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抗體特異性及交叉反應(yīng)分析

來源:上海邦景實業(yè)有限公司   2024年12月24日 14:22  

       抗體(antibody,,Ab)是機體在體內(nèi)存在的外來分子,、微生物等抗原物質(zhì)刺激下,由B淋巴細胞或記憶細胞增殖分化成的漿細胞所產(chǎn)生的,、可與相應(yīng)抗原發(fā)生特異性結(jié)合的免疫球蛋白(immunoglobulins,,Ig),主要分布在血清中,,也分布于組織液及外分泌液中??贵w特異性鑒定是免疫化學(xué)技術(shù)中,,確保抗原-抗體反應(yīng)專一性的基礎(chǔ),。從根本上驗證特異性,,投稿國際期刊,常常需要準(zhǔn)備這方面數(shù)據(jù),。

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       鑒定抗體的特異性有四種基本方法:分子遺傳法,、獨立抗體驗證法、正交法和標(biāo)簽蛋白法,。四種方法并非必須同時采用,。通常,根據(jù)實驗的目的和研究設(shè)計的特點,,選擇對自己的實驗來說具有說服力的1到2種即可,。

1、分子遺傳法,。

對于遺傳編碼清楚的蛋白質(zhì),,可采用分子遺傳學(xué)技術(shù)(基因敲除模型、CRISPR-Cas9,、RNA干擾等)將該蛋白的表達水平顯著降低,,然后用待檢抗體進行標(biāo)記。如果得到陽性減弱或消失的結(jié)果,,說明抗體標(biāo)記的正是該蛋白質(zhì),。采用該方法要注意兩個問題。其一,,針對基因的敲除或敲減操作不一定能馬上減少相應(yīng)的蛋白質(zhì)水平,。有的蛋白質(zhì)在生物樣本中可能有足量儲備,,存在“緩沖池";必須耗去這部分存量才能觀察到表達的下降,。能否在允許的時間內(nèi)下調(diào)蛋白水平,,是一個需要預(yù)試的問題。其二,,基因及相應(yīng)的蛋白質(zhì)水平下調(diào)后,,抗體標(biāo)記強度減弱,其實驗證了抗體和該基因產(chǎn)物的“相關(guān)性",,但嚴(yán)格說來,,還有可能標(biāo)記的并不是目標(biāo)蛋白質(zhì)。尚存在這樣的可能:抗體標(biāo)記的蛋白質(zhì)是與目標(biāo)蛋白有密切相互作用的另一種蛋白,。比如,,目標(biāo)蛋白減少后,抗體實際標(biāo)記的蛋白無從錨定(比如膜蛋白),,進而在標(biāo)本處理過程中流失,,結(jié)果免疫標(biāo)記強度減弱。此時應(yīng)設(shè)計針對性的實驗來補充驗證,。


2,、獨立抗體驗證法。

同一目標(biāo)分子,,可采用針對不同抗原決定簇的抗體來標(biāo)記,。當(dāng)需要對某種蛋白分子進行免疫標(biāo)記時,如果手中已有經(jīng)過特異性鑒定合格的其他抗體,,且識別的結(jié)構(gòu)位點與待檢抗體不同,,那么原有抗體就可作為一個良好的陽性參照。如果待檢抗體與原有的合格抗體具有相同的標(biāo)記結(jié)果,,說明待檢抗體的特異性是合格的,。本法應(yīng)用時須注意蛋白分子亞型之間的區(qū)別。比如,,待檢抗體與原有合格抗體的識別位點在有的亞型二者都存在,,而有的亞型則可能缺少其中之一。結(jié)構(gòu)變化可能引起功能和分布的差別,,此時本法就不能起到鑒定作用,。


3、正交法,。

正交法即采用互不影響的技術(shù)對抗體標(biāo)記的是否為目標(biāo)分子進行鑒定的方法,。比如要鑒定抗體是否能特異性標(biāo)記某蛋白質(zhì),可通過質(zhì)譜技術(shù),、色譜分離技術(shù),、針對生成該蛋白的RNA的原位雜交等,,與抗體標(biāo)記一道進行平行實驗。如果不同技術(shù)的檢測豐度/強度一致,,說明抗體的標(biāo)記具有特異性,。采用該法時須注意各種技術(shù)自身的非特異性問題,避免因參照技術(shù)本身的特異性缺陷而減弱鑒定結(jié)果的說服力,。


4,、標(biāo)簽蛋白法。

可采用FLAG,、V5等親和標(biāo)簽或GFP等熒光偶聯(lián)蛋白對待檢抗體進行鑒定,。如果抗親和標(biāo)簽的抗體標(biāo)記強度或熒光信號強度與待檢抗體的標(biāo)記強度一致,則說明待檢抗體具有特異性,。


