關(guān)于酶切的有用知識-紅外線滅菌器技術(shù)文章
酶切是分子生物學中常用的,如何選擇酶切緩沖液,,提高酶切效率,是一個十分關(guān)鍵的問題,,本人摘用了其它論壇的內(nèi)容,,另外將逐步整理,使酶切問題能夠比較容易解決,,希望大家補充:
PCR產(chǎn)物的酶切,。
PCR產(chǎn)物的酶切與引物上引入的保護堿基有很大的關(guān)系,所以設(shè)計引物的時候就應(yīng)該注意到這一點,,如何選擇保護堿基,,具體參見NEB上關(guān)于保護堿基的資料:
2.加了保護堿基可能也會遇到切不動的問題,切不動可以從以下方面考慮:(1)酶切緩沖液,、
每種酶都有公司提供的*緩沖液,,它們的差別只是離子濃度與體系的不同,如Na,、k,、Mg等,還有PH值及緩沖體系(一般Tris-HCl),,另外酶加甘油
和DTT作為保護劑。在雙酶切的時候常會遇到兩種酶有各自的緩沖液,,要達到高酶切效率,,選擇是個問題,如果酶切時間和量足夠,,解決的方法:
(A)使用其中一個酶的緩沖液,,但要考慮到另一酶的反應(yīng)效率,反應(yīng)效率如何,,可以查查酶在不同buffer里的效率參數(shù),,具體見公司,如NEB提供了很好的buffer參數(shù):
(B)
使用它們的通用的緩沖液,,使兩種酶在同一緩沖液里達到也足夠的酶切效率,;沒有通用的BUFFER怎么辦呢?
分兩次酶切,。即先用一種酶切,,膠回收后再用另一種酶切。一般先低鹽后高鹽,,這種方法保證了在各自的酶切緩沖液中都得到zui大的酶切效率,,但缺點是要回收,損
失大 ,;
(C)克隆到T載體中,,值得推薦的方法,克隆到T載體中,,不須要考慮受這個條件的限制,,酶切位點也可以用T載體上自帶的,。
(2)酶切溫度。酶切溫度也很重要,,一般的酶切zui適溫度為37度,,有些特殊的酶的反應(yīng)溫度不同,如Sma Ⅰ為30度,。雙酶切時這種情況下分開切,,先低溫后高溫。
(3)酶切時間,。酶切時間直接影響到酶切是否*,,一般為1-3h,這個時間已經(jīng)足夠,,對于一些活性較好的酶,,30min就可以酶切*,建議在酶切1h后取5ul跑電泳以鑒定酶切效率,;PCR產(chǎn)物的酶切時間較長,,一般24小時。
(4)酶失活,。如
果使用酶解凍后放置太久,,可能導(dǎo)致酶失活。這種情況較少見,,只能換新酶,。如果拿了不同公司的酶,buffer也不一樣,,怎么辦,?放心,可以用不同公司的酶
進行雙酶切,,一般不會有問題的,。可以先查查NEB的酶在不同緩沖液中的活性百分比,,選擇它們都有適中活性的buffer,,每個公司生產(chǎn)的酶反應(yīng)緩沖液針對
特定內(nèi)切酶是zui合適的!
(5)酶切體系,。選用多大的酶切體系取決于你的樣品濃度,,在雙酶切的時候為了得到質(zhì)量高的電泳圖,尤其插入的是小片段DNA,,酶切后產(chǎn)物量較少,,可以增加酶切重組DNA的量和增加上樣量,建議酶切前測定一下DNA濃度或跑電泳看看DNA有多濃,,做到心中有數(shù),。
相關(guān)產(chǎn)品
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