安捷倫 Cary 60 紫外-可見分光光度計(jì)測定 4°C下微量 DNA 的純度
安捷倫 Cary 60 紫外-可見分光光度計(jì)配 置微光纖 探頭測定 4 °C 下微量 DNA 的 純度
應(yīng)用摘要 醫(yī)藥/生物技術(shù) |
總結(jié) |
安捷倫 Cary 60 紫外-可見分光光度計(jì)是在儲存環(huán)境(如冰箱)下直接測定微量生 |
物樣品的理想儀器,。本應(yīng)用報(bào)告展示了如何使用 Cary 60 及其微光纖探頭附件測 定 4 °C 下 的 DNA 純度——結(jié)果表明,,使用該儀器能夠大幅節(jié)省時間和成本,,同 時數(shù)據(jù)精確度和重現(xiàn)性毫無損 失。 |
• 不再需要比色皿 |
• 直接測定 4 °C 冰箱中的樣品 • 節(jié)省每次分析的時間與成本 前言 多年以來,,紫外-可見分光光度計(jì)一直是生物技術(shù)領(lǐng)域中測定 DNA 純度和濃度的 一項(xiàng)重要工具。該 方法最早由 Warburg 和 Christian 在 1942 年開發(fā) 1,,隨后由 Sambrook 等人在 1989 年進(jìn)行了 優(yōu)化,,使其可用于實(shí)驗(yàn)室中簡便、快速的測定 2,。 分光光度法的主要優(yōu)點(diǎn)在于測定過程: 1) 簡便,; 2) 準(zhǔn)確; 3) 不破壞樣品,。這一 方法可以節(jié)省時間而不損失數(shù)據(jù)質(zhì)量,,并且在測定過程中無需使用大 體積的樣 品或額外的耗材,從而帶來經(jīng)濟(jì)效益,。 |
在之前的文章中,,我們介紹了安捷倫 Cary 50 紫外-可見分 光光度計(jì)配置 Hellma(德國 Hellma GmbH & Co.)的 Traycell 微量比色
池紫外-可見在室溫下準(zhǔn)確、可重現(xiàn)地測 定微量 DNA 的方法 3,。在本研究中,,我們采用帶光纖探頭的 Cary 60 紫外-可見分光光度計(jì)進(jìn)
行了方法擴(kuò)展研究,在 4 ,。C 以及普通實(shí)驗(yàn)室環(huán)境光照條件下測定了小體積樣品,。本方 法使得用戶可以將儀器靠近樣品,而不是像傳
統(tǒng)光譜方法 那樣將樣品放入儀器中,,從而能夠在很短的時間內(nèi)完成分 析,。Cary 60 的光學(xué)設(shè)計(jì)使這一優(yōu)勢得以實(shí)現(xiàn),,它主要憑 借
其的高強(qiáng)度閃爍氙燈以及最新型的電子器件,,使系 統(tǒng)能夠有效地監(jiān)控吸光度的微小變化而不受環(huán)境背景光的 任何影響。本文深入
討論了這一方法的主要優(yōu)點(diǎn),。
儀器與材料
部件號 | 說明 |
G6860AA
7910035600 G6866A 6610000800 D-4764(Sigma 化學(xué)公司) | Cary 60 紫外-可見分光光度計(jì),,配備 WinUV 軟件和 HP 電腦(臺式機(jī)) 微光纖探頭 光纖探頭耦合器 石英比色皿(光程 1 cm;兩只裝) 小牛胸腺 DNA,;1 |
方法與結(jié)果
將小牛胸腺 DNA 用純凈水(MilliQ)稀釋得到不同濃度的樣 品,,濃度范圍 0–50 µg/ml,。
配有光纖耦合器以及微探頭的 Cary 60, 如圖 1 所示。在 Eppendorf 管中加入 150 µL 純凈水(MilliQ),,將其讀數(shù)作為 空白,。
