目前多用瓊脂糖為電泳支持物進(jìn)行平板電泳,，其優(yōu)點(diǎn)如下。

（1）瓊脂糖凝膠電泳操作簡(jiǎn)單,，電泳速度快,，樣品不需事先處理就可以進(jìn)行電泳。

（2）瓊脂糖凝膠結(jié)構(gòu)均勻,，含水量大（約占98%~99%）,，近似自由電泳，樣品擴(kuò)散較自由電流,，對(duì)樣品吸附極微,，因此電泳圖譜清晰,，分辨率高，重復(fù)性好,。

（3）瓊脂糖透明無(wú)紫外吸收,，電泳過(guò)程和結(jié)果可直接用紫外光燈檢測(cè)及定量測(cè)定。

（4）電泳后區(qū)帶易染色,，樣品極易洗脫,，便于定量測(cè)定。制成干膜可長(zhǎng)期保存,。

目前,，常用瓊脂糖作為電泳支持物，分離蛋白質(zhì)和同工酶,。將瓊脂糖電泳與免疫化學(xué)相結(jié)合,，發(fā)展成免疫電泳技術(shù)，能鑒別其他方法不能鑒別的復(fù)雜體系,，由于建立了超微量技術(shù),，0.1ug蛋白質(zhì)就可檢出。
瓊脂糖凝膠電泳也常用于分離,、鑒定核酸,，如DNA鑒定，DNA限制性內(nèi)切核酸酶圖譜制作等,。