靈芝（Ganoderma lucidum）在中國被稱為“不朽的蘑菇”,， 用于中醫(yī)藥中已有超過2000年歷史,，從中也可以提煉出多種有價值的生物活性成分，其藥理活動的廣泛認可,，已被列入美國草藥藥典,。zui近中國的一個研究小組在Nature上發(fā)表文章1，報道完成了靈芝G. lucidum 260125-1菌株 43.3 Mb的基因組圖譜,。
       利用454 GS FLX系統(tǒng)及短測序平臺共獲得了約280萬條shotgun序列,，達到基因組440倍以上的覆蓋，拼接完成的基因組由82個Scaffolds組成,，通過optical maps排列到13個染色體上,。預測編碼16，113個基因,，平均長度為1556bp,，每個基因約含4.7個外顯子。重復序列約占基因組的8.15%,，主要為LTR / Gypsy重復元素,。此外，研究人員還將進行了與其他真菌基因組進行比較分析,，及靈芝基因表達的總體分析,。
       靈芝能產(chǎn)生大量的生物活性物質(zhì)，迄今為止,，已超過400種化合物被發(fā)現(xiàn),，使真菌被視為這些有效生物活性物質(zhì)的天然加工廠。其中,，三萜類和多糖是靈芝的藥理活性的化合物的兩個大類,。此次研究中發(fā)現(xiàn)，序列分析揭示了一系列編碼細胞色素P450（CYPs）的基因,，其產(chǎn)物為在次生代謝中協(xié)同作用的轉(zhuǎn)運和調(diào)節(jié)蛋白,。一共有24個CYP基因簇被確定,。78 個CYP基因與羊毛甾醇合成酶（lanosterol synthase）共表達，其中16個與真菌CYP高相似度,，這些CYP的作用是羥基化睪酮（testosterone）,，暗示他們可能在三萜類生物合成中起作用。
除了在生產(chǎn)這些生物活性的化合物,，靈芝,，像其他白腐擔子菌一樣能分泌可以有效分解纖維素和木質(zhì)素的酶。這種酶可能幫助實現(xiàn)生物能利用,，纖維漂白和有機污染物降解,。此次完成的基因組中，也確定了一系列編碼大量與木材降解有關的酶,，是目前為止發(fā)現(xiàn)的zui豐富的降解酶之一,。
       盡管靈芝在我國有長期的使用歷史，但目前對于靈芝生物學的理解是有限的,。這次的基因組研究成果有助于闡明藥用真菌的次生代謝產(chǎn)物合成機制,，及相關的調(diào)節(jié)機制。并將有助于充分發(fā)揮靈芝提供有藥理活性的成分及作為工業(yè)用酶的來源方面的潛力,。