什么是賽默飛 ViiA 7 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 儀器
賽默飛 ViiA™ 7 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 儀器技術(shù)介紹
一,、儀器概述
ViiA™ 7 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 系統(tǒng)是 Thermo Fisher Scientific 推出的多功能實(shí)時(shí)定量 PCR 平臺(tái)之一,,集成了高通量檢測(cè)能力、靈活配置模塊與圖形化操作系統(tǒng),,適用于基因表達(dá)分析,、基因分型、SNP檢測(cè),、拷貝數(shù)變異(CNV)分析,、路徑分析等分子生物學(xué)研究場(chǎng)景。
該系統(tǒng)支持多種反應(yīng)格式,,包括96孔,、384孔和TaqMan Array卡等,實(shí)現(xiàn)從中低通量到大規(guī)模篩查的實(shí)驗(yàn)需求,。結(jié)合其配套的QuantStudio軟件平臺(tái),,能夠完成實(shí)時(shí)熒光采集、定量分析與結(jié)果可視化,。
二,、主要技術(shù)參數(shù)與配置
反應(yīng)孔板兼容性
支持96孔板、384孔板,;
支持TaqMan Array Microfluidic Card(8×12通道),;
可選擇不同反應(yīng)模塊進(jìn)行更換,,提升通量靈活性;
單次反應(yīng)體系體積范圍:10–100 µL(96孔),、5–20 µL(384孔),、1–10 µL(Array卡),。
溫控系統(tǒng)
Peltier溫控模塊,;
升溫速率:≥4.0°C/s;
降溫速率:≥3.5°C/s,;
溫度準(zhǔn)確性:±0.25°C,;
溫度均一性(96孔):<0.4°C;
可控?zé)嵘w,,適應(yīng)不同板型,避免樣本蒸發(fā),。
光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)
采用高亮度LED激發(fā)源,,延長(zhǎng)壽命、降低維護(hù)頻率,;
標(biāo)準(zhǔn)配置6通道檢測(cè)系統(tǒng)(支持FAM, VIC, NED, ROX, SYBR Green等);
自適應(yīng)熒光通道校準(zhǔn)機(jī)制,,避免通道串?dāng)_,;
實(shí)時(shí)采集數(shù)據(jù),每循環(huán)一個(gè)周期自動(dòng)記錄熒光信號(hào),;
具有無(wú)接觸光學(xué)掃描設(shè)計(jì),避免物理磨損,。
軟件系統(tǒng)(QuantStudio/Cloud支持)
實(shí)驗(yàn)設(shè)置模塊:支持模板選擇,、程序編輯與快速啟動(dòng);
數(shù)據(jù)分析模塊:具備Ct值計(jì)算,、ΔΔCt相對(duì)表達(dá)分析、熔解曲線分析等,;
多用戶權(quán)限與實(shí)驗(yàn)加密管理,;
兼容云端平臺(tái),實(shí)現(xiàn)遠(yuǎn)程實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與數(shù)據(jù)查看,;
支持SNP判定,、標(biāo)準(zhǔn)曲線自動(dòng)生成、樣本分組和統(tǒng)計(jì)分析,;
數(shù)據(jù)導(dǎo)出格式:Excel、CSV,、PDF,、圖像等多種方式。
三,、工作原理
ViiA™ 7 基于實(shí)時(shí)熒光PCR原理,,通過(guò)熒光探針(如TaqMan探針)或染料(如SYBR Green)標(biāo)記擴(kuò)增產(chǎn)物,在擴(kuò)增過(guò)程中記錄熒光信號(hào)強(qiáng)度變化,,建立擴(kuò)增曲線,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)核酸序列的定量分析,。
其工作流程主要包括以下幾步:
樣本制備
配置PCR反應(yīng)體系,包括模板,、引物、熒光探針或染料,、酶體系和緩沖液,;
分裝至96/384孔板或Array卡中。
PCR擴(kuò)增與熒光采集
儀器通過(guò)預(yù)設(shè)程序進(jìn)行熱循環(huán)擴(kuò)增,;
每一循環(huán)末期采集熒光強(qiáng)度,,生成實(shí)時(shí)擴(kuò)增曲線;
根據(jù)熒光閾值計(jì)算Ct值(Cycle threshold),,反映起始模板濃度。
數(shù)據(jù)分析
軟件自動(dòng)判斷擴(kuò)增效率,、背景噪音,、熒光漂移,;
生成標(biāo)準(zhǔn)曲線或進(jìn)行相對(duì)定量分析;
對(duì)目標(biāo)基因表達(dá)水平或基因分型進(jìn)行判定,。
