實驗?zāi)康摹?/span>
1.掌握用CaCl2法制備感受態(tài)細胞的原理和方法。
2.學(xué)習(xí)和掌握質(zhì)粒DNA的轉(zhuǎn)化和重組質(zhì)粒的篩選方法。
【實驗原理】
質(zhì)粒在不同的細菌之間轉(zhuǎn)移是微生物世界中一種普遍的現(xiàn)象,一個細菌品系通過吸收另一個細菌品系的質(zhì)粒DNA而發(fā)生了遺傳性狀的改變,這種現(xiàn)象叫做轉(zhuǎn)化,,獲得了外源DNA的細胞稱為轉(zhuǎn)化子。
在基因克隆技術(shù)中,所謂轉(zhuǎn)化是指質(zhì)?;蛑亟M質(zhì)粒被導(dǎo)入受體細胞,表達相應(yīng)的選擇標(biāo)記基因,,并在一定的培養(yǎng)條件下,,在選擇性培養(yǎng)基上長出轉(zhuǎn)化子的過程,。
質(zhì)粒必須通過轉(zhuǎn)化進入細菌細胞內(nèi),才能進行擴增和表達,,從而獲得大量的克隆基因,使我們能夠進行進一步的DNA操作,,如亞克隆等;或者獲得其表達產(chǎn)物,。轉(zhuǎn)化效率的高低與受體菌的生理狀態(tài)有關(guān),。細菌吸收外源DNA的能力最高時的狀態(tài)被稱為感受態(tài)細胞(competentcell)。
有些種類的細菌在其生長的任一階段都處于感受態(tài),,而另一些細菌只有處于某個生長時期時(一般為對數(shù)生長早,、中期),才會處于感受態(tài),如本實驗所用的大腸桿菌,。用一定濃度的CaCl2處理對數(shù)生長早中期的細菌可以大大提高細菌吸收周圍環(huán)境中的DNA分子的能力,。
對這種現(xiàn)象的一種解釋是CaCl2能使細菌細胞壁的通透性增強,從而提高轉(zhuǎn)化率,。這種轉(zhuǎn)化方法稱為“化學(xué)法”,。目前還可以使用電激的方法,通過瞬間的高壓電流,,在細胞上形成孔洞,,使外源DNA進入胞內(nèi),從而實現(xiàn)細胞的轉(zhuǎn)化,。
電激轉(zhuǎn)化的效率往往比化學(xué)法高出1到2個數(shù)量級,,達到1X108轉(zhuǎn)化子/μgDNA,甚至1X109轉(zhuǎn)化子/μgDNA,,所以常用于文庫構(gòu)建時的轉(zhuǎn)化或遺傳篩選,。
微生物轉(zhuǎn)化是基因工程的常用技術(shù),大腸桿菌是基因工程中常用的受體菌,,本實驗即是用前面實驗獲得的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌細胞,。
【試劑與器材】
〈一〉試劑
1.LB液體培養(yǎng)基:參見附錄
每組配200mL,其中100mL分裝于500mL三角瓶中,另各取3mL裝于2只大試管中,,其余裝于裝于500mL三角瓶中,,121℃高壓蒸汽滅菌20分鐘。
2.LB/Amp/IPTG/X-Gal平板(1):
配1LLB液體培養(yǎng)基,,加入20g瓊脂粉和1支攪拌棒,,同上高壓滅菌,趁熱取出置攪拌器上冷卻,,待冷至55℃左右,加氨芐青霉素(Ampicillin)至終濃度100μg/ml(Amp儲存液一般為100mg/mL),倒平板,,每皿倒約15mL,室溫放置過夜至冷凝水揮發(fā)干凈,。使用前半小時在培養(yǎng)基表面加20μL50mg/mLX-gal和100μL0.1mol/LIPTG,,涂勻,,待這兩種化合物滲入瓊脂后,即可用于轉(zhuǎn)化菌的涂布,。
每組制備LB平板2個,,LB/Amp平板5個,LB/Amp/IPTG/X-Gal平板6個,。
3.IPTG儲存液(0.1mol/L):1.2gIPTG加水至50ml,,過濾除菌,4℃儲存,。
4.X-gal儲存液:50mg/ml溶于二甲基甲酰胺溶劑中,,過濾除菌,4℃儲存,。
