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如何操作賽默飛熒光定量PCR儀

來源:杭州實了個驗生物科技有限公司   2025年03月24日 22:53  

操作賽默飛熒光定量PCR儀需要按照一系列步驟來配置設(shè)備,、設(shè)置實驗程序,、運(yùn)行實驗和分析數(shù)據(jù),。以下是詳細(xì)的操作步驟和注意事項,,幫助您順利完成實驗,。

一,、準(zhǔn)備工作

在正式操作賽默飛熒光定量PCR儀前,請確保以下準(zhǔn)備工作已完成:

  1. 檢查儀器狀態(tài)

    • 確保儀器已連接電源并啟動,。

    • 檢查熱蓋和樣品架,,確保它們安裝牢固并處于正常工作狀態(tài)。

  2. 檢查反應(yīng)體系

    • 準(zhǔn)備好PCR反應(yīng)體系,,包括模板,、引物、酶,、熒光染料等,。

    • 準(zhǔn)備好所需的樣品(如DNA、RNA模板),,并檢查其濃度,。

  3. 確保計算機(jī)和儀器連接正常

    • 確保儀器與控制計算機(jī)或觸摸屏之間的連接正常,可以順利打開實驗軟件,。

二,、創(chuàng)建實驗程序

  1. 打開儀器

    • 按下設(shè)備的開機(jī)按鈕,啟動儀器,。儀器啟動后,,屏幕會顯示歡迎界面。

    • 如果儀器已配備觸摸屏界面,,直接通過觸摸屏操作,。

  2. 進(jìn)入實驗設(shè)置界面

    • 在儀器軟件的主界面上,選擇“新建實驗”或“新建程序”選項,,以創(chuàng)建新的實驗程序,。

  3. 輸入實驗信息

    • 在創(chuàng)建新實驗時,首先需要輸入實驗名稱,、實驗描述,、樣本信息(如目標(biāo)基因、引物等)等相關(guān)信息,。

    • 選擇PCR類型:通常選擇“熒光定量PCR”,。

    • 選擇引物類型:如果使用SYBR Green,、TaqMan或其他探針,進(jìn)行相應(yīng)選擇,。

  4. 設(shè)置反應(yīng)體系

    • 反應(yīng)體積:根據(jù)實驗需求設(shè)置反應(yīng)體積(常見體積有20 μL,、25 μL、50 μL等),。

    • 樣品信息:輸入樣品類型和濃度信息,。確保樣品濃度與反應(yīng)體系相匹配。

    • 引物/探針選擇:輸入或選擇所使用的引物和探針信息,。確保熒光探針的選擇正確,,并且與所用的熒光染料兼容。

三,、設(shè)置熱循環(huán)條件

  1. 設(shè)置溫度和時間

    • 變性溫度:通常設(shè)置在94-98°C之間,。

    • 退火溫度:根據(jù)引物的Tm值,通常設(shè)置在50-65°C之間,。

    • 擴(kuò)增溫度:一般設(shè)置為72°C(適用于大多數(shù)DNA聚合酶),。

    • 延伸時間:根據(jù)PCR產(chǎn)物的長度設(shè)定,通常設(shè)置為每千堿基15秒,。

  2. 設(shè)置循環(huán)次數(shù)

    • 設(shè)置PCR循環(huán)次數(shù),,通常為40次,但根據(jù)樣品特性可以適當(dāng)調(diào)整,。

  3. 熔解曲線分析(可選):

    • 如果需要進(jìn)行特異性檢測,,可以在最后一步啟用熔解曲線分析。熔解曲線可以幫助檢測PCR產(chǎn)物的特異性,,避免非特異性擴(kuò)增,。

四、選擇熒光檢測通道

  1. 選擇適當(dāng)?shù)臒晒馊玖?/strong>:

    • 如果使用單一染料(如SYBR Green),,選擇對應(yīng)的檢測通道,。

    • 如果使用多種熒光染料(如TaqMan探針),選擇多個通道進(jìn)行多重檢測,。

  2. 設(shè)置熒光信號采集時間點(diǎn)

