RNA純化及獲得
純化要求
RNA樣品中不應(yīng)存在對(duì)酶(如逆轉(zhuǎn)錄酶)有抑制作用的有機(jī)溶劑和過(guò)
高濃度的金屬離子,。避免其它生物大分子如蛋白質(zhì)、多糖和脂類(lèi)分
子的污染,。排除DNA分子的污染,。
純化方法及沉淀
1、有機(jī)溶劑抽提法
氯仿抽提:在使用RNA提取試劑進(jìn)行RNA提取時(shí),,常使用氯仿進(jìn)行
抽提,,以去除蔗糖、蛋白等雜質(zhì),,并促進(jìn)水相與有機(jī)相的分離,,從
而達(dá)到純化RNA的目的。
沉淀:氯仿抽提RNA后,,一般采用異丙醇或乙醇來(lái)沉淀水相RNA,。
加入0.6倍水相體積的異丙醇或與水相等體積的異丙醇,室溫沉淀
20-30分鐘,,高速離心,,可獲得RNA沉淀,。
洗滌沉淀:加入無(wú)RNase的75%乙醇,將RNA沉淀振蕩懸浮,,使
RNA沉淀中的鹽離子被充分溶解,。然后再離心10-30分鐘,再次沉淀
RNA,。離心后,,小心倒掉上清(注意不要倒出RNA沉淀),隨后快速離
心1-2秒,,將殘留在管壁上的乙醇收集到管底后,,用小槍頭吸凈,超
凈臺(tái)中風(fēng)干1-2分鐘(注意不要晾得太干,,否則RNA沉淀不易溶解),。
溶解沉淀:加入適量的RNase-free ddH2O溶解RNA沉淀,。
2,、硅基質(zhì)吸附法
隨著實(shí)驗(yàn)方法的改進(jìn),現(xiàn)已發(fā)展出一種采用吸附材料純化核酸的
方法,。目前較常見(jiàn)的有:硅基質(zhì)吸附材料,、陰離子交換樹(shù)脂和磁
珠等。硅基質(zhì)吸附材料因其具有可特異吸附核酸,,使用方便,、快
捷,不使用有毒溶劑如苯酚,、氯仿等優(yōu)點(diǎn),,成為核酸純化的。
Solarbio公司總RNA提取試劑盒就是采用硅基質(zhì)吸附達(dá)到RNA分離
純化目的,。通過(guò)專(zhuān)一結(jié)合RNA的離心吸附柱和*的緩沖液系統(tǒng),,
使樣品在高鹽條件下與硅膠膜特異結(jié)合,而蛋白,、有機(jī)溶劑等雜質(zhì)
不能結(jié)合到膜上而被洗脫,,鹽類(lèi)則被含有乙醇的漂洗液洗滌,后
用RNase-free ddH2O將RNA從硅膠膜上洗脫下來(lái),。
一些特殊組織的RNA提取
纖維組織:心臟/骨骼肌等纖維組織提取RNA的關(guān)鍵在于*破碎
組織,。這些組織細(xì)胞密度低,單位重量的組織中RNA含量較低,,建
議增加起始量,。此外,一定要在液氮中將組織*磨碎,。
蛋白/脂肪含量高的組織:腦或植物脂肪含量高,,酚/氯仿抽提后,,
上清含白色絮狀物。必須用氯仿再次對(duì)上清進(jìn)行抽提,。
核酸RNase含量高的組織:脾,、胸腺等組織的核酸和RNase含量很
高。在液氮中研磨,,再快速勻漿,,能有效滅活RNase,如加入裂解
液后過(guò)于粘稠,,酚/氯仿抽提不能有效分層,,則加入更多裂解液可
以解決此問(wèn)題。多次酚/氯仿抽提可以去除更多殘留的DNA,。如果
加入乙醇后馬上有白色沉淀形成,,表明可能有DNA污染,可以在
核酸溶解后用酸性酚/氯仿再次抽提或者用DNaseI消化,,去除DNA
污染,,植物組織和真菌組織:植物組織和真菌組織比動(dòng)物組織更為
復(fù)雜,一般選擇在液氮條件下對(duì)樣品進(jìn)行研磨,,以避免內(nèi)源RNase
降解RNA,。如果RNA降解問(wèn)題不能解決,大多數(shù)情況下是樣品中含
有的雜質(zhì)所致,。許多植物和真菌中所含雜質(zhì)如多糖,、多酚等都會(huì)殘
留,因?yàn)檫@些雜質(zhì)分子與RNA有一些相似性,,可與RNA同時(shí)沉淀或
者吸附,,因此在植物和真菌組織的提取中,需要用一些特別的步驟
或者特別的試劑來(lái)去除多糖多酚等雜質(zhì)的干擾和污染,。
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