PCR產(chǎn)物一般都含有過量的引物,、 Taq DNA酶及dNTP,,這些成分的存在將直接影響到后續(xù)的酶切,、雙脫氧PCR測序反應(yīng)等過程,因此有必要除去。目前核酸純化的方法有很多,商用化試劑盒的出現(xiàn)使得DNA的純化過程變得更加簡便快捷,。PCR擴(kuò)增完成后需要進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測,,在條帶單一無其他雜帶的情況下,可以直接對產(chǎn)物進(jìn)行純化,,常見的純化方法有:
一,、產(chǎn)物直接純化:
1、硅膠層析柱法
原理:大多數(shù)離心柱中吸附DNA的是一層硅膠膜,,實際上就是一層玻璃纖維,,其表面有大量修飾的硅羥基(Si-OH),硅羥基在溶液中解離后帶負(fù)電,,然后與帶正電鹽離子,、帶負(fù)電DNA形成電橋,從而吸附住DNA,,使得DNA雙鏈變單鏈,,不會被生物大分子溶劑洗脫,但能經(jīng)水溶性緩沖液水化后,,被定量回收,,從而實現(xiàn)純化分離。
圖1 硅膠層析原理示意圖
2,、磁珠法(abs60151)
原理:磁珠是有磁性的能吸附DNA的物質(zhì),,其內(nèi)部核心是鐵離子,在磁場作用下可以吸附在磁體上,。在核心外,,經(jīng)過羧化,,帶有羧基基團(tuán),在特定的離子條件下,,可以與DNA結(jié)合,。結(jié)合后,在外磁場的作用下,,磁珠與DNA結(jié)合體移動到磁體周圍,,可以很方便去除其他多余的液體,這時,,不能與磁珠結(jié)合的所有雜質(zhì)都隨水溶液一并去除,。然后,在洗脫條件下,,DNA與磁珠分離,,溶解在水中,將溶解有DNA的溶液轉(zhuǎn)移,,就得到了純化后的DNA樣本,。
圖2 磁珠法結(jié)構(gòu)示意圖
3、其他純化方法
①滲透液結(jié)合醇沉純化
原理:利用分子大小不同,,小分子的物質(zhì)能夠通過滲透膜溶解到大量的溶液中去,,而大分子的物質(zhì)不能通過滲透膜,所以繼續(xù)留存在透析袋中,,通過乙醇沉淀最后達(dá)到去除小分子物質(zhì),,得到純化的有機(jī)大分子的效果。
②直接沉淀純化
原理:DNA分子在高鹽離子醇溶液中會被沉淀出來,,而其他物質(zhì)繼續(xù)溶液在溶液中,,沉淀出來的DNA分子經(jīng)過離心與溶液成分分開,達(dá)到純化的目的,。
不同純化方法對比:
二,、其它,凝膠回收純化:
如電泳檢測結(jié)果存在非特異性條帶,,則需要將目的條帶切出來,,再用膠回收試劑盒(abs60098)對凝膠進(jìn)行回收純化,相較于直接純化,,只是多了一步溶膠的過程,,相應(yīng)的產(chǎn)物純度提高,回收率則下降,。
結(jié)語:
在PCR擴(kuò)增完成后,,反應(yīng)體系中除了DNA片段,還存在離子,、dNTP,、引物及聚合酶等物質(zhì),,這些物質(zhì)會影響后續(xù)克隆測序等實驗,因此對其產(chǎn)物進(jìn)行純化是必要步驟,,不同的純化手段各有自己的優(yōu)缺點,,可以根據(jù)自己的需求選擇適合自己的方法。
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