5.1mol/LCaCl2儲存液,,使用濃度為0.1mol/L,CaCl2應(yīng)使用分析純,,配100mL,,高壓滅菌,全班用,。
6.甘油(滅菌),,全班50mL,同上高壓滅菌,。
7.酸洗無菌玻璃珠,涂布平板用,,用50mL三角瓶分裝,,同上高壓滅菌,烘干備用,。
〈二〉器材
1.37℃溫箱,、水浴鍋、恒溫振蕩器等
2.高速冷凍離心機
3.微量移液器等
〈三〉菌株
大腸桿菌DH5α
【操作方法】
1,、感受態(tài)細胞的制備(無菌操作)
1)從新鮮培養(yǎng)的LB平板上挑單個DH5α大菌落接種到3mLLB培養(yǎng)液中(2),,37℃劇烈振蕩(210-240r/min)培養(yǎng)過夜(3)。
2)取1mL過夜培養(yǎng)物,接種到含100mLLB培養(yǎng)液的500mL錐瓶中,,37℃劇烈振蕩,,直至培養(yǎng)液中細菌濃度達到OD600為0.375-0.4(4)
3)培養(yǎng)物轉(zhuǎn)入2只50mL離心管中,冰上放置10分鐘,,4,000r/min,4℃離心15分鐘,,棄上清(5)。
4)將菌體懸浮于10~20mL預(yù)冷的0.1mol/LCaCl2溶液中,冰上放置20分鐘(6),。
5)4,000rpm,4℃,離心10分鐘,,棄上清,,然后將細菌輕輕懸浮在2ml0.1mol/LCaCl2溶液中(7)。若不立即進行轉(zhuǎn)化實驗,,則進行第6步操作,,反之,則進入轉(zhuǎn)化操作,。
6)緩慢滴入甘油(滅菌)至終濃度為15%,輕柔混勻,,將細菌分裝成0.5ml/每管,立即液氮冷凍,,轉(zhuǎn)入-70℃冰箱儲存,,可在2個月內(nèi)使用(8)。
2,、感受態(tài)細胞的轉(zhuǎn)化
1)設(shè)計好實驗項目,,如正、負對照(參考如下表格,,按表格內(nèi)容操作),;
2)從-80℃冰箱中取出分裝成0.5mL/每管的感受態(tài)細胞,置冰上5分鐘或緩慢流水淋至剛好解凍(10),立即分裝到預(yù)冷的1.5mL離心管中,,每管體積參見上表,,插入冰上待用;
3)對轉(zhuǎn)化管,,加入連接產(chǎn)物DNA溶液,,輕輕混勻;為保險起見,,也可先加入一半的連接產(chǎn)物DNA溶液,,輕輕混勻,剩下的一半置-20℃冰箱保存,;
4)冰上放置30分鐘(11),;
5)放入42℃水浴中,熱激40秒(12),;
6)迅速插入冰上,,放置5分鐘;
7)對第1,、2項,,加入500μLLB培養(yǎng)基,其余加入250μLLB培養(yǎng)基,37℃震蕩培養(yǎng)1小時(13),;
8)對第1項,,各取200μL直接用玻璃珠涂布于2個LB/Amp/IPTG/X-Gal平板上;對第2項,分別取3,、30和100μL細菌培養(yǎng)液,,各加無菌水至150μL(不超過200μL)涂LB/Amp/IPTG/X-Gal平板(此步驟的目的是計算轉(zhuǎn)化率);對其余各項,,分別各取一半涂布于LB/Amp平板上,,余下的轉(zhuǎn)化液置4℃冰箱保存(14)。倒置平板,,37℃培養(yǎng)12-14小時,。一般來說,含有活性半乳糖苷酶的細菌比無活性酶的細菌生長慢,,故過夜培養(yǎng)后可見到毫米大小的陽性白色菌落而陰性的蘭色菌落只有針尖大?。?5)。
9)挑取白色菌落進行鑒定(見下一個實驗),。
【注意事項與提示】
(1)倒平板時應(yīng)避免培養(yǎng)基溫度過高,,若溫度過高,則加入的氨芐青霉素會失效,,且培養(yǎng)基凝固后表面及皿蓋會形成大量冷凝水,,易于造成污染及影響單菌落的形成。若用手掌感受培養(yǎng)基覺得很燙但尚可忍受時,,培養(yǎng)基溫度即為55℃左右,。制備好的LB/Amp平板可于4℃冰箱儲存2個月,時間過長氨芐青霉素將會失效,。加了IPTG/X-Gal的LB/Amp平板最好現(xiàn)用,。
