太忙,，許久沒有寫什么東西。也很少能找到時間靜下心來去思考一些事情,。大環(huán)境太卷,，都不知道在卷什么。

即便忙到飛起,，還是有很多時間很可惜的浪費掉了,。解析結(jié)構(gòu)也是如此。有時忙活半天才發(fā)現(xiàn),，起初的結(jié)論壓根就是個“苦笑”的錯誤,。

從電報烏龍看科學(xué)解析的局限

培訓(xùn)時，突然想起初中時一件啼笑皆非的事情,。在那個還幾乎沒有電話的年代,，依稀記得初二那年，語文老師突然接到東北老家發(fā)來的電報,，意思是父親病故速回,。語文老師哭紅了眼睛跟我們說她回去幾天。然而一個禮拜之后語文課上,，她十分氣憤地告訴我們這是一個大烏龍,，譯報員翻譯錯了電報信息......。具體是什么,，已不記得,。但是譯報員的工作和我們解析結(jié)構(gòu)其實并沒有什么區(qū)別。

人眼睛是有局限的,，只能看到晶體的外形,。衍射儀也是有局限的，只能給你晶體的衍射空間數(shù)據(jù)。我們想要的結(jié)構(gòu)是要靠程序和電腦去從衍射數(shù)據(jù)里挖掘的,。既然沒有直接看見,，意思如同一個老師講的那樣“所見非所得”，我們只是在靠科學(xué)的手段去猜罷了,。如同在破譯電報,，破譯錯了很多時候也看起來像那么回事。所以數(shù)據(jù)庫里或者文章里的很多結(jié)構(gòu)不見得就是對的,。
常見的結(jié)構(gòu)解析錯誤

比較常見的結(jié)構(gòu)解析錯誤，包括晶胞定錯,，晶系定錯以及空間群定錯,，當(dāng)然還有模型的搭建錯誤等等。而空間群定錯基本上十分的隱蔽,，即便是從業(yè)多年的晶體民工,，也很難分清一些細(xì)小的差別。記錄下錯誤也許下次才不會再犯,。

這個晶體呢,，確實有難度而且衍射很弱。XPREP給出的空間群是P222₁,。

然而P222₁解析不出結(jié)構(gòu),。嘗試了許久才終于在P2₁2₁2₁下得到了原料組成的框架。并且精修下來還不算太差,。更有趣的是,，結(jié)構(gòu)連接成了COF的框架結(jié)構(gòu)。雖然數(shù)據(jù)分析并不支持P2₁2₁2₁的空間群,，但也許會有孿晶的原因,，且這是只能拿到的結(jié)果?？吹竭@樣的結(jié)果其實是有些興奮的,，這樣連接成的COF結(jié)構(gòu)屬于出乎意料的結(jié)果，是個“新的發(fā)現(xiàn)”,。

然而這樣的結(jié)果,，并不能讓人放心，太多的反常,。比如堆積十分的緊密,，原子間的間距太近。有些透不過來氣的感覺,。這樣看起來像那么回事的結(jié)構(gòu)真的存在么,？還好，這樣的懷疑保持到了結(jié)束,。其它的實驗表征也不支持這是一個COF晶體,。也就是需要推導(dǎo)了重來,。仔細(xì)分析空間群可能的結(jié)構(gòu)，以及衍射圖上的系統(tǒng)消光規(guī)律,，其實可以推導(dǎo)出空間群有可能的是P2₁2₁2,，而不是P2₁2₁2₁。有了合理的分析后,，結(jié)構(gòu)解析也就可以在確定的方向上不斷努力,，而不是到處亂猜。結(jié)果得到了更合理的結(jié)果,，甚至溶劑也都可以看到了,。

結(jié)論

所以剛開始看到的有趣的結(jié)構(gòu)，被一系列的反常所打破,。因為空間群定錯的原因,，我們破譯錯了衍射信息，自然也就得到了錯誤的結(jié)構(gòu),。即便精修的參數(shù)看起來并不是那么差,，但也不過是假象罷了。

如果這樣的結(jié)構(gòu)發(fā)表了,，也真就變成了笑話了,。切記仔細(xì)小心！

轉(zhuǎn)載于《布魯克X射線部門》公眾號