熒光顯微鏡用于研究細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)的吸收,、運(yùn)輸,、化學(xué)物質(zhì)的分布及定位等。 對(duì)被檢物體來(lái)說(shuō),，熒光產(chǎn)生方式有兩種：自發(fā)熒光,，經(jīng)過(guò)紫外照射直接發(fā)出熒光；繼發(fā)熒光,，被觀察物體經(jīng)過(guò)熒光染料處理之后,，經(jīng)過(guò)紫外光照射才能發(fā)出熒光。 細(xì)胞中有些物質(zhì),，如葉綠素等,，受紫外線照射后產(chǎn)生自發(fā)熒光；另有一些物質(zhì)本身雖不能發(fā)熒光,，但如果用熒光染料或熒光抗體染色后,，經(jīng)紫外線照射亦可發(fā)出繼發(fā)熒光。 熒光顯微鏡利用一個(gè)高發(fā)光效率的點(diǎn)光源,，經(jīng)過(guò)濾色系統(tǒng)發(fā)出一定波長(zhǎng)的光（紫外光365nm或紫藍(lán)光420nm）作為激發(fā)光,、激發(fā)標(biāo)本內(nèi)的熒光物質(zhì)發(fā)射出各種不同顏色的熒光后，再通過(guò)物鏡和目鏡的放大進(jìn)行觀察,。 這樣在強(qiáng)烈的對(duì)襯背景下，即使熒光很微弱也易辨認(rèn),，敏感性高,，主要用于細(xì)胞結(jié)構(gòu)和功能以及化學(xué)成分等的研究。

熒光顯微鏡分為透射式和落射式兩類,，前者較為原始,，后者較為*。 兩類熒光顯微鏡的基本構(gòu)建相似,，主要區(qū)別為：透射式的激發(fā)光透過(guò)標(biāo)本,，標(biāo)本整體產(chǎn)生熒光，熒光再進(jìn)入物鏡,，放大倍數(shù)越高,，熒光越弱,；落射式的激發(fā)光投射在標(biāo)本表面，標(biāo)本表面產(chǎn)生熒光,，熒光再進(jìn)入物鏡,，放大倍數(shù)越高，熒光越強(qiáng),，適于進(jìn)行高倍觀察,。 熒光顯微鏡主要構(gòu)件有汞燈光源、激發(fā)濾板,、分色鏡（落射式）,、壓制濾板、暗場(chǎng)聚光鏡（透射式）等,。此外,，由于汞燈發(fā)熱嚴(yán)重，大多還裝有吸熱濾鏡,。 部分熒光顯微鏡還有相差物鏡和環(huán)狀光闌,，因此可以進(jìn)行相差觀察。 還有的熒光顯微鏡采取倒置構(gòu)架,，又是倒置顯微鏡,，等等。

此外,，上述顯微鏡都可以通過(guò)安裝CCD組裝成數(shù)碼顯微鏡,，它是將顯微鏡看到的實(shí)物圖像通過(guò)數(shù)模轉(zhuǎn)換，使其成像在計(jì)算機(jī)上,。 從而,，我們可以對(duì)微觀領(lǐng)域的研究從傳統(tǒng)的普通的雙眼觀察到通過(guò)顯示器上再現(xiàn)，從而提高了工作效率,。