(2)DH5α在平板上過夜生長后,可置冰箱中保存一個月左右,;接種新鮮的菌落或菌液有利于細菌細胞的同步快速生長,,從而使細菌群體在達到一定的OD值后(0.375)大部分細胞都處于感受態(tài)。
(3)DH5α的生長需要氧氣,,劇烈振蕩的目的是提高培養(yǎng)基的溶氧量以利于細菌的生長
(4)達到細菌對數(shù)生長早,、中期,,需時約2.0~2.5小時,,此步驟至為關(guān)鍵,若超過此階段,,則轉(zhuǎn)化效率急劇下降,。
(5)低溫操作的目的是使細胞不再生長,保持其感受態(tài),。
(6)此步驟的目的是洗滌細胞,。
(7)此時細胞較脆,懸浮時動作要輕,,可用移液槍輕輕吸打,。
(8)-70℃冰箱儲存的感受態(tài)細胞在6-8周后,,轉(zhuǎn)化率很快降低??捎靡灰阎獦?biāo)準(zhǔn)及濃度的閉環(huán)質(zhì)粒如pUC18/19鑒定感受態(tài)細胞的轉(zhuǎn)化能力,。
(9)實驗中一定要設(shè)計正負對照,如用無DNA轉(zhuǎn)化物的感受態(tài)細菌鋪板,,若有菌落生長,,說明其中抗生素濃度不夠或感受態(tài)細胞已被污染。加樣時速度要快,,但要有條不紊,,切勿加錯!加完樣用槍尖稍攪勻,。第1項中所加連接產(chǎn)物的量可根據(jù)連接反應(yīng)的終體積而定,,一般加一半或2/3,其余置-20℃保存,。
(10)從-80℃冰箱中取出冷凍的指管后,,也可用雙手搓指管,利用掌心的溫度解凍,。解凍時間勿過長,。
(11)至少30min,可延長至1h左右,。
(12)掌握時間,,過長會致死細胞。在許多實驗方案中,,熱激時間設(shè)為90至120秒,,目前已有實驗證明如此長的熱激時間是沒有必要的,且會引起轉(zhuǎn)化效率的下降,。熱激前加入相當(dāng)于轉(zhuǎn)化液體積1/10的DMSO可提高轉(zhuǎn)化效率10倍左右,,加入DMSO后請勿再劇烈振蕩。
(13)此步驟使得細菌恢復(fù)正常并讓β-內(nèi)酰氨酶基因表達,。
(14)此步驟可在實驗出現(xiàn)錯誤后進行補救,。
(15)培養(yǎng)時間勿過長,以免衛(wèi)星菌落的出現(xiàn),。很多因素都可以影響轉(zhuǎn)化的效率,,特別需要注意的有兩點,一是制備感受態(tài)細胞時的OD值,,二是所用試劑要分析純以上,,并用雙蒸水或超純水(如MiliQ)配制。
【實驗安排】
實驗前兩天挑E.coli菌種在LB平板上劃線,37℃培養(yǎng)過夜,。實驗前一天各組要將試劑準(zhǔn)備好,,包括培養(yǎng)基的消毒滅菌。下午臨下課時從平板上挑新鮮的單菌落接種到3mL液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)過夜,。轉(zhuǎn)化完畢,,次日一早觀察記錄結(jié)果,并清理余下的菌種試劑等,。
【實驗報告要求與思考題】
1.制備感受態(tài)細胞和轉(zhuǎn)化時,,應(yīng)特別注意哪些環(huán)節(jié)。
2.轉(zhuǎn)化效率的計算:轉(zhuǎn)化效率是指每微克質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)化細胞產(chǎn)生的轉(zhuǎn)化子數(shù)目,,請列表表示你的轉(zhuǎn)化結(jié)果并算出轉(zhuǎn)化率(列出計算公式),。你所做實驗的轉(zhuǎn)化效率(正對照)是多少?如果過低(如低于104cfu/μgDNA),,請分析可能的原因,。需要注意的是,連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化效率是非常低的,,為什么,?
