一、實驗?zāi)康?/strong>
學(xué)習(xí)和掌握瓊脂糖電泳法鑒定DNA的原理和方法,。
二,、實驗原理
瓊脂糖凝膠電泳是用于分離,、鑒定和提純DNA片段的標(biāo)準(zhǔn)方法,。瓊脂糖是從瓊脂中提取的一種多糖,具親水性,,但不帶電荷,,是一種很好的電泳支持物。DNA在堿性條件下(pH8.0的緩沖液)帶負(fù)電荷,,在電場中通過凝膠介質(zhì)向正極移動,,不同DNA分子片段由于分子和構(gòu)型不同,在電場中的泳動速率液不同,。溴化乙錠(EB)可嵌入DNA分子堿基對間形成熒光絡(luò)合物,,經(jīng)紫外線照射后,可分出不同的區(qū)帶,,達(dá)到分離,、鑒定分子量,篩選重組子的目的,。
三,、實驗材料
實驗14提取的DNA樣品,
四,、器具及藥品
電泳儀,,電泳槽,,紫外透射反射儀,恒溫水浴鍋,,微波爐,,微量進樣器,三羥甲基氨基甲烷,,鹽酸,,醋酸鈉,EDTA,,瓊脂糖,,溴酚藍(lán),溴化乙錠,。
五,、實驗步驟
1、安裝電泳槽
將有機玻璃的電泳凝膠床洗凈,,晾干,,用膠帶將兩端的開口封好,放在水平的工作臺上,,插上樣品梳,。
2、瓊脂糖凝膠的制備
稱取瓊脂糖溶解在電泳緩沖液中,,(按0.3-1.5%的瓊脂糖含量,,1-25kb大小的DNA用1%的凝膠,20-100kb的DNA用0.5%的凝膠,,200-2000bp的DNA用1.5%的凝膠)置微波爐或沸水浴中加熱至*溶化(不要加熱至沸騰),,取出搖勻。
3,、灌膠
將冷卻到60℃的瓊脂糖溶液輕輕倒入電泳槽水平板上,。
4、待瓊脂糖膠凝固后,,在電泳槽內(nèi)加入電泳緩沖液,,然后拔出梳子。
5,、加樣
將DNA樣品與加樣緩沖液按4:1混勻后,,用微量移液器將混合液加到樣品槽中,每槽加10-20μl,,記錄樣品的點樣次序和加樣量,。
6、電泳
安裝好電極導(dǎo)線,點樣孔一端接負(fù)極,,另一端接正極,,打開電源,調(diào)電壓至3-5V/cm,,電泳1-3hr,,當(dāng)溴酚藍(lán)移到距凝膠前沿1-2cm時,停止電泳,。
7,、染色和觀察
取出凝膠,放在含有溴化乙錠的染色液中染色30min,,即可在254nm的紫外燈下觀察,,有橙紅色熒光條帶的位置,即為DNA條帶,,或在紫外燈下照相記錄電泳圖譜,。溴化乙錠是致癌劑,操作時要小心,,必須戴手套,。
附:
⑴5×TBE(tris-硼酸及EDTA)緩沖液的配制(1000ml):
Tris 54g,硼酸27.5g,,0.5mol/LEDTA20ml,,將pH調(diào)到8.0,定容至1000ml,,4℃冰箱保存,,用時稀釋10倍。
⑵加樣緩沖液的配制:
0.25%溴酚藍(lán),,40%(W/V)蔗糖水溶液,,4℃冰箱保存。
⑶溴化乙錠的配制:
稱取0.1g溴化乙錠,,溶于10ml水,配成終濃度為10mg/ml的母液,,4℃冰箱保存,。染色時,吸取12.5μl的母液,,加入250ml的水中,,使其終濃度為0.5μg/ml,混合均勻,。
⑷100倍TE緩沖液的配制:
1mol/LTris-HCl(pH8.0),,100mmol/LEDTA
稱取Tris121.1g,EDTA-Na237.23g,先用800ml雙蒸水,,加熱攪拌溶解后,,再用鹽酸調(diào)pH至8.0(大約加入鹽酸20ml),然后定容至1000ml,。
⑸100倍電泳緩沖液的配制:
4mol/LTris-HCl(pH8..0),,2mol/L醋酸鈉,200mmol/LEDTA
稱取Tris242.2g,,無水乙酸鈉82.03g,,EDTA-Na237.23g,先用400ml雙蒸水加熱攪拌溶解后,,再用冰乙酸調(diào)pH至8.0(大約加入冰乙酸50ml),,然后定容至500ml。用時稀釋100倍,。
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