    • 在每個擴(kuò)增周期的合適位置采集熒光信號,。通常選擇在擴(kuò)增的末期進(jìn)行熒光信號采集。

五,、啟動實驗

  1. 檢查所有設(shè)置

    • 在開始實驗之前,,確保所有設(shè)置無誤,檢查反應(yīng)體系,、溫度條件,、循環(huán)次數(shù)和熒光探針設(shè)置等。

    • 如果一切正常,點(diǎn)擊“開始實驗”按鈕啟動PCR反應(yīng),。

  2. 儀器運(yùn)行

    • 儀器會自動完成熱循環(huán)過程,,同時通過熒光檢測系統(tǒng)監(jiān)測反應(yīng)中的熒光信號變化。

    • 實驗過程可以實時查看圖表,、溫度,、熒光信號等數(shù)據(jù)。

六,、數(shù)據(jù)分析

  1. 實驗完成后查看數(shù)據(jù)

    • 實驗結(jié)束后,,儀器會生成實時定量PCR結(jié)果,包括Ct值,、熒光信號變化曲線等。

    • 點(diǎn)擊“數(shù)據(jù)分析”進(jìn)入數(shù)據(jù)分析界面,,可以選擇查看熒光信號曲線,、標(biāo)準(zhǔn)曲線、Ct值等,。

  2. 數(shù)據(jù)分析選項

    • Ct值分析:根據(jù)熒光信號的變化,,自動計算各樣本的Ct值,并進(jìn)行基因定量,。

    • 標(biāo)準(zhǔn)曲線分析:如果需要定量分析樣本的濃度,,可以通過標(biāo)準(zhǔn)曲線法進(jìn)行分析。

    • 熔解曲線分析:對PCR產(chǎn)物進(jìn)行熔解曲線分析,,檢查擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性,。

  3. 導(dǎo)出數(shù)據(jù)

    • 在數(shù)據(jù)分析完成后,用戶可以將分析結(jié)果導(dǎo)出為Excel,、PDF等格式,,便于進(jìn)一步分析或報告書寫。

七,、實驗結(jié)束后的注意事項

  1. 清潔儀器

    • 每次實驗結(jié)束后,,清理PCR儀的樣品架和反應(yīng)管,防止樣品污染,。

    • 定期清潔儀器表面和熱蓋,,避免熒光信號的干擾。

  2. 保存實驗數(shù)據(jù)

    • 確保保存實驗數(shù)據(jù)和程序設(shè)置,,避免數(shù)據(jù)丟失,。可以將數(shù)據(jù)保存在云端或外部存儲設(shè)備上,。

  3. 檢查儀器運(yùn)行狀態(tài)

    • 定期檢查儀器的運(yùn)行狀況,,包括校準(zhǔn)、溫控系統(tǒng)、熒光檢測系統(tǒng)等,,確保儀器處于最佳工作狀態(tài),。

八、常見問題及解決方法

  1. 信號過低或過高

    • 可能原因:模板濃度不適,、引物濃度不合適,、反應(yīng)體系配制不當(dāng)。

    • 解決方法:適當(dāng)調(diào)整模板濃度和引物濃度,,確保反應(yīng)體系的準(zhǔn)確性,。

  2. 非特異性擴(kuò)增

    • 可能原因:引物設(shè)計問題、退火溫度設(shè)置不當(dāng),。

    • 解決方法:優(yōu)化引物設(shè)計,、調(diào)整退火溫度,確保擴(kuò)增特異性,。

  3. 實驗反應(yīng)失敗

    • 可能原因:反應(yīng)體系準(zhǔn)備不充分或試劑過期,。

    • 解決方法:檢查試劑是否過期,確保所有試劑的新鮮度并準(zhǔn)確配制反應(yīng)體系,。

總結(jié)

操作賽默飛熒光定量PCR儀需要按步驟配置實驗程序,、設(shè)置反應(yīng)體系、選擇合適的熱循環(huán)條件和熒光探針通道,。儀器的智能化設(shè)計使得操作相對簡便,,但仍然需要細(xì)致地檢查設(shè)置和反應(yīng)體系,確保實驗的順利進(jìn)行,。通過合理設(shè)置和分析,,您可以得到高質(zhì)量的定量PCR結(jié)果。


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