3.若實驗出現(xiàn)不正常的結(jié)果,請分析原因,。
附錄:大腸桿菌的高效轉(zhuǎn)化方法
一,、試劑
TB溶液:1.512gPIPES,1.1025gCaCl2,,9.31875gKCl,,溶于水,以5NKOH調(diào)pH6.7,,再加入5.44225gMnCl2,,定容至500ml,0.22?m濾膜過濾滅菌,,4℃保存,。
SOB培養(yǎng)基:Tryptone20g(OXOID公司);Yeastextract5g(OXOID公司),;NaCl0.5g,,加800ml雙蒸水,加入250mmol/LKCl溶液10ml,,用10mol/LNaOH調(diào)pH至7.0,,定容至1,000ml,,高壓滅菌,,4℃保存;使用前加入5ml經(jīng)高壓滅菌的2mol/LMgCl2溶液。
SOC培養(yǎng)基:含20mmol/L葡萄糖的SOB培養(yǎng)基,,SOB培養(yǎng)基高壓滅菌后,,降溫至60℃或以下時,加入20ml經(jīng)過濾除菌的1mmol/L葡萄糖溶液,,4℃保存,。
DMSO
二、方法
(一)感受態(tài)細胞的制備
1.將E.coliDH5α,,涂布于LB(A-)培養(yǎng)基上,,37℃過夜。
2.挑取2-3個直徑2-3mm的大菌落,,接種到50mlSOB培養(yǎng)基中,。在250ml三角瓶中18℃,200-250rpm振蕩培養(yǎng),,直到OD=0.6,,約需要36-48hr。
3.將三角瓶冰浴10分鐘,。
4.轉(zhuǎn)移菌液到50ml離心管,。2,500g,10min,,4℃,。
5.菌體用16ml冰預(yù)冷的TB溶液懸浮,冰浴10min,。
6.2,500g,,10min,4℃,。
7.菌體用4ml冰預(yù)冷的TB溶液懸浮,,加入280ulDMSO。
8.菌液于冰浴10分鐘后分裝到凍存管,。每管200ul,。液氮冷卻,保存于液氮中,。大月0分鐘后,,轉(zhuǎn)移到-40℃冰箱保存。
(二)轉(zhuǎn)化
1.將LB抗性平板,,SOC培養(yǎng)基,,于37℃預(yù)熱。
2.室溫溶解感受態(tài)細胞,。
3.取200uL菌液加入1.5mL離心管中,,放于冰中,。
4.加入1-5uL質(zhì)粒溶液,用槍頭混勻,,冰浴30min,。
5.42℃熱激30秒,冰浴,。
6.加入800uLSOC培養(yǎng)基,,37℃,250r/min,,1hr,。
7.涂布LB抗性平板,37℃過夜,。
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