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核酸提取純化和濃縮方法應該選_______

時間:2024/1/5閱讀:371
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20世紀誕生以來,分子生物學迅速發(fā)展并在整個生命科學領(lǐng)域廣泛滲透和應用,推動了傳統(tǒng)醫(yī)學進入基于分子層面實驗科學的現(xiàn)代生物醫(yī)學時代,。

核酸提取和純化是分子生物學試驗的基礎(chǔ),,在以下應用實驗中都需要進行核酸提取:

● 分析基礎(chǔ)研究和疾病研究中的基因表達,;

● 跟蹤對藥物治療的反應(例如,,在抗病毒治療期間和之后監(jiān)測病毒滴度);

● 識別新物種并深入了解進化過程 (例如,,Ancient DNA分析),;

● 對人類、動物和植物中引起傳染病暴發(fā)的病原體進行監(jiān)測和分類,;

● 通過微生物檢測和量化監(jiān)測食品和水安全,;

● 診斷疾病 (如基因疾病,癌癥,,免疫學缺陷),。

核酸提取純化基本步驟

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核酸純化方法是影響提取核酸質(zhì)量高低的最重要因素之一,,也是下游分子生物學試驗成敗的關(guān)鍵,遵循提取純化原則以及選擇合適的純化,、濃縮方法,,可以使核酸的質(zhì)量及回收率達到較大。

核酸提取純化原則和要求

● 需要保證核酸一級結(jié)構(gòu)的完整性,,為下游實驗做準備,;

● 排除其它核酸分子的污染(提取DNA時排除RNA的干擾,反之亦然),;

● 核酸樣品中沒有對酶有抑制作用的有機溶劑和高濃度的金屬離子,;

● 將核酸樣品中其它生物大分子如蛋白質(zhì)、多糖和脂類分子的污染降到較低程度,。


核酸提取純化的常見方法

溶液抽提法

經(jīng)典的DNA提取方法:酚氯仿抽法,,主要是使用兩種不同的有機溶劑交替抽提將蛋白去除。通過苯酚氯仿處理細胞破碎液或者組織勻漿后,,在水相中主要溶解的是以DNA為主的核酸成分,,在有機相中主要是多糖和脂類物質(zhì),蛋白質(zhì)則沉淀于兩相之間,。離心分層后取出水層,,多次重復操作,再合并含核酸的水相,,利用核酸不溶于醇的性質(zhì),,用乙醇沉淀核酸,之后再離心分離和溶解洗脫,,最后通過將洗滌后的核酸沉淀進行濃縮干燥即可得到高純度核酸,。


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離心柱法(柱膜法)

通過特殊硅基質(zhì)吸附材料,能夠特定吸附DNA,,而RNA和蛋白質(zhì)順利通過,。硅膠膜表面的硅醇基團呈弱酸性,其水化后帶負電,。當溶液中存在一定濃度的陽離子后,,形成的陽離子橋能夠中和DNA和硅醇基團之間的表面負電荷,從而使DNA牢固地吸附在硅膠膜表面,。反之,,處于低鹽水溶液狀態(tài)下時,由于硅膠膜的硅醇基團與DNA磷酸基團之間的靜電排斥,,硅膠膜釋放DNA,。


利用高鹽低PH結(jié)合核酸,低鹽高PH值洗脫,,來分離純化核酸,。離心柱純化也是試劑盒提取中廣泛的使用方法,。


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磁珠法

運用納米技術(shù)對超順磁性納米顆粒的表面進行改良和表面修飾后,該磁珠能在微觀界面上與核酸分子特異性地識別和高效結(jié)合,。磁珠法利用了磁性顆?;钚曰鶊F在一定條件下可與核酸結(jié)合和解離的原理,先使用細胞裂解液裂解細胞,,帶有活性基團的磁性顆??商禺愋晕綇募毎杏坞x出來的核酸分子,而樣品中的其他干擾物則很好的移除了,,在磁場作用下,,磁性顆粒與液體分開完成,最后回收顆粒(即磁珠-DNA 混合物),,再用洗脫液洗脫,,純化濃縮后即可得到純凈的DNA,獲得質(zhì)量較高的核酸模板,。


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提取純化方法的選擇

一般地,,分離純化步驟越多,核酸的純度也越高,,但得率會逐漸下降,完整性也愈難以保證,。相反,,通過分離純化步驟少的實驗方案,我們可以得到比較多的完整性較好的核酸分子,,但純度不一定很高,。這需要結(jié)合核酸的用途而加以選擇。


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如果對核酸提取的質(zhì)量要求不高,,可以選擇經(jīng)濟實惠的溶液法,,選擇柱膜法還是磁珠法自動化提取,基本上取決于樣本數(shù)量,,針對大批量的樣本,,優(yōu)選磁珠法自動化提取。如果對樣本數(shù)量較少,,則可以選擇柱膜法,,既快速又經(jīng)濟實用。對于Oligo寡核苷酸的純化,,實驗要求更高,。

不管采用哪一種核酸提取純化方法最后都離不開濃縮干燥!

