LncRNA芯片定制檢測服務(wù)
實驗技術(shù)簡介:長鏈非編碼RNA (long non-coding RNA, IncRNA) 是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200nt,、 不編碼蛋白的RNA。IncRNA起初被認為是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”,,不具有生物學(xué)功能,。然而,近年來的研究表明IncRNA能在表觀遺傳,、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào)控基因表達,,參與了X染色體沉默、基因組印記以及染色質(zhì)修飾,、轉(zhuǎn)錄激活,、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運輸?shù)榷喾N重要的調(diào)控過程,,與人類疾病的發(fā)生,、發(fā)展和防治都有著密切聯(lián)系。
雖然越來越多的IncRNA被發(fā)現(xiàn),,但是人們現(xiàn)在了解到的IncRNA只是冰山一角,,絕大部分的IncRNA的功能仍然是不清楚的,。目前主要通過IncRNA芯片或新-代測序等方法對IncRNA進行功能研究。 現(xiàn)階段,,基因芯片技術(shù)發(fā)展趨于成熟穩(wěn)定,,在此平臺上,通過設(shè)計不同的IncRNA探針,,可以更加快速,、高通量地篩選出疾病或特定生物學(xué)過程中差異表達的IncRNA和mRNA信息,終找到IncRNA的靶基因 位點深入分析調(diào)控機制,。
實驗操作流程:
1,、樣品RNA抽屜、質(zhì)檢
2,、cDNA/aRNA樣品合成和標記
3,、芯片雜交
4、洗滌,、染色,、掃描
5、圖像采集和數(shù)據(jù)分析
IncRNA芯片數(shù)據(jù)- -IncRNA差異 表達基因的篩選一對IncRNA重新注釋mRNA差異表達基因的篩選-→G0分析,,pathway分析IncRNA與mRNA共表達分析
客戶提供:
1,、實驗對象為組織樣品,取適量(50-100mg) 新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品,,使用
BioPulverizerTM冰凍粉碎組織,,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (Invitrogen),使用Mini-Bead-Beater-16勻漿后抽提RNA,。
2,、實驗對象為細胞樣品,每份樣品取1x106 ~ 1x107細胞,,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (樣品為貼壁細胞,,每10cm2培養(yǎng)皿TRIzo使用量為1m),裂解后抽提RNA,。
交付標準:
1,、芯片檢測數(shù)據(jù)
2、完整的實驗操作規(guī)程,、實驗報告 (含軟件分析結(jié)果)以及實驗材料
實驗代做服務(wù):
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