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單克隆抗體從頭測序檢測技術服務詳情介紹
單克隆抗體分子在藥物研發(fā),、診斷試劑開發(fā)中扮演了關鍵的角色,??贵w分子本身的一級結構,特別是其CDR區(qū)域的氨基酸序列是發(fā)揮其生物學功能的核心,,對其完整序列準確快速的分析具有十分重要的意義,。例如對市場上已有的抗體產品直接進行序列分析是開發(fā)抗體藥物,抗體診斷試劑和其它抗體產品的捷徑,;許多商業(yè)可得的抗體對于藥物靶點有中和活性,,通過單抗序列測定得到該抗體的一級序列,可以以此為基礎可進行抗體親和力提升和人源化來開發(fā)抗體藥物,;在進行抗體仿制藥物研發(fā)過程中,,原研藥本身準確的一級結構信息是進行抗體仿制藥研發(fā)的基礎和前提。
百泰派克公司基于先進的高分辨率質譜儀Obitrap Fusion Lumos,,結合豐富的生物信息學分析經驗,,建立了全新一代抗體測序平臺,實現對抗體一級結構快速準確的分析,。該平臺適用于不同亞型抗體(例如IgG和IgM)和不同類型抗體(熒光偶聯抗體,,固定化抗體,不同物種的抗體)的序列分析,。

單克隆抗體從頭測序服務流程
單克隆抗體從頭測序服務優(yōu)勢:
1. 單抗輕重鏈肽段全序列覆蓋
在進行抗體序列測定過程中百泰派克會選擇5種不同的蛋白酶進行酶切,,利用不同酶切肽段之間的互補性實現抗體分子輕重鏈100%全序列的拼接。而對于抗體核心區(qū)域CDR序列在進行序列分析過程中要求至少被鑒定到10次,以此來充分保證測序結果的準確性(如下圖所示),。

單克隆抗體從頭測序2
2. 先進的數據處理算法
百泰派克基于發(fā)表在Nature Biotechnology和專業(yè)的蛋白組學雜志JPR上的文獻,,結合現有的專業(yè)進行抗體序列分析的軟件PEAKS Mass Spectrometry Software,開發(fā)了自己的質譜原始數據計算方法,,采用寬進窄出的原則,,在不遺漏任何有效數據信息的同時實現了抗體序列的準確鑒定。
3. 高精度和準確性
百泰派克在測序過程中會使用目前分辨率和高靈敏度Orbitrap Fusion Lumos質譜儀,;與老一代的質譜儀(例如Obitrap Elite,、Q Exactive等)相比,Lumos在提高了一級二級質譜掃描速度的同時保證肽段分子量的準確性,;一級質譜掃描速度的提高,,有助于同一個肽段可以更多次的被鑒定到,提高了結果的可信性,;二級質譜掃描速度的提高可以更好的進行片段碎裂(如下圖所示),,從而保證結果的準確性,并可以通過二級碎裂片段的特征峰實現Liangansuan和異Liangansuan的準確判定,。

單克隆抗體從頭測序3
4. 可對多種亞型和不同類型的抗體進行測序
我們建立的技術平臺不受小基團(如FITC,、Biotin、Alexa)的影響,,雖然較大的蛋白基團會給測序帶來難度,,但若提供較高濃度的蛋白仍可成功測序。
5. 嚴謹的序列預測和嚴格的序列驗證
我們對測序的結果會首先進行序列的預測,,標明抗體的CDR區(qū)域(如下圖所示),;同時,我們還會以測定的序列建立新的數據庫,,采用Sequence Confirmation的模式對采集到的質譜數據再次進行分析,,只有wán quán匹配的結果我們才會提供給客戶。

單克隆抗體從頭測序4
中/英文項目報告
在技術報告中,,百泰派克生物科技會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告,,報告包括:
1. 實驗步驟(中英文)
2. 相關的質譜參數(中英文)
3. 質譜圖片
4. 原始數據
5. 肽段序列信息
6. 抗體序列信息
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