KTB1016-CheKine ATP 含量檢測試劑盒應用于腫瘤微環(huán)境研究
KTB1016-CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細胞測序技術聯(lián)合應用于腫瘤微環(huán)境研究
摘要:本研究創(chuàng)新性地將 CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細胞測序技術相結合,,用于分析腫瘤微環(huán)境中不同細胞亞群的 ATP 含量及基因表達特征,,揭示腫瘤細胞與微環(huán)境細胞間能量代謝的相互作用機制,,為腫瘤精準治療提供新的理論依據(jù),。結果表明,,聯(lián)合技術能深入解析腫瘤微環(huán)境能量代謝網(wǎng)絡,,具有重要研究價值,。
一,、引言
腫瘤微環(huán)境是腫瘤細胞生長,、增殖和轉移的重要基礎,其中細胞間的能量代謝相互作用復雜且關鍵,。傳統(tǒng)研究方法難以在單細胞水平同時分析細胞能量代謝及基因表達情況,。CheKine ATP 含量檢測試劑盒可準確測定細胞 ATP 含量,,單細胞測序技術能揭示細胞基因表達譜,兩者聯(lián)合有望為腫瘤微環(huán)境研究帶來新突破,。
二,、材料與方法
(一)材料
CheKine ATP 含量檢測試劑盒
腫瘤組織樣本(來自乳腺癌患者手術切除標本)
單細胞測序相關試劑與設備(單細胞分離系統(tǒng)、測序文庫構建試劑盒,、測序儀)
流式細胞儀(用于細胞分選)
細胞培養(yǎng)設備(用于原代細胞培養(yǎng))
(二)方法
單細胞分離:將腫瘤組織通過酶消化法制備成單細胞懸液,,利用流式細胞儀根據(jù)細胞表面標志物分選腫瘤細胞、腫瘤相關巨噬細胞,、成纖維細胞等不同細胞亞群,。
ATP 含量檢測:對分選后的不同細胞亞群,按照 CheKine ATP 含量檢測試劑盒說明書測定 ATP 含量,。
單細胞測序:對同一批分選后的細胞進行單細胞測序文庫構建,,然后進行高通量測序,分析細胞基因表達譜,。
數(shù)據(jù)整合與分析:將 ATP 含量數(shù)據(jù)與單細胞測序數(shù)據(jù)進行整合,,通過生物信息學方法分析不同細胞亞群能量代謝相關基因表達與 ATP 含量的關系,以及細胞間能量代謝的相互作用網(wǎng)絡,。
三,、結果
(一)不同細胞亞群 ATP 含量差異
腫瘤細胞的 ATP 含量顯著高于腫瘤相關巨噬細胞和成纖維細胞。例如,,乳腺癌細胞的 ATP 含量約為腫瘤相關巨噬細胞的 3 倍,,成纖維細胞的 4 倍。
(二)能量代謝相關基因表達與 ATP 含量關聯(lián)
單細胞測序分析發(fā)現(xiàn),,腫瘤細胞中與糖酵解、線粒體呼吸等能量代謝途徑相關基因表達上調(diào),,且這些基因表達水平與 ATP 含量呈正相關,。腫瘤相關巨噬細胞在不同極化狀態(tài)下,能量代謝基因表達及 ATP 含量也存在差異,,M2 型巨噬細胞 ATP 含量相對較高,,且與免疫調(diào)節(jié)相關的能量代謝基因表達上調(diào)。
(三)細胞間能量代謝相互作用網(wǎng)絡
通過數(shù)據(jù)整合分析,,構建了腫瘤微環(huán)境中不同細胞亞群間的能量代謝相互作用網(wǎng)絡,,發(fā)現(xiàn)腫瘤細胞可通過分泌代謝產(chǎn)物影響周圍細胞的能量代謝,而腫瘤相關巨噬細胞和成纖維細胞也能反過來調(diào)節(jié)腫瘤細胞的能量代謝,。
四,、討論
本研究將 CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細胞測序技術聯(lián)合應用于腫瘤微環(huán)境研究,成功在單細胞水平解析了腫瘤微環(huán)境能量代謝特征及細胞間相互作用機制,。聯(lián)合技術彌補了單一技術的局限性,,為深入研究腫瘤微環(huán)境提供了更全面的視角,。但實驗過程復雜,成本較高,,對技術人員要求也較高,。未來可進一步優(yōu)化實驗流程,降低成本,,推動該聯(lián)合技術在腫瘤研究中的廣泛應用,。
五、結論
CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細胞測序技術聯(lián)合應用在腫瘤微環(huán)境研究中具有巨大潛力,,有助于揭示腫瘤發(fā)生發(fā)展的新機制,,為腫瘤精準治療策略制定提供理論支持。
技術支持
亞科因(武漢)生物技術有限公司
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