SILAC代謝標記定量實驗服務

實驗技術簡介: SIL AC的基本原理是分別用天然同位素(輕型)或穩(wěn)定同位素(重型)標記的必需氨基酸取代細胞培養(yǎng)基中相應氨基酸,，細胞經(jīng)5-6個倍增周期后,，穩(wěn)定同位素標記的氨基酸*摻入到細胞新合成的蛋白質中替代了原有氨基酸。不同標記細胞的裂解蛋白按細胞數(shù)或蛋白量等比例混合，經(jīng)分離,、純化后進行質譜鑒定,，根據(jù)一級質譜圖中兩個同位 素型肽段的面積比較進行相對定量。屬于體內代謝標記法,。

實驗操作流程:

1,、蛋白提取和樣品制備

2、標記效率測試

3,、樣品混臺

4,、SDS-PAGE分級

5、酶解

6,、質譜鑒定

7,、軟件分析

8,、定性定量蛋白質組結果

9,、生物信息學數(shù)據(jù)挖掘和統(tǒng)計分析

實驗注意事項:

客戶提供:

1、蛋白質提取物: 濃度>1μg/ul, 蛋白質總量>300μg.

2,、細胞:通過細胞計數(shù)取不少于2x106個細胞于EP管,，加入0 5ml生理鹽水或蛋白保護劑，混勻后保存于冰箱(-80°C,， 避免反復凍融),。

交付標準:

1、蛋白質鑒定和SIL AC定量分析結果;

2,、客戶蛋白質對應的質譜峰圖;

3,、SIL AC實驗完整的實驗步驟、使用儀器,、軟件檢索參數(shù)等,。

其他:

1、SILAC是體內標記技術,，穩(wěn)定同位素標記的氨基酸與天然氨基酸化學性質基本相同,，所標記的細胞和未標記細胞在生物學行為上幾乎沒有差異，標記效率可高達100%,。

2,、采用質譜定量,定量結果準確且批次變異小、重復性好,。

3,、體內代謝標記與SDS- PAGE或色譜分離技術相結合，兼容疏水性蛋白和偏堿性蛋白,，不受蛋白性質限制,。

4、多個樣品混合后同時進行分離、酶切和鑒定,后續(xù)實驗對樣品的影響一致,， 減少了實驗操作和儀器設備產(chǎn)生的影響,。

5、由于該技術屬于體內標記,，標記效果穩(wěn)定,，其標記效率不受裂解液的影響，不僅適合于進行全細胞蛋白的分析,，還適合于膜蛋白的鑒定和定量,。

6、與化學標記相比,，SIL AC方法蛋白需要量明顯減少,，通常每個樣品只需要幾十微克的蛋白量。

7,、活體標記,，更接近樣品真實狀態(tài)。

8,、只適用于活體培養(yǎng)的細胞,，對于生物醫(yī)學研究中常用的組織樣品，體液樣品等無法分析,對于動物模型的標記成本太大,，無法實現(xiàn),。與體外標記技術相比，SIL AC屬于體內標記,，具有以下技術優(yōu)勢

1,、高通量，可同時鑒定并定量數(shù)百至數(shù)千種蛋白質;

2,、定量精確,，降低由于樣品制備不同而造成的實驗差異;

3、線性定量范圍廣;

4,、靈敏度更高,，蛋白質需要量明顯減少;

5、標記采用的是體內標記技術,，更接近樣品真實狀態(tài),。

SILAC技術服務內容

1、細胞同位素標記;

3,、SDS-PAGE分離;

4,、胰酶酶切后液相分離和質譜分析;

5、數(shù)據(jù)庫檢索及蛋白質定量分析;

6,、差異蛋白的生物信息學分析;

7,、實驗報告提交。

實驗服務報告內容

1、蛋白定鑒定和SIL AC定量分析結果;

2,、顧客蛋白質對應的質譜峰圖;

3,、SIL AC實驗完整的實驗步驟、使用儀器,、軟件檢索參數(shù)等,。

技術服務優(yōu)勢

1、靈敏度高,，檢測限低,，可檢測出低豐度蛋白;

2、分離能力強,，分析范圍廣,，iITRAQ可以對任何類型的蛋白質進行分離鑒定，包括高分子量蛋白質,、酸性蛋白和堿性蛋白,，膜蛋白和不溶性蛋白;

3、高通量:同時對8個樣本進行分析,，提高了實驗通量,，可同時對多個時間點或不同處理的蛋白質進行分析;

4,、結果可靠:定性與定量分析結果更加可靠;

5,、自動化程度高:液相與質譜連用，自動化操作,，分析速度快,，分離效果好。

實驗代做服務：