以下是血液基因組DNA中提試劑盒更詳細的操作步驟描述,,以常見的基于硅膠膜吸附柱的試劑盒為例:
一,、實驗前準備
- 試劑與耗材
- 檢查試劑盒組分:裂解液(Buffer AL/BL)、洗滌液(Buffer AW1/AW2),、洗脫液(Buffer AE),、蛋白酶K、吸附柱,、收集管等,。
- 自備物品:無水乙醇(如需添加到洗滌液中)、離心機,、移液器,、1.5mL離心管、渦旋振蕩器,、水浴鍋(或金屬浴),。
- 樣本處理
- 使用EDTA抗凝全血,確保樣本未溶血,。若樣本量不足,,可用生理鹽水或PBS稀釋至推薦體積(如200-500μL)。
二,、詳細操作步驟
步驟1:紅細胞裂解(可選,,視試劑盒設計而定)
- 目的:去除紅細胞,保留白細胞核,。
- 操作:
- 將全血樣本轉(zhuǎn)移至15mL離心管,,加入3-5倍體積的紅細胞裂解液(如Buffer EL)。
- 顛倒混勻后,,室溫靜置5-10分鐘,,期間輕彈管底以促進裂解。
- 2000×g離心5分鐘,,棄上清(含裂解的紅細胞),。
- 重復上述步驟直至沉淀呈白色(白細胞團塊)。
步驟2:細胞裂解與DNA釋放
- 目的:裂解白細胞,,釋放基因組DNA,。
- 操作:
- 向白細胞沉淀中加入200μL Buffer AL(含蛋白酶K),渦旋振蕩15秒,。
- 56℃水浴孵育10-30分鐘(或根據(jù)試劑盒要求),,期間每隔5分鐘渦旋一次,。
- 孵育后短暫離心,使管蓋液體回落,。
步驟3:DNA結合至吸附柱
- 目的:將DNA吸附到硅膠膜上,。
- 操作:
- 向裂解液中加入200μL無水乙醇,渦旋混勻(若試劑盒已預加乙醇,,則跳過此步),。
- 將混合液轉(zhuǎn)移至吸附柱(置于2mL收集管中),8000×g離心1分鐘,。
- 棄收集管中廢液,,將吸附柱放回原收集管。
步驟4:洗滌純化DNA
- 目的:去除蛋白質(zhì),、鹽分等雜質(zhì),。
- 操作:
- 向吸附柱中加入500μL Buffer AW1,8000×g離心1分鐘,,棄廢液,。
- 加入500μL Buffer AW2(含乙醇),14000×g離心3分鐘,,去除殘留乙醇,。
- 重復離心一次(空管),確保吸附柱干燥,。
步驟5:DNA洗脫與收集
- 目的:將純化的DNA從吸附柱上洗脫,。
- 操作:
- 將吸附柱轉(zhuǎn)移至新的1.5mL離心管,向膜中央加入100-200μL預熱至65℃的Buffer AE,。
- 室溫靜置5分鐘,,8000×g離心1分鐘。
- 可選擇重復洗脫一次以提高回收率(將洗脫液重新加入吸附柱,,再次離心),。
三、關鍵注意事項
- 溫度控制
- 蛋白酶K裂解步驟需在56℃進行,,溫度過低會導致裂解不完全,。
- 洗脫液預熱至65℃可提高DNA洗脫效率。
- 乙醇添加
- 若洗滌液需自行添加乙醇,,務必使用無水乙醇,,并確保終濃度符合試劑盒要求。
- 離心條件
- 離心速度和時間需嚴格遵循說明書,,避免DNA斷裂或吸附不完全,。
- 避免污染
- 所有操作應在無菌條件下進行,,使用無DNA酶的耗材和移液器吸頭,。
四,、結果評估
- 濃度與純度:使用分光光度計測定DNA濃度(A260)和純度(A260/A280=1.8-2.0)。
- 完整性:通過瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA條帶(主帶應集中于基因組DNA大小區(qū)域),。
五,、常見問題與解決方案
問題 | 可能原因 | 解決方案 |
---|---|---|
DNA濃度低 | 樣本量不足或裂解不完全 | 增加樣本量,延長裂解時間 |
A260/A280比值異常 | 蛋白質(zhì)污染 | 增加洗滌次數(shù),,確保乙醇去除 |
DNA降解 | 操作粗暴或反復凍融 | 輕柔操作,,分裝保存于-20℃ |
通過以上步驟,可高效提取高質(zhì)量基因組DNA,,適用于PCR,、測序、Southern blot等下游實驗,。不同試劑盒的具體操作細節(jié)可能略有差異,,務必參考對應說明書。
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