在PCR實(shí)驗(yàn)中,污染是一個(gè)常見(jiàn)且嚴(yán)重的問(wèn)題,,可能導(dǎo)致假陽(yáng)性結(jié)果,,影響實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可靠性。為有效預(yù)防和處理PCR污染,,需遵循以下注意事項(xiàng):
一,、實(shí)驗(yàn)分區(qū)與操作流程
合理劃分實(shí)驗(yàn)區(qū)域:將實(shí)驗(yàn)分為標(biāo)本處理區(qū)、PCR反應(yīng)液制備區(qū),、PCR擴(kuò)增區(qū)和產(chǎn)物分析區(qū),各區(qū)域應(yīng)有明確的隔離和方向性,,避免交叉污染,。
單向工作流程:從預(yù)PCR到后PCR,實(shí)行“單向”工作流程,,確保在后PCR區(qū)域引入的耗材和防護(hù)裝備不會(huì)未經(jīng)消毒就回到預(yù)PCR區(qū)域,。
試劑與樣品分離:PCR試劑、PCR反應(yīng)液應(yīng)與樣品及PCR產(chǎn)物分開(kāi)保存,,不應(yīng)放于同一冰盒或冰箱,。
二、試劑與材料準(zhǔn)備
試劑分裝:所有PCR試劑應(yīng)在超凈工作臺(tái)或負(fù)壓工作臺(tái)配制和分裝,,使用專(zhuān)用加樣器和吸頭,,避免交叉污染。
試劑儲(chǔ)存:實(shí)驗(yàn)室自配的試劑(如去離子水,、緩沖液等)在使用前應(yīng)高壓滅菌或過(guò)濾除菌,。
試劑小量分裝:PCR試劑應(yīng)小量分裝,以減少重復(fù)取樣次數(shù),,并置于-20℃保存,。
三、實(shí)驗(yàn)操作規(guī)范
正確佩戴防護(hù)裝備:實(shí)驗(yàn)過(guò)程中應(yīng)戴一次性手套,,若不小心濺上反應(yīng)液,,立即更換手套,。
避免氣溶膠污染:操作時(shí)應(yīng)勤換手套,進(jìn)出不同區(qū)域或進(jìn)行模板操作后應(yīng)及時(shí)更換手套,;開(kāi)管動(dòng)作要輕,,以防管內(nèi)液體濺出或形成氣溶膠。
減少操作污染:在同時(shí)進(jìn)行多個(gè)PCR反應(yīng)時(shí),,應(yīng)制備主反應(yīng)混合液,,再分裝至PCR反應(yīng)管,最后添加樣品核酸模板,,以減少單個(gè)添加操作繁瑣造成的污染,。
使用防濺污染的吸頭:使用防濺污染的移液器吸頭,減少樣本或試劑中的氣溶膠形成
四,、污染監(jiān)測(cè)與處理
設(shè)立對(duì)照實(shí)驗(yàn):設(shè)立陰陽(yáng)性對(duì)照和空白對(duì)照,,監(jiān)測(cè)反應(yīng)體系各成分的污染情況,選擇合適的對(duì)照樣品,。
污染識(shí)別:使用“無(wú)模板對(duì)照”(NTC),,其中NTC孔包含所有qPCR反應(yīng)組件,但不包含DNA模板,。如果在NTC孔中觀察到擴(kuò)增,,可能表明反應(yīng)組件中存在污染。
污染處理:若發(fā)生污染,,應(yīng)設(shè)立陰陽(yáng)性對(duì)照監(jiān)測(cè)污染情況,,排除試劑污染后,考慮環(huán)境污染的可能性,,通過(guò)追蹤實(shí)驗(yàn)查找污染源,,必要時(shí)更換實(shí)驗(yàn)場(chǎng)所或重新設(shè)計(jì)引物。
五,、實(shí)驗(yàn)室清潔與消毒
定期清潔:實(shí)驗(yàn)結(jié)束后對(duì)操作臺(tái)面,、儀器、實(shí)驗(yàn)用具及環(huán)境進(jìn)行清潔,,避免污染,。
消毒措施:使用10-15%的漂白溶液(次氯酸鈉)擦拭表面,讓漂白劑作用于表面10至15分鐘后,,用去離子水擦拭,,最后用70%酒精浸濕的紙巾快速干燥表面。
設(shè)備消毒:定期消毒用于準(zhǔn)備qPCR反應(yīng)的表面和設(shè)備,,包括工作臺(tái)面,、移液器、冰箱/冷凍室把手,、離心機(jī),、渦旋器和其他觸點(diǎn),。
六、污染控制技術(shù)
UNG法:使用尿嘧啶糖苷酶(UNG)去除PCR產(chǎn)物中的污染,,優(yōu)點(diǎn)是能去除任何來(lái)源的污染,,且UNG處理可與PCR擴(kuò)增在同一反應(yīng)管內(nèi)進(jìn)行
DNase I法:采用DNase I法處理反應(yīng)液污染,適用于去除污染DNA,。
固相捕獲法:利用生物素標(biāo)記的單鏈RNA探針與待擴(kuò)核酸雜交,,再用包被鏈霉親和素的固相載體捕獲雜交核酸,從而去除污染
七,、其他注意事項(xiàng)
實(shí)驗(yàn)記錄與驗(yàn)證:堅(jiān)持常規(guī)清潔工作,,設(shè)計(jì)陰性對(duì)照組,連續(xù)三天陰性對(duì)照沒(méi)有起跳,,則污染得到控制,。
人員培訓(xùn):所有操作人員應(yīng)接受?chē)?yán)格培訓(xùn),確保操作規(guī)范,,減少人為污染風(fēng)險(xiǎn),。
通過(guò)以上措施,可以有效預(yù)防和處理PCR污染,,確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性,。
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