操作條件對于色譜分離有很大影響。
     １,、柱長,，柱內(nèi)徑：一般講，柱管增長,，可改善分離能力,，短則組分餾出的快些；柱內(nèi)徑小分離效果好,，柱內(nèi)徑大處理量大,，但柱內(nèi)徑過大，將導(dǎo)致?lián)w不能均勻地分布在色譜柱中,。分析用柱管一般內(nèi)徑為３－６毫米,，柱長為１－４米。
     ２,、柱溫：是一個重要的操作變數(shù),，直接影響分離效能和分析速度。選擇柱溫的根據(jù)是混合物的沸點范圍,，固定液的配比和鑒定器的靈敏度,。提高柱溫可縮短分析時間；降低柱溫可使色譜柱選擇性增大,，有利于組分的分離和色譜柱穩(wěn)定性提高,，柱壽命延長,。一般采用等于或高于數(shù)十度于樣品的平均沸點的柱溫為較合適，對易揮發(fā)樣用低柱溫,，不易揮發(fā)的樣品采用高柱溫,。
     ３、載氣流速：載氣流速是決定色譜分離的重要原因之一,。一般講流速高色譜峰狹,，反之則寬些，但流速過高或過低對分離都有不利的影響,。流速要求要平穩(wěn),，常用的流速范圍每分鐘在１０－１００亳升之間。
     ４,、固定相：固定相是由固體吸附劑或涂有固定液的擔體構(gòu)成,。
     （１）固體吸附劑或擔體粗細：一般采用４０－６０目、６０－８０目,、８０－１００目,。當用同等長度的柱子，顆粒細的分離效率就要比粗的好些,。
     （２）固定液含量：固定液含量對分離效率的影響很大,，它與擔體的重量比一般用１５％－２５％。比例過大有損于分離,，比例過小會使色譜峰拖尾,。
     ５、進樣：一般講進樣快,，進樣量小,，進樣溫度高其分離效果好。對進液體樣,，速度要快,，汽化溫度要高于樣品中高沸點組分的沸點值，一次汽化,，保證色譜峰形不致展寬,、使柱效高。當進樣量在一定限度時,，色譜峰的半峰寬是不變的,。若進樣量過多就會造成色譜柱超載。一般講柱長增加四倍,，樣品的許可量增加一倍。對于常規(guī)分析,，液體進樣量為１－２０微升,；氣體進樣量為０,、１－５毫升。