本文介紹一下用勻漿器研磨法提取貼壁細(xì)胞核蛋白的具體操作。
一,、前期準(zhǔn)備
1,、臺(tái)盼藍(lán)染液:
取臺(tái)盼藍(lán)粉劑,將其溶解在10mL的雙蒸水當(dāng)中配制成質(zhì)量體積比為4%(4%w/v)的臺(tái)盼藍(lán)母液,。在使用時(shí),,利用PBS緩沖液將母液稀釋10倍,,使其濃度達(dá)到0.4%,之后再與細(xì)胞懸液混合均勻,。
2,、BufferA:
包含10mmol/L的HEPES(在4℃下pH值為7.9)、1.5mmol/L的氯化鎂,、10 mmol/L的KCL,、0.5mmol/L的二硫蘇糖醇(DTT)。若擔(dān)心漿蛋白降解會(huì)對(duì)核蛋白產(chǎn)生影響,,可以添加1mmol/L的PMSF,。
3、BufferB:
含有20mmol/L的HEPES(pH值為7.9),、體積分?jǐn)?shù)為25%的甘油,、0.42mol/L的氯化鈉、1.5mmol/L的氯化鎂,、0.2mmol/L的乙二胺四乙酸(EDTA),、0.5mmol/L的PMSF、0.5mmol/L的二硫蘇糖醇(DTT),。
二,、具體步驟
1、使用胰酶將貼壁細(xì)胞消化下來,,把這些細(xì)胞收集到1.5mL EP管中,。4℃以300g的離心力離心5min。離心完成后,,用PBS緩沖液對(duì)細(xì)胞進(jìn)行洗滌(2次),。
2、棄上清,,加入體積為細(xì)胞沉淀5倍的預(yù)冷Buffer A(每20μL的細(xì)胞沉淀加入100μL的Buffer A),,之后輕輕吹打,使細(xì)胞在Buffer A中重新懸浮,。
3,、將上述細(xì)胞懸浮液在冰上放置10min,隨后再次在4℃條件下,,以300g的離心力離心5min,。離心結(jié)束后,加入體積為其25倍的預(yù)冷Buffer A,,并通過吹打操作讓細(xì)胞重新懸浮,。
4、把經(jīng)過上述處理后的細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移勻漿器中,,準(zhǔn)備進(jìn)行勻漿操作,。
5,、在勻漿過程中,取出少量的細(xì)胞懸液,,與等體積的0.4%臺(tái)盼藍(lán)染液混合均勻,,接著在顯微鏡下觀察細(xì)胞的破膜情況。如果觀察到大部分細(xì)胞都被染成了藍(lán)色,,就停止勻漿操作,;要是大部分細(xì)胞未被染成藍(lán)色,則繼續(xù)進(jìn)行勻漿,。
6,、當(dāng)大部分細(xì)胞的細(xì)胞膜被破壞后,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至Eppendorf管中,,然后在4℃環(huán)境下,,以25000g的離心力離心20min。
7,、離心結(jié)束后,,現(xiàn)在上清液中包含的是細(xì)胞裂解物中的胞漿成分,沉淀部分則是核蛋白,。
8,、收集離心后的沉淀,,向其中加入與沉淀等體積的預(yù)冷Buffer B,,然后輕輕地吹打,使沉淀呈現(xiàn)懸浮狀態(tài),。接著將懸浮液轉(zhuǎn)移到干凈的組織勻漿器中,,以均勻的力度進(jìn)行30次勻漿操作。
9,、把經(jīng)過勻漿的懸浮液轉(zhuǎn)移到Eppendorf管中,,放在冰上的低速搖床上振蕩45min。
10,、在4℃條件下,,以25000g的離心力離心30min,收集得到的上清液即為細(xì)胞核蛋白
11,、提取核蛋白后,,可使用一些核蛋白(如H3蛋白、Lamin蛋白)作為對(duì)照蛋白,,進(jìn)行WB驗(yàn)證,。
注:全部步驟均需于冰上操作。
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