一,、原理
PCR技術(shù)的本質(zhì)是體外核酸擴(kuò)增,加熱使雙鏈DNA解開螺旋,,在退火溫度條件下引物同模板DNA雜交,,在Taq DNA聚合酶,dNTPs,,Mg2+和合適pH緩沖液存在條件下延伸引物,,重復(fù) “變性→退火→引物延伸”過程至25~40個循環(huán),呈指數(shù)級擴(kuò)大待測樣本中的核酸拷貝數(shù),。
二,、分類
1. 普通的PCR儀
一次PCR擴(kuò)增只能運行一個特定退火溫度的PCR儀,又叫傳統(tǒng)的PCR儀,。
用途:主要是做一些簡單的,、對單一退火溫度的目的基因進(jìn)行擴(kuò)增。
?。?)梯度PCR儀: 一次PCR擴(kuò)增可以設(shè)置一系列不同的退火溫度條件(溫度梯度),,通常為12種溫度梯度的普通PCR儀。
用途:研究未知DNA退火溫度的擴(kuò)增,。
?。?)原位PCR:將具有細(xì)胞定位能力的原位雜交技術(shù)運用于從細(xì)胞內(nèi)靶DNA的定位分析,在細(xì)胞內(nèi)實現(xiàn)基因擴(kuò)增的普通PCR儀,。
用途:用于在細(xì)胞的靶DNA所在位置上進(jìn)行基因擴(kuò)增,。
2. 實時熒光定量PCR儀
PCR擴(kuò)增時加入的引物利用熒光素進(jìn)行標(biāo)記,,使引物和熒光探針同時與模板進(jìn)行特異性結(jié)合,擴(kuò)增結(jié)果通過熒光信號采集系統(tǒng)實時采集信號并輸送到計算機(jī)分析處理系統(tǒng),,實時輸出量化結(jié)果,,這樣的PCR儀叫實時熒光定量PCR儀。
?。?)金屬板式實時定量PCR儀
可作為普通PCR儀使用
可帶梯度功能
可容納的樣本量大,,無需特殊耗材
溫度均一性欠佳,有邊緣效應(yīng),,標(biāo)準(zhǔn)曲線的反應(yīng)條件難以做到與樣品全一致
?。?)離心式實時定量PCR儀
溫度均一性較好
使用的是同一個激發(fā)光源和檢測器,隨時檢測旋轉(zhuǎn)到跟前的樣品,,有效減少系統(tǒng)誤差
可容納樣品量少,,有的需用特殊毛細(xì)管作樣品管,增加了使用成本,,也不帶梯度功能
?。?)各孔獨立控溫的定量PCR儀
不同樣品槽分別擁有獨立的智能升降溫模塊,各孔獨立控溫,,適合多指標(biāo)快速檢測,。
SmartCyclerⅡ的軟件允許一臺儀器同時操作六個樣品模塊,既滿足高速批量要求,,又能靈活運用,,還可實現(xiàn)任意梯度反應(yīng)。
SmartCyclerⅡ上樣不如傳統(tǒng)方法方便,,而且需要有的扁平反應(yīng)管,,使用成本較高。
三,、操作規(guī)程
普通PCR擴(kuò)增儀的操作非常簡便,,接通電源,儀器自檢,,設(shè)置溫度程序或調(diào)出儲存的程序運行即可,。
定量PCR擴(kuò)增儀的操作和普通PCR儀基本相同。
四,、常見故障
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?、赑CR管融化,,原因可能是溫度傳感器出問題或是熱蓋出問題;
③個別孔擴(kuò)增效率差異很大,,可能的原因是半導(dǎo)體模塊出現(xiàn)壞點;
?、軣晒鈴?qiáng)度減弱或不穩(wěn)定,,產(chǎn)生的原因有濾光片發(fā)霉或有水汽,或光源損耗(以鹵鎢燈為光源的),,需更換光源,;或需調(diào)節(jié)檢測元件靈敏度;
?、輧x器工作時出現(xiàn)噪音,。
以上故障部分可自行檢查,部分需工程師檢修,。
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