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模塊式植物表型成像分析系統(tǒng)

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   北京易科泰生態(tài)技術有限公司成立于2002年,為中關村高新技術企業(yè),,致力于生態(tài)-農業(yè)-健康研究監(jiān)測技術推廣,、研發(fā)與服務,特別是在光譜成像技術(高光譜成像技術,、葉綠素熒光成像技術,、紅外熱成像技術、無人機遙感等),、植物表型分析技術,、呼吸與能量代謝測量技術等方面,與專業(yè)企業(yè)PSI,、Specim,、Sable等合作,致力于植物科學,、土壤與地球科學,、動物能量代謝、水體與藻類及生態(tài)環(huán)境領域先進儀器技術的引進推廣和技術研發(fā)集成,,為植物/作物表型分析、生態(tài)修復及生態(tài)保護,、能量代謝測量等提供規(guī)劃設計,、技術方案與系統(tǒng)集成、技術咨詢與科技服務,。公司技術團隊80%以上具備碩士或碩士以上學位,,并與*研究生院、中科院植物研究所,、中科院動物所,、中科院地理科學與資源研究所,、中國農科院、中國林科院,、中國環(huán)科院,、中國水科院、清華大學,、中國農業(yè)大學,、北京林業(yè)大學、北京大學,、中國海洋大學,、陜西師范大學、內蒙古大學等建立了長期的技術合作交流關系,。


   公司下設有葉綠素熒光技術與植物表型業(yè)務部,、EcoTech®實驗室、光譜成像與無人機遙感事業(yè)部及無人機遙感研究中心(與陜西師范大學合作建立),、動物能量代謝實驗室,、內蒙古阿拉善蒙古牛生態(tài)牧業(yè)研究院及青島分公司。實驗室擁有葉綠素熒光成像,、葉綠素熒光儀,、水體藻類熒光儀、SPECIM高光譜儀,、WORKSWELL紅外熱成像儀,、EasyChem全自動化學分析儀、MicroMac1000水質在線監(jiān)測系統(tǒng),、ACE土壤呼吸自動監(jiān)測系統(tǒng),、SoilBox便攜式土壤氣體通量測量系統(tǒng)、動物呼吸測量系統(tǒng),、LCpro 光合作用測量儀,、Hood土壤入滲儀、年輪分析儀等各種儀器設備,,可以進行實驗研究分析,、實驗培訓等,歡迎與易科泰生態(tài)研究室開展合作研究,。


   易科泰公司與歐洲PSI公司(葉綠素熒光技術與表型分析技術),、美國SABLE公司(動物能量代謝技術)、歐洲SPECIM公司(高光譜成像技術),、歐洲WORKSWELL公司(紅外熱成像技術),、歐洲ATOMTRACE公司(LIBS元素分析技術)、歐洲BCN無人機遙感中心、歐洲ITRAX公司(樣芯密度掃描與元素分析),、美國VERIS公司,、英國ADC公司、德國UGT公司,、歐洲SYSTEA公司等著名生態(tài)儀器技術領域的研發(fā)機構和廠商建立了密切的合作關系,,在FluorCam葉綠素熒光成像與熒光測量技術、PlantScreen植物表型分析技術,、高光譜成像技術,、紅外熱成像技術、光合作用與植物生理生態(tài)研究監(jiān)測,、土壤呼吸與碳通量研究監(jiān)測,、動物呼吸代謝測量、水質分析與藻類研究監(jiān)測,、CoreScanner樣芯密度CT與元素分析技術,、LIBS元素分析技術、無人機生態(tài)遙感技術等生態(tài)儀器技術及其系統(tǒng)方案集成有著豐富的經驗,,成為我國農業(yè),、林業(yè)、地球科學,、生態(tài)環(huán)境研究等領域科技進步的重要研究技術支持力量,。由公司研制生產的EcoDrone®無人機遙感平臺、SoilTron®多功能小型蒸滲儀技術,、SoilBox®土壤呼吸測量技術,、PhenoPlot®輕便型作物表型分析系統(tǒng)、SCG-N土壤剖面CO2/O2梯度監(jiān)測系統(tǒng),、植物生理生態(tài)監(jiān)測技術,、動物能量代謝測量技術等,在中科院修購項目,、*學科群項目,、CERN網絡(生態(tài)系統(tǒng)監(jiān)測網絡)等項目中發(fā)揮重要作用。


   “工欲善其事,,必先利其器”,,易科泰公司將秉承“利其器,善其事”的經營理念,,為國內生態(tài)-農業(yè)-健康研究與發(fā)展提供優(yōu)秀的技術方案和服務,。