四,、儀器組成與模塊化設(shè)計(jì)
ViiA™ 7 實(shí)時(shí)定量PCR儀采用模塊化設(shè)計(jì),,用戶可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求選擇以下組件:
主機(jī)
集成溫控模塊與光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng),;
配備可更換反應(yīng)模塊(96孔、384孔,、Array卡);
支持自動(dòng)識(shí)別并適應(yīng)不同板型,。
控制系統(tǒng)
通過(guò)配套電腦或QuantStudio軟件進(jìn)行全程控制,;
可連接實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIMS),;
耗材系統(tǒng)
標(biāo)準(zhǔn)0.2 mL PCR板,;
384孔板與封膜;
TaqMan Array卡和加載夾具,;
配套服務(wù)
可選自動(dòng)液體處理系統(tǒng)連接,;
提供安裝培訓(xùn)與定期維護(hù)支持,;
軟件更新與在線技術(shù)資源支持,。
五、典型應(yīng)用實(shí)例
基因表達(dá)譜分析
比較實(shí)驗(yàn)處理組與對(duì)照組之間的目標(biāo)基因表達(dá)變化,;
可與RNA提取和cDNA合成體系配套使用,;
支持多重定量與多基因比較。
SNP基因分型
采用TaqMan探針識(shí)別單堿基變異,;
實(shí)時(shí)檢測(cè)等位基因信號(hào),,區(qū)分純合/雜合型;
廣泛應(yīng)用于藥物代謝,、遺傳疾病篩查等領(lǐng)域,。
病毒與病原體載量檢測(cè)
檢測(cè)病毒RNA/DNA濃度,如HBV,、HCV,、HIV、SARS-CoV-2等,;
可與預(yù)構(gòu)建探針試劑盒搭配,,進(jìn)行絕對(duì)定量分析;
滿足疾病篩查,、診斷與療效評(píng)估需求,。
miRNA與lncRNA定量分析
適用于小RNA或長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)研究;
軟件支持歸一化分析與多目標(biāo)比較,;
與miRNA反轉(zhuǎn)錄引物聯(lián)合使用可提高檢測(cè)靈敏度,。
拷貝數(shù)變異(CNV)分析
用于分析特定基因的DNA拷貝數(shù)變化;
常用于腫瘤學(xué),、基因組完整性評(píng)價(jià)等研究方向,。
六、操作注意事項(xiàng)與維護(hù)建議
實(shí)驗(yàn)操作
確保板面干凈,、封膜緊密,,避免蒸發(fā)或污染;
熱蓋需根據(jù)板型調(diào)節(jié)高度與壓力,;
建議使用ROX作為內(nèi)參染料,,修正熒光漂移。
維護(hù)保養(yǎng)
定期檢查光源穩(wěn)定性與濾光片清潔度,;
長(zhǎng)時(shí)間停機(jī)前應(yīng)進(jìn)行數(shù)據(jù)備份與系統(tǒng)清理,;
定期更新軟件以獲取新功能與增強(qiáng)兼容性,。
常見(jiàn)問(wèn)題
熒光信號(hào)漂移:檢查板密封性與反應(yīng)體系;
信號(hào)偏低:優(yōu)化引物,、模板濃度與酶體系,;
無(wú)擴(kuò)增:排查酶活性、程序設(shè)置與試劑有效性,。
七,、總結(jié)與適配場(chǎng)景分析
ViiA™ 7 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 系統(tǒng)憑借其多模塊兼容、通量靈活,、軟件功能全面等特點(diǎn),,適用于基礎(chǔ)分子生物學(xué)研究、高通量基因篩查,、臨床科研輔助分析等多種場(chǎng)景。系統(tǒng)提供標(biāo)準(zhǔn)化操作流程與多通道檢測(cè)支持,,便于實(shí)驗(yàn)室在多種檢測(cè)方案間靈活切換,,并能實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的快速分析與管理。
其設(shè)計(jì)充分考慮實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性,、重現(xiàn)性與效率,,特別適合于需要批量處理樣本并開(kāi)展大規(guī)模數(shù)據(jù)分析的研究平臺(tái),如:
醫(yī)學(xué)院校教學(xué)實(shí)驗(yàn)室,;
疾控機(jī)構(gòu)的流行病檢測(cè),;
醫(yī)療機(jī)構(gòu)的病原核酸檢測(cè);
藥企或生物技術(shù)公司開(kāi)發(fā)階段的生物標(biāo)志物篩選,。
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