由于分子生物學(xué)試劑通常保存于冷藏條件下,因此所有樣 品直接從 4 ,。C 冰箱中取出并進(jìn)行分析,。
圖 1. 配有光纖附件的 Cary 60 測試 4 。C 下 Eppendorf 管中 150 μL DNA 的示意 圖,。
開始時,,使用 WinUV 軟件“掃描”模塊在 340 到 240 nm 范 圍進(jìn)行掃描以確認(rèn)最大吸收峰以及所購買的按 50:50 稀釋 的 DNA 樣品的可靠性(圖 2)。
波長(nm) |
圖 2. 對 4 ,。C 下兩個濃度的 150 µL DNA 樣品的掃描表明特征吸收峰出現(xiàn)在 260 nm 處,。注意:50 µg/ml DNA 最大吸光度值 1.0Abs,25 µg/ml DNA 最大吸光度 值 0.5Abs,,遵守 Beer Lambert 定律(A = εcl),。
為 了 確 認(rèn) DNA 的 純 度 ,使 用 WinUV 軟 件 專 門 的 “RNA/DNA”模塊測定 260/280 比率,,該模塊可自動計(jì)算 DNA 樣品的純
度,。如圖3 所示,這一模塊使用非常簡單,,可 以在一分鐘內(nèi)完成分析,。
圖 3. 簡便、專用的 Cary WinUV 自動計(jì)算 DNA 的純度,、可靠性和濃度
最后,,繪制濃度曲線以評估同一實(shí)驗(yàn)室條件下不同濃度 DNA 樣品讀數(shù)的線性和重現(xiàn)性(圖4)。在兩個 DNA 樣品讀 數(shù)間隙使
用 MilliQ 純凈水清洗微探頭,。
討論
測定五個樣品所用的時間不到兩分鐘,。傳統(tǒng)方法使用微量 比色皿,需要等待樣品加熱至室溫,,而且在每兩次測定間 需要清洗微量比色
皿,。總之,,使用 Cary 60 光纖系統(tǒng)可以顯 著降低大約 80% 的分析時間,,同時采用光纖技術(shù)不易受到 樣品處理引起的潛在污染。使用微
探頭可以獲得高精度的 數(shù)據(jù)并大大縮短測定低溫樣品所需的時間,,這表明 Cary 60 是一種適于測定生物樣品(如 DNA)的簡便,、快速且
高性價(jià) 比的系統(tǒng)。本方法可以輕松地直接擴(kuò)展到其它樣品類型,, 例如可在 280 nm 處測定蛋白質(zhì),。
結(jié)論
Cary 60 紫外-可見分光光度計(jì)是使用光纖采樣的理想儀器,, 它的高強(qiáng)度閃爍氙燈可以提供的靈敏度和重現(xiàn)性。 本應(yīng)用報(bào)告所展示的測
定 DNA 樣品時的分析速度,、結(jié)果重 現(xiàn)性以及易用性證明了該儀器系統(tǒng)的強(qiáng)大優(yōu)勢,。
使用帶光纖的 Cary 60 分析生物樣品還具有如下優(yōu)點(diǎn):
• 可以直接測定高溫或低溫樣品(4 °C – 110 °C)而無需 考慮冷凝的問題,如果使用比色皿則由于冷凝可能導(dǎo) 致結(jié)果不正確或重現(xiàn)性不好
• 樣品體積不受限制,,可以低至 40 µL,,也可以無限大
• 無需購買昂貴的石英微量比色皿,更節(jié)省了清洗比色 皿的時間
• 使用反射探頭還可以分析固體,、粉末或凝膠類樣品
圖 4. 使用微探頭光纖附件在實(shí)驗(yàn)室常規(guī)光照條件下測定 4 °C 下 Eppendorf 管中 50 µL DNA 樣品(0–
50 µg/mL)得到的濃度曲線,。校準(zhǔn)方程:Abs = 0.02393*濃 度;相關(guān)系數(shù) = 0.99126,。
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