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土壤與植物生理生態(tài)研究監(jiān)測、環(huán)境氣象監(jiān)測,、水文水質及地下水監(jiān)測、水土保持研究監(jiān)測、荒漠化監(jiān)測,、精準農業(yè)以及動物生態(tài)研究等儀器技術的引進推廣和系統(tǒng)集成,并為生態(tài)環(huán)境實驗研究和規(guī)劃設計提供技術方案和分析測量,。

產地類別 進口

    太陽輻射照射到植物葉片上,其中的藍色波段和紅色波段大部分被葉片吸收進行光合作用,,另一部分(包括綠色波段,、紅外波段等)以反射光的形式返回到大氣中,少量以熒光的形式發(fā)射到大氣中,,還有部分則以熱的形式耗散,。通過對葉片反射光成像測量分析(RGB彩色成像、多光譜或高光譜成像等),、多光譜熒光成像測量分析及葉片溫度測量分析(紅外熱成像),,可以全面分析植物的性狀特征包括外部形態(tài)顏色、光合作用效率,、氣孔動態(tài),、次級代謝等形態(tài)與生理生態(tài)特征,使植物表型數(shù)字化,、生理生態(tài)及功能可視化,。

    模塊式植物表型成像分析系統(tǒng)由植物多光譜熒光成像單元、紅外熱成像單元,、RGB彩色成像單元等組成,,可全面分析植物葉片及冠層的形態(tài)結構、顏色,、光合作用,、生理狀態(tài)、氣孔動態(tài),、生化色素分布,、脅迫生理等,是目前市場上配置最靈活,、功能*,、性價比最高的植物表型與生理生態(tài)觀測分析系統(tǒng)。

 

中圖:西葫蘆感染病原菌成像分析,,其中(a)為RGB彩色成像,、(b)為紅外熱成像、(c)為F520綠色熒光成像,、(d)為F520/F680綠紅熒光比值成像,;下圖:向日葵幼苗列當寄生后的多光譜熒光成像

主要功能特點與技術指標:

  • 植物多光譜熒光成像技術,可以對具有4個特征性波峰的植物熒光光譜進行成像分析,,進而可全面分析植物初級代謝(光合效率),、次級代謝、生理生態(tài)、脅迫與抗性篩選等
  • 可選配UV紫外光,、白色LED光源(用于模擬自然光源),、青色LED光源(用于氣孔功能研究)、綠色LED光源,、紅色LED光源,、藍色LED光源等不同激發(fā)光源
  • 可對UV紫外光激發(fā)的4個波峰的熒光進行成像分析,包括蘭光440nm(F440),、綠光520nm(F520),、紅光690nm(F690)和遠紅外740nm(F740),其中F440和F520統(tǒng)稱為BGF,,由表皮及葉肉細胞壁和葉脈發(fā)出,,F(xiàn)690和F740為葉綠素熒光Chl-F
  • 紅外熱成像分析單元可測量分析葉片溫度的異質性分布,并通過選區(qū)(ROI)工具得到不同區(qū)域的最高溫度,、最低溫度,、平均溫度、溫度分布頻率直方圖等,,依次進一步分析氣孔導度,、水分脅迫等
  • 40倍RGB成像可以對植物形態(tài)及顏色進行分析,既可明察秋毫到氣孔分布,,又可大視野宏觀成像分析
  • 配置靈活,、使用方便,可選配不同單元組合
  • 適于植物葉片,、植物幼苗及小型全株植物,,紅外熱成像可應用于植物冠層或多株植物成像分析
  • 應用于作物遺傳育種、遺傳組學與表型組學研究,、植物生理生態(tài)學,、植物脅迫生理、抗性篩選等領域

技術指標:

  • 紅外熱成像單元:
    • 非制冷紅外焦平面檢測器(uncooled VOx microbolometer),,已經過歐盟標注校準,,可直接測量溫度,包括每個像素點的溫度等
    • 分辨率:640x512像素
    • 光譜范圍:7.5~13.5μm
    • 溫度測量范圍:-25~150°C
    • 靈敏度:≤0.03(30mK)@ 30
    • 幀頻:9Hz或30Hz,,最大60Hz
    • 數(shù)據(jù)傳輸:USB-3或千兆以太網
    • 19mm光學鏡頭,,視野32x26,可選配13mm鏡頭或35mm鏡頭
    • 具備視頻模式和快照模式
    • 具備14種調色板供任意選擇,,可多樣化設置熱成像假彩色
    • 具備差值功能,,可內查圖像形成平滑影像以避免像素化
    • 可通過軟件設置大氣溫度、濕度,、距離等參數(shù)
    • 具備等溫模式功能,,包括以上,、一下、之間,、及以下與以上四種等溫模式
    • 結果在線報告功能,,自動顯示熱影像、時距圖及影像參數(shù)如發(fā)射率,、反射溫度、大氣溫度,、濕度,、外部光距離、傳播等
    • 影像處理軟件具備ROI選區(qū)功能,,包括點,、線、折線,、矩形等,,并可進行分區(qū)處理,每個ROI即時顯示最小溫度,、最高溫度,、平均溫度等
    • 熱掃描功能及熱剖面功能:可在線可視化顯示線型ROI溫度值、溫度剖面圖
    • 所有ROI工具的溫度值均可顯示在時距圖中
    • 防護級:IP65
    • 工作溫度:-15°C+50°C 
    • 支持GPS信息,,可將位置信息顯示在谷歌地圖上
  • 植物多光譜熒光成像
    • 成像面積20x20cm
    • 紫外光激發(fā)多光譜熒光成像包括F440,、F520、F690,、F740四個波段的熒光成像
    • 高分辨率CCD鏡頭,,20fps、1360x1024像素,,有效像素大小為6.45μm,,高速USB 2.0 (480Mbits/sec),可像素疊加(binning)以提高靈敏度(2x2,,3x3,,4x4);具備視頻模式和快照模式
    • 自動測量分析功能(無人值守):可預設1個或2個試驗程序,,系統(tǒng)可自動測量儲存
    • 激發(fā)光源包括紫外光,、藍色光源、紅橙色光源,,通過紫外激發(fā)熒光與紅光LED激發(fā)熒光,,可以分析植物類黃酮相對含量等
    • 成像分析軟件具Live(實況測試)、Protocol(實驗程序選擇),、Pre-processing(成像預處理),、Result(成像分析結果)等功能菜單
    • 成像預處理可以自動選區(qū)或手動選擇不同形狀,、不同數(shù)量、不同位置的區(qū)域(Region of interest,,ROI),,成像分析結果包括高時間解析度熒光動態(tài)圖、直方圖,、不同參數(shù)成像圖,、不同ROI的熒光參數(shù)列表等
    • Protocol實驗程序可自由編輯,也可利用Protocol菜單中的向導程序模版客戶自由創(chuàng)建新的實驗程序
    • 多種Protocols供選配和自動運行,,包括Fv/Fm,、Kautsky誘導效應、葉綠素熒光淬滅曲線,、光響應曲線等
    • 具備系統(tǒng)自動重復運行功能,,可無人值守自動循環(huán)完成選定的實驗程序,重復次數(shù)及間隔時間客戶自定義,成像測量數(shù)據(jù)自動按時間日期存入計算機
    • 高度可調,以適應不同高度植株成像分析,,最大植株高度50cm,,可根據(jù)客戶需求定制不同高度

3. NDVI與PAR吸收成像模塊:630nmLED紅色光源和740nm LED紅外光源,可對PAR(光合有效輻射)吸收及植物光譜反射指數(shù)NDVI成像分析

 

4. 可對綠色熒光蛋白GFP進行成像分析,,可選配YFP成像分析

5. RGB成像:科研級RGB成像鏡頭,,分辨率2592x1944像素,信噪比54dB,,1-40x放大,,最小視野6.1x7.9mm(40x),最大視野20.8x25.4,;可分析葉面積,、長度、寬度,、周長,、比值、綠度指數(shù),、顏色分級分析,、頻率直方圖等

 

應用案例與近期代表性參考文獻:

 

西葫蘆感染軟腐病菌(Dickeya dadantii)RGB彩色成像、多光譜熒光成像及紅外熱成像分析(引自Maria L. Perez-Bueno等,,Multicolor Fluorescence Imaging as a Candidate for Disease Detection in Plant Phenotyping. Frontiers in Plant Science, 2016)

  • Monica Pineda etc. Detection of Bacterial Infection in Melon Plants by Classification Methods Based on Imaging Data. Frontiers in Plant Science
  • Monica Pineda et. Use of multicolour fluorescence imaging for diagnosis of bacterial and fungal infection on zucchini by implementing machine learning. Functional Plant Biology, 2017
  • Carmen M. Ortiz-Bustos etc. Fluorescence Imaging in the Red and Far-Red Region during Growth of Sunflower Plantlets. Diagnosis of the Early Infection by the Parasite Orobanche Cumana. Frontiers in Plant Science, 2016
  • Maria Luisa Perez-Bueno etc. Spatial and temporal dynamics of primary and secondary metabolism in Phaseolus vulgaris challenged by Pseudomonas syringae. Physiologia Plantarum, 2015


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