RT-PCR
RT- PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)即逆轉(zhuǎn)錄PCR,,是將RNA的逆轉(zhuǎn)錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈?zhǔn)綌U(kuò)增反應(yīng)(PCR)相結(jié)合的技術(shù)。RT-PCR技術(shù)靈敏而且用途廣泛,,可用于檢測細(xì)胞/組織中基因表達(dá)水平,,細(xì)胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列等,。
RT- PCR操作流程:
RT- PCR反應(yīng)原理
- 從細(xì)胞或特定組織中提取總RNA。
- 逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn),。
- 擴(kuò)增內(nèi)參和目的基因并比較基因表達(dá)差異,。
RT-PCR反應(yīng)受多個(gè)因素影響,
如硫酸鎂的濃度, 引物退火的溫度,,擴(kuò)增的循環(huán)數(shù)等,。 ◇建議選擇0.5-3.0 mM (相差0.5 mM)的硫酸鎂作初步實(shí)驗(yàn)。 ◇對于具有較高Tm的引物,,增加退火和延伸時(shí)的溫度對反應(yīng)有利,。較高的溫度有利于減少非特異的引物結(jié)合,因而提高特異產(chǎn)物的得率,。 ◇大多數(shù)目標(biāo)RNA經(jīng)40輪PCR反應(yīng)就能觀察到,。但如果目標(biāo)RNA太,或者只有很少的起始材料,,有必要增加擴(kuò)增的次數(shù)到45-50次,。
隨機(jī)引物 | 適用于長的或具有發(fā)卡結(jié)構(gòu)的RNA,。適用于rRNA、mRNA,、tRNA 等所有RNA的反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),。主要用于單一模板的RT-PCR反應(yīng)。 |
Oligo dT | 適用于具有PolyA尾巴的RNA,。(原核生物的RNA,、真核生物的 Oligo dT rRNA和tRNA不具有PolyA尾巴,。)由于Oligo dT要結(jié)合到PolyA 尾巴上,,所以對RNA樣品的質(zhì)量要求較高,即使有少量降解也 會(huì)使全長cDNA合成量大大減少,。 |
基因特異性引物 | 與模板序列互補(bǔ)的引物,,適用于目的序列已知的情況。天為時(shí) 性引物 代公司的SuperScript One-Step System特別適合于與基因特異性 引物連用,。 |
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