特異性的選擇主要需要考慮四個方面:蛋白特異性,、種屬特異性、實驗方法特異性,、標(biāo)記物的特異性,。

1、蛋白特異性

針對需要檢測的蛋白查找抗體,,幾個細節(jié)要區(qū)分:

a.重組蛋白如果不是全長表達,則需要注意抗體的免疫原區(qū)域是否在重組蛋白區(qū)域內(nèi),。

b.內(nèi)源性蛋白最好能清楚其剪切與修飾的方式,,特殊表型的蛋白需要進行序列比對,并結(jié)合抗體免疫原序列,,查看交叉反應(yīng)的情況,。

c.磷酸化蛋白檢測需要確定具體位點,不同位點的磷酸化意味著可能有不同的機制存在,,不宜一概而論,。


2、種屬特異性

同種蛋白不同物種,,有著或大或小的差異,。

a.目前大部分商品化抗體都是以人源蛋白序列為模板重組蛋白或設(shè)計多肽抗原的,根據(jù)蛋白的同源性的情況與其他種屬發(fā)生交叉反應(yīng),。需要參照說明書注明的可反應(yīng)種屬信息,。

b.一些稀有種屬很難找到抗體,可以通過蛋白的序列比對,,選擇同源序列免疫的抗體,,不過一般這種情況生產(chǎn)商不會受理其關(guān)于質(zhì)量的申訴,如果可以申請到免費的抗體樣品,,則利于抗體選擇,。


3,、實驗方法特異性

目前使用抗體的實驗方法有很多,不同的使用方法過程中,,因為對蛋白樣品的處理方式不一樣,,蛋白的含量有差異,對抗體的識別表位和效價要求都是不一樣的,。


4,、標(biāo)記物的特異性

一般基于實驗操作的實驗方法不會使用帶有標(biāo)記的一抗,比如 WB,、IHC 等,,都是通過二抗類的試劑標(biāo)記達到結(jié)果呈現(xiàn)的目的。但是基于儀器分析的一些實驗,,可能就會使用到直接標(biāo)記的一抗,,比如流式實驗。那么需要了解到自己將要使用的儀器能檢測到的熒光范圍,,針對不通的參數(shù)要求選擇對應(yīng)的標(biāo)記物,。在免疫熒光雙標(biāo)實驗中,需要選配不同的熒光標(biāo)記物,。

        抗體能特異性地識別相應(yīng)的抗原,,并與之結(jié)合。這種結(jié)合在體外也能發(fā)生,,這種特性就是許多免疫檢測方法的基礎(chǔ),。抗原與抗體相互作用是非共價的,,可逆的,,其特性符合許多化學(xué)反應(yīng)的基本原理。但因為抗體分子的結(jié)構(gòu)特點,,以及抗原分子結(jié)構(gòu)的多樣性,,使抗原抗體結(jié)合反應(yīng)表現(xiàn)出復(fù)雜性 。


  抗體特異性與交叉反應(yīng):抗體是特異的,。只與相應(yīng)抗原反應(yīng),。實際制備的抗體卻常有非特異性反應(yīng),這是因為抗原不純造成的,。多組分抗原之間存在共同的抗原決定簇,,或者兩個抗原決定簇結(jié)構(gòu)類似能與同一抗體結(jié)合,均可出現(xiàn)抗體與異源抗原的交叉反應(yīng),。用瓊脂雙擴散能簡便直觀地反映不同抗原與同一抗血清,,或不同抗血清與同一抗原的交叉反應(yīng)。抗體反應(yīng)的交叉反應(yīng)指抗體除與其相應(yīng)的抗原發(fā)生特異性反應(yīng)外還與其它抗原發(fā)生反應(yīng)。產(chǎn)生的原因有以下幾個方面:

  1. 抗原特異性指用于免疫動物的抗原性物質(zhì)中含有多種抗原分子,,它引起動物產(chǎn)生針對多種抗原分子特異性的相應(yīng)抗體,。任何其它物質(zhì)只要含有一種或多種與上述物質(zhì)相同的抗原分子,必將與上述多特異性的抗血清發(fā)生交叉反應(yīng),。

  2. 共同決定簇即兩種抗原分子中都含有相同的抗原決定簇,。

  3. 決定簇相似,兩種不同的抗原決定簇,,如果結(jié)構(gòu)大致相同,,由于空間構(gòu)象關(guān)系,某一決定簇的相應(yīng)抗體可以與大致相同的決定簇發(fā)生交叉反應(yīng),。當(dāng)然抗原一抗體之間構(gòu)象相似時的結(jié)合力小于吻合時的結(jié)合力,。



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