倒置顯微鏡是物鏡和照明系統(tǒng)位置顛倒的顯微鏡,，主要是為了適應(yīng)生物學(xué)等領(lǐng)域中液基顯微觀察需要而設(shè)計,。

在細(xì)胞培養(yǎng)、組織培養(yǎng),、浮游生物,、環(huán)境保護(hù),、食品檢驗(yàn)等應(yīng)用中，被檢物通常在培養(yǎng)皿或培養(yǎng)瓶等容器的溶液中,，這就要求倒置顯微鏡的物鏡和聚光鏡要采用長工作距離設(shè)計,，以便不接觸容器就能觀察和研究貼著容器內(nèi)壁或者懸浮在溶液中的被檢物。

區(qū)別1：外觀區(qū)別

  正置顯微鏡的物鏡在載物臺上方,，透射光源在下方,；而倒置顯微鏡物鏡在載物臺下方，透射光源在上方,，從外觀上可以很容易區(qū)分兩者,。

區(qū)別2：物鏡光學(xué)校正不同

  正置顯微鏡的物鏡是為很薄的蓋玻片校準(zhǔn)的，鏡身相關(guān)標(biāo)記是0.17之類很低的數(shù)值,；倒置顯微鏡是為較厚的載玻片,、培養(yǎng)皿底部校正的，鏡身相關(guān)標(biāo)記會是1以上的數(shù)值,。兩者物鏡因此無法通用,，可以據(jù)此區(qū)分正置顯微鏡和倒置顯微鏡。

區(qū)別3：物鏡工作距離不同

  倒置顯微鏡通常用于觀察溶液中的被檢物,，如培養(yǎng)液中的細(xì)胞,，為了對焦溶液中的懸浮物，倒置顯微鏡的物鏡工作距離會比正置的大,。

區(qū)別4：放大倍率差異

  正置顯微鏡可以選擇100X物鏡,，搭配10X目鏡實(shí)現(xiàn)1000X高放大倍率；倒置顯微鏡的常見物鏡最大放大倍率只有60X,，這是因?yàn)樵?00X時物鏡幾乎是貼著樣品的,，這個工作距離已經(jīng)小于容器底部厚度，也就是說在對焦成功前物鏡就已經(jīng)撞上容器底部了,，根本不可能對焦,。

  例外的是倒置金相顯微鏡，可能會有長工作距離的100X物鏡,，工作距離可以到3mm左右,，但并不常用，因?yàn)檫@種100X物鏡數(shù)值孔徑只有0.8左右,，比正置100X物鏡約1.3的數(shù)值孔徑顯著低,，因此分辨率其實(shí)并不理想。

區(qū)別5：倒置標(biāo)配相襯觀察

  倒置顯微鏡常用于無色透明的活細(xì)胞觀察,，因此標(biāo)配相襯環(huán)和相襯物鏡以實(shí)現(xiàn)相襯觀察,，通常會有4X、10X、20X和40X四種放大倍率,，還會有相襯物鏡,。正置顯微鏡要做相襯觀察的話需要特殊的聚光鏡配件，因此相襯的正置顯微鏡并不常見,，而且標(biāo)配物鏡不包含相襯物鏡,。

區(qū)別6：樣品高度限制小

  倒置顯微鏡的聚光鏡采用長工作距離設(shè)計，部分還可以額外加高,，以適應(yīng)更高的樣品,，比如MI52-CF加高了聚光燈，可放下10層細(xì)胞工廠,。

  另外部分倒置顯微鏡還可能取消上光源,，以解除樣品高度限制，比如KMM-300金相顯微鏡,，采用倒置的反射照明,，沒有上光源，可以很方便地直接放置觀察大尺寸的金屬材料樣品,，減少制樣的麻煩,。