以下是針對(duì) Coriell Institute(科里爾研究所)的人類基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品的推薦,,結(jié)合其特色產(chǎn)品和不同研究需求進(jìn)行分類整理:
一,、 Coriell 核心產(chǎn)品推薦
(1) 正常健康對(duì)照DNA
產(chǎn)品名稱:NA系列標(biāo)準(zhǔn)品(如NA12878,、NA19240等)
全基因組測(cè)序(WGS),、外顯子組測(cè)序(WES)的基準(zhǔn)對(duì)照,。
實(shí)驗(yàn)室間數(shù)據(jù)可比性驗(yàn)證(如GATK最佳實(shí)踐中的標(biāo)準(zhǔn)樣本),。
來自健康供體的淋巴母細(xì)胞系(LCLs),,經(jīng)EB病毒永生化,。
提供高純度、高完整性的DNA(濃度50-100 ng/μL),。
廣泛用于NGS測(cè)序技術(shù)驗(yàn)證(如NIST基因組參考材料),。
(2) 疾病特異性DNA
產(chǎn)品系列:Coriell Biorepository
提供詳細(xì)的臨床表型和基因型數(shù)據(jù)(突變位點(diǎn)、遺傳模式),。
部分樣本含家系配對(duì)(患者+正常親屬),,適合遺傳分析。
遺傳病樣本:如囊性纖維化(CFTR基因突變),、亨廷頓?。?/span>HTT重復(fù)擴(kuò)展)、脊髓性肌weisuo(SMA)等,。
腫瘤相關(guān)樣本:乳腺癌(BRCA1/2突變),、林奇綜合征(錯(cuò)配修復(fù)基因突變)等。
神經(jīng)退行性疾?。喊柎暮D,。?/span>APP/PSEN1突變),、帕金森病(LRRK2突變)等,。
(3) NIST認(rèn)證參考材料
產(chǎn)品名稱:NIST Reference Materials(如GM12878)
與NIST合作開發(fā)的quanwei標(biāo)準(zhǔn)品(如NIST SRM 2372),。
提供已知SNP、Indel,、結(jié)構(gòu)變異等位點(diǎn)的基準(zhǔn)數(shù)據(jù),。
適用于臨床診斷實(shí)驗(yàn)室的合規(guī)性驗(yàn)證(CLIA/CAP認(rèn)證)。
二,、按研究領(lǐng)域推薦
(1) 遺傳病研究
推薦產(chǎn)品:
HD100:亨廷頓?。?/span>CAG重復(fù)擴(kuò)增)患者DNA。
CFTR系列:囊性纖維化相關(guān)突變(如ΔF508純合/雜合),。
用途:基因分型(PCR,、Sanger測(cè)序)、攜帶者篩查方法開發(fā),。
(2) 腫瘤基因組學(xué)
推薦產(chǎn)品:
BRCA1/2突變樣本:如AG06840(BRCA1 c.68_69delAG),、AG07095(BRCA2 c.5946delT)。
腫瘤-正常配對(duì)樣本:部分細(xì)胞系提供癌組織與正常組織的配對(duì)DNA,。
用途:體細(xì)胞突變檢測(cè),、液體活檢技術(shù)驗(yàn)證。
(3) 群體遺傳學(xué)與多樣性
推薦產(chǎn)品:
HapMap項(xiàng)目樣本:如NA10851(歐洲裔),、NA18507(東亞裔),。
1000 Genomes樣本:涵蓋全球多個(gè)人群的基因組DNA。
用途:群體頻率分析,、祖先信息標(biāo)記(AIM)研究,。
三、特色產(chǎn)品
(1) 定制化混合DNA
產(chǎn)品名稱:Custom DNA Mixes
按需混合不同突變型/野生型DNA(如EGFR T790M突變比例梯度),。
模擬腫瘤異質(zhì)性或嵌合體樣本,。
用途:檢測(cè)靈敏度/特異性評(píng)估(如ddPCR的LoD驗(yàn)證)。
(2) FFPE模擬DNA
產(chǎn)品名稱:FFPE-like DNA Standards
通過化學(xué)處理模擬FFPE樣本的DNA片段化與損傷,。
提供不同片段大?。?/span>100-1000 bp)和降解程度的選擇。
用途:腫瘤存檔樣本分析流程的優(yōu)化,。
(3) 無細(xì)胞DNA(cfDNA)標(biāo)準(zhǔn)品
產(chǎn)品名稱:Cell-Free DNA Reference Materials
含已知低頻突變(如1% VAF的KRAS G12D),。
模擬液體活檢中的腫瘤源性DNA。
用途:NGS建庫技術(shù),、液體活檢panel的性能驗(yàn)證,。
四、購買渠道
Coriell標(biāo)準(zhǔn)品代理——天津益元利康生物科技有限公司,,提供NA12878等產(chǎn)品,,歡迎咨詢選購,。
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