(jī)地整合在一起、做協(xié)同分析,,為深入探討科學(xué)議題背后的生物學(xué)意義奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ),。


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