siRNA轉染的常見問題解答
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如何優(yōu)化siRNA轉染?轉染少量的siRNA為何很重要,?在siRNA轉染過程中為何應當避免細胞毒性,?本文收錄了與siRNA轉染相關的常見問題,并附上專家的解答,,希望能對您的實驗有幫助,。
Q:我該如何優(yōu)化siRNA轉染?
A:在實驗室中建立RNAi和研究每一種新的細胞系時,,應當優(yōu)化siRNA的轉染,。HiPerFect Transfection Reagent Handbook中包含優(yōu)化的有用信息(www.qiagen.com/HB/HiPerFect)。在優(yōu)化實驗中,,轉染效率可通過陽性對照(如AllStars Cell Death Control siRNA)的轉染來監(jiān)控,。應當優(yōu)化的轉染因素包括:
試劑和siRNA的量
轉染時的細胞匯合度
分析前細胞和復合物的孵育時間
Q:轉染少量的siRNA為何很重要?
A:高濃度的siRNA轉染可能產(chǎn)生脫靶效應,,即siRNA影響了部分同源或非同源基因的表達,。研究表明,可能會對RNAi實驗產(chǎn)生誤導結果的脫靶效應可通過降低siRNA濃度而在很大程度上避免(1,2),。HiPerFect Transfection Reagent有助于siRNA的吸收,,實現(xiàn)了低濃度下的基因沉默,,而不損害knockdown的效率。
Q:在siRNA轉染過程中為何應當避免細胞毒性,?
A:siRNA導入所引起的細胞毒性干擾了RNAi后的數(shù)據(jù)分析,,因為表型分析不再可靠。影響數(shù)據(jù)分析的因素包括轉染試劑所引起的表型改變,,壓力所引起的基因表達改變,,以及不應當用于分析的死細胞的存在。
HiPerFect Transfection Reagent對細胞無毒性,,不會引起液泡形成(這標志著細胞進程的破壞),。詳細的細胞周期和細胞形態(tài)學分析顯示mock轉染的細胞(只有HiPerFect Transfection Reagent)和未轉染的細胞之間無差異。
Q:順式轉染和反式轉染之間有什么差別,?
A:在反式轉染的步驟中,,siRNA先加在平板的孔中,然后才是轉染試劑,。在復合物形成之后,,加入細胞。順式轉染則相反,,先在孔中加入細胞,,然后才是復合物。反式轉染使用廣泛,,特別對于高通量實驗,,因為它容易自動化,轉染前siRNA可儲存在孔中,,且使用了較少的材料,,因為不需要在一塊單獨的板上開展siRNA-轉染試劑復合物的形成。
順式轉染 反式轉染
第1步 細胞 第1步 核酸
第2步 轉染復合物 第2步 HiPerFect Reagent
第3步 細胞
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