● 再濃縮核酸樣品,,隨著核酸提取試劑的逐步加入,,以及去除污染物過程中核酸分子不可避免的丟失,,樣品中核酸的濃度會逐漸下降,甚至影響到后面的實驗操作或不能滿足后繼研究與應用的需要時,,需要對核酸進行濃縮,,可將150uL DNA水溶液濃縮至10uL再進行測序;

● 去除DNA樣品中醇的殘留,,當DNA樣品中有乙醇的殘留會影響測序反應,;

● 干燥DNA樣品。DNA沉淀后可能會含水或水/乙醇混合液,,濃縮去除后可以得到干燥的DNA樣品,。


常用的干燥方法:風干VS真空離心濃縮儀應用案例分享

WTCHG(牛津大學人類遺傳學威康信托中心) 使用Sequenom MassARRAY®SNP 基因分型系統(tǒng)用于SNP分析,樣品前制備過程分別使用風干(左)和Genevac EZ-2真空離心濃縮儀(右)干燥含有寡核苷酸樣品的384孔板,。


下圖結(jié)果表明,,使用EZ-2真空離心濃縮儀干燥寡核苷酸樣品,可以大大降低樣品降解率,,保證樣品不會被污染,,消除了樣品損壞的潛在來源。

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深綠色-高樣本數(shù)據(jù)質(zhì)量

淺綠色-中等樣本數(shù)據(jù)質(zhì)量

紅色-樣品質(zhì)量差或無數(shù)據(jù)

使用真空離心濃縮儀,,可以避免核酸濃縮干燥遇到的過度加熱,、絕對干燥、交叉污染及紫外損害保證核酸樣品的完整性,。


Genevac真空離心濃縮儀

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濃縮干燥DNA樣本,,Genevac真空離心濃縮儀是合適的選擇,Genevac系統(tǒng)廣泛應用于DNA樣品制備與純化處理,,不論是處理PCR前的簡單的小體積濃度DNA pellets,,還是高通量處理許多純化DNA或寡核苷酸的樣品,都有不同的機型可供選擇,。

如果你對上述產(chǎn)品或方案感興趣,,歡迎隨時聯(lián)系Tegent德祥

Genevac

英國Genevac是德祥集團資深合作伙伴之一,。英國Genevac公司成立于1990年,,隸屬SP Scientific旗下,一直專注于研究和生產(chǎn)各種離心蒸發(fā)濃縮設備,,其產(chǎn)品廣泛應用于生命科學,、制藥、化學,、分析等領(lǐng)域,。

德祥科技

德祥科技有限公司成立于1992年,總部位于中國香港特別行政區(qū),,分別在越南,、廣州,、上海、北京設立分公司,。主要服務于大中華區(qū)和亞太地區(qū)——在亞太地區(qū)有27個辦事處和銷售網(wǎng)點,,5個維修中心和2個樣機實驗室。

30多年來,,德祥一直深耕于科學儀器行業(yè),,主營產(chǎn)品有實驗室分析儀器、工業(yè)檢測儀器及過程控制設備,,致力于為新老客戶提供更完善的解決方案,。公司業(yè)務包含儀器代理,維修售后,,實驗室咨詢與規(guī)劃,,CRO凍干工藝開發(fā)服務以及自主產(chǎn)品研發(fā)、生產(chǎn),、銷售,、售后。與高校,、科研院所,、政府機構(gòu)、檢驗機構(gòu)及企業(yè)保持密切合作,,服務客戶覆蓋制藥,、醫(yī)療、商業(yè)實驗室,、工業(yè)、環(huán)保,、石化,、食品飲料和電子等各個行業(yè)及領(lǐng)域。

20092021年間,,德祥先后榮獲了“年度最佳代理商“,、"年度最高銷售獎“等殊榮。我們始終秉承誠信經(jīng)營的理念,,致力于成為優(yōu)秀的科學儀器供應商,,為此我們從未停止前進的腳步。


我們始終相信,,每一天都在使這個世界變得更美好,!


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