靈芝（Ganoderma lucidum）在中國(guó)被稱為“不朽的蘑菇”,， 用于中醫(yī)藥中已有超過(guò)2000年歷史，從中也可以提煉出多種有價(jià)值的生物活性成分,，其藥理活動(dòng)的廣泛認(rèn)可,，已被列入美國(guó)草藥藥典。zui近中國(guó)的一個(gè)研究小組在Nature上發(fā)表文章1,，報(bào)道完成了靈芝G. lucidum 260125-1菌株 43.3 Mb的基因組圖譜,。
       利用454 GS FLX系統(tǒng)及短測(cè)序平臺(tái)共獲得了約280萬(wàn)條shotgun序列，達(dá)到基因組440倍以上的覆蓋,，拼接完成的基因組由82個(gè)Scaffolds組成,，通過(guò)optical maps排列到13個(gè)染色體上,。預(yù)測(cè)編碼16，113個(gè)基因,，平均長(zhǎng)度為1556bp,，每個(gè)基因約含4.7個(gè)外顯子。重復(fù)序列約占基因組的8.15%,，主要為L(zhǎng)TR / Gypsy重復(fù)元素,。此外,，研究人員還將進(jìn)行了與其他真菌基因組進(jìn)行比較分析,，及靈芝基因表達(dá)的總體分析,。
       靈芝能產(chǎn)生大量的生物活性物質(zhì),，迄今為止,，已超過(guò)400種化合物被發(fā)現(xiàn),，使真菌被視為這些有效生物活性物質(zhì)的天然加工廠,。其中,，三萜類和多糖是靈芝的藥理活性的化合物的兩個(gè)大類,。此次研究中發(fā)現(xiàn)，序列分析揭示了一系列編碼細(xì)胞色素P450（CYPs）的基因,，其產(chǎn)物為在次生代謝中協(xié)同作用的轉(zhuǎn)運(yùn)和調(diào)節(jié)蛋白,。一共有24個(gè)CYP基因簇被確定。78 個(gè)CYP基因與羊毛甾醇合成酶（lanosterol synthase）共表達(dá),，其中16個(gè)與真菌CYP高相似度,，這些CYP的作用是羥基化睪酮（testosterone）,，暗示他們可能在三萜類生物合成中起作用。
除了在生產(chǎn)這些生物活性的化合物,，靈芝,，像其他白腐擔(dān)子菌一樣能分泌可以有效分解纖維素和木質(zhì)素的酶。這種酶可能幫助實(shí)現(xiàn)生物能利用,，纖維漂白和有機(jī)污染物降解。此次完成的基因組中,，也確定了一系列編碼大量與木材降解有關(guān)的酶,，是目前為止發(fā)現(xiàn)的zui豐富的降解酶之一。
       盡管靈芝在我國(guó)有長(zhǎng)期的使用歷史，但目前對(duì)于靈芝生物學(xué)的理解是有限的,。這次的基因組研究成果有助于闡明藥用真菌的次生代謝產(chǎn)物合成機(jī)制，及相關(guān)的調(diào)節(jié)機(jī)制,。并將有助于充分發(fā)揮靈芝提供有藥理活性的成分及作為工業(yè)用酶的來(lái)源方面的潛力,。