田間表型組學(xué):它能促進作物改良嗎,?
持續(xù)培育高產(chǎn)抗逆品種是未來幾年農(nóng)業(yè)面臨的關(guān)鍵挑戰(zhàn)之一。盡管基因篩選方法的發(fā)展極大地幫助了育種過程,,
但在對所得種質(zhì)進行同樣快速的表型工具的開發(fā)和應(yīng)用方面,,仍然存在差距。
多年來,,植物育種家和研究人員一直對選擇具有特定生理和農(nóng)藝性狀的品系增的強方法感興趣,,
這些性狀有助于提高抗逆性和最終產(chǎn)量,,但是用于定量研究的傳統(tǒng)測量方法往往是勞動密集型的,
尤其是在田間不容易擴大規(guī)模以允許篩選大量不同的品系,。傳統(tǒng)的表現(xiàn)型,,
即植物性狀的視覺評估,是植物育種的支柱,,但被廣泛認為是主觀且費力的,。
對自花授粉植物育種計劃中品種演化的各個階段的初步總結(jié)。早期幾代所使用的種植形式的描述表明存在各種育種策略,,其中種植方式會有所不同,。
在育種計劃的早期階段,通過間接選擇獲取表型組學(xué)的機會特別大,,此時植物為隔離生長狀態(tài),,無法獲得可靠的產(chǎn)量估算;
這些階段的評估在很大程度上是主觀的,。為了討論和強調(diào)所需的評估規(guī)模,,指出了評估中的基因型數(shù)量的范圍。
早在21世紀初,,隨著基因分型技術(shù)的快速發(fā)展,,表型組學(xué)這個通用術(shù)語被廣泛用于自動化植物篩選工作(盡管表型和基因型這兩個術(shù)語起源于一個多世紀前)。
在過去十年中,,機器人技術(shù),、先進成像和數(shù)據(jù)分析技術(shù)的發(fā)展為高通量測量開辟了新的途徑,但必要設(shè)施的成本導(dǎo)致在全球范圍內(nèi)建立了少數(shù)專業(yè)中心,,
其中澳大利亞植物表型設(shè)施(位于堪培拉和阿德萊德)是中心之一,。此外,建立實踐和深度表型組學(xué)團體的倡議已經(jīng)被確立,,包括各個國家和國際學(xué)會,,
包括本雜志《Plant Phenomics》。在發(fā)展植物表型方面,,國際上做出了大量努力,,開展了許多區(qū)域活動,如英國國家植物表型學(xué)會,、
德國植物表型學(xué)會,、歐洲植物表型學(xué)會和北美植物表型學(xué)會。作為表型活動論壇的國際植物表型鑒定學(xué)會(IPPN)
最近對成員進行了一項調(diào)查,,強調(diào)“田間表型”是表型的首要任務(wù),,其次是“非生物脅迫”和“數(shù)據(jù)管理”。強調(diào)田間表型的發(fā)展尤為重要,
這不僅是因為它對植物育種的應(yīng)用至關(guān)重要,,也因為它仍然比實驗室或溫室表型更具挑戰(zhàn)性且不那么先進,。
僅獲取感興趣的葉片/冠層熱數(shù)據(jù)的重要性在于,最左側(cè)顯示的實際葉子溫度與最右側(cè)圖像的所得平均CT之間存在 4°C 的差異,。
最右側(cè)的圖像包括感興趣的區(qū)域中的所有像素,,其平均CT值為38°C;平均CT明顯受土壤像素的影響。中間圖像包含的像素要少得多,,平均CT為36°C,,
比僅包含葉像素的最左邊圖像高2°C。由于早期世代每個基因型的種子有限,,在缺水環(huán)境和育種者在苗圃里使用的種植配置的影響下,,
普遍存在的地面覆蓋影響 CT 測量的更可能發(fā)生。需要開展進一步的工作,,以開發(fā)閾值化背景土壤溫度和僅從感興趣的植物材料中提取熱數(shù)據(jù)的常規(guī)方法。
使用配備 13.1 mm 鏡頭熱紅外相機獲取熱圖像,。
近年來,,許多綜述性出版物強調(diào)了表型組學(xué)作為作物改良和植物育種的有力研究工具的重要性,并報道了許多令人鼓舞的結(jié)果,。
因此,,對表型組學(xué)作為通過研究和育種進行作物改良的有利工具的應(yīng)用前景進行綜述是及時的。由于表型組學(xué)是一個很大的領(lǐng)域,,
有許多研究人員積極參與,,因此本綜述僅限于成像方法、地上表型以及它們在谷物表型中的應(yīng)用,。
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