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abcam原裝抗體WB問題超全總結(jié)詳解無信號(hào),,多條帶,,高背景等難題 |靶點(diǎn)解惑

來源:上海盈東生物科技有限公司   2023年05月09日 16:51  

蛋白免疫印跡(WB)是利用聚丙烯酰胺凝膠電泳來檢測(cè)特定樣品或提取物中某種特定蛋白的方法。聚丙烯酰胺凝膠緊貼著膜放置,,常用的膜是硝酸纖維素或PVDF(聚偏乙烯氟化物),,在電流的作用下蛋白質(zhì)從凝膠遷移到膜上并且被固定。膜是凝膠蛋白質(zhì)的復(fù)制品,,然后可以與抗體結(jié)合后進(jìn)行染色,。免疫印跡(WB)是一項(xiàng)通過凝膠電泳按照分子量大小分離蛋白,然后再利用特異性抗體識(shí)別這些蛋白的技術(shù),。它是對(duì)蛋白進(jìn)行定性和相對(duì)定量的重要檢測(cè)工具,。

您在WB實(shí)驗(yàn)時(shí)是否遇到無信號(hào)、高背景,、多帶等問題,?小編接下來將一一為您呈現(xiàn)這些問題的常見原因和解決方案

Chapter1



無信號(hào)常見原因和解決方案


WB實(shí)驗(yàn)時(shí)出現(xiàn)無信號(hào)或信號(hào)弱現(xiàn)象,,小艾歸納整理發(fā)現(xiàn),,主要是靶標(biāo)自身特性和WB實(shí)驗(yàn)流程中的樣本制備、轉(zhuǎn)膜,、封閉,、抗體孵育、洗膜和檢測(cè)等具體實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié)問題會(huì)導(dǎo)致這一現(xiàn)象,。接下來小艾跟大家詳細(xì)扒一扒具體細(xì)節(jié)有哪些,。

1.靶點(diǎn)特性導(dǎo)致無信號(hào)的常見原因及解決方案


▼ 組織或細(xì)胞中靶標(biāo)蛋白含量低導(dǎo)致無信號(hào)或信號(hào)弱


可通過如下建議解決:


參考文獻(xiàn)或數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)(例如The Human Protein Atlas)等,,確認(rèn)靶標(biāo)蛋白是否在待檢組織或細(xì)胞中表達(dá)。我們總結(jié)了41個(gè)有表達(dá)特異性的熱門靶標(biāo)表達(dá)信息,,供大家參考(附錄1),。


增加上樣量,至少上樣20-30μg蛋白,。


濃縮使信號(hào)大化(例如檢測(cè)核蛋白要用核裂解物,;檢測(cè)膜蛋白用膜裂解液,超速離心分離膜蛋白),。我們總結(jié)了58個(gè)熱門靶標(biāo)亞細(xì)胞定位信息,,及其陽性對(duì)照供大家參考(附錄2)。


參考文獻(xiàn)或產(chǎn)品說明書,,誘導(dǎo)增加靶標(biāo)蛋白表達(dá)。很多靶標(biāo)蛋白需要藥物誘導(dǎo)或其它特殊處理,,其含量才能達(dá)到WB檢測(cè)范圍,,我們整理了17個(gè)熱門靶標(biāo)蛋白在不同細(xì)胞系中藥物處理信息,及對(duì)應(yīng)產(chǎn)品供大家參考(附錄3),。


選擇確認(rèn)表達(dá)靶標(biāo)蛋白的樣本作為陽性對(duì)照(可參考產(chǎn)品說明書中提供的陽性對(duì)照),。


附錄1 熱門靶標(biāo)蛋白表達(dá)及陽性對(duì)照

靶標(biāo)名稱

組織/細(xì)胞表達(dá)特異性(Uniprot)

Alpha-synuclein

•Alpha-synuclein主要在大腦中表達(dá),在中樞神經(jīng)系統(tǒng)的突觸前末梢高度表達(dá),。

•在除肝臟外的組織中也有少量表達(dá),。

BDNF

•BDNF在海馬、杏仁核,、大腦皮層和小腦等腦組織中高度表達(dá),。

•BDNF也表達(dá)于心臟、肺,、骨骼肌,、睪丸、前列腺和胎盤中,。

Caspase-3 /cleaved Caspase-3

•在肺,、脾、心臟,、肝臟和腎臟中高度表達(dá),。

•腦和骨骼肌內(nèi)中水平表達(dá),睪丸低水平表達(dá),。

•在許多細(xì)胞系中表達(dá),,在免疫系統(tǒng)細(xì)胞中的表達(dá)最高。

?點(diǎn)擊此處查看更多熱門靶標(biāo)組織/細(xì)胞表達(dá)特異性


附錄2 熱門靶標(biāo)蛋白亞細(xì)胞定位及陽性對(duì)照

靶標(biāo)名稱

蛋白亞細(xì)胞定位(Uniprot)

陽性對(duì)照

Alpha-synuclein

細(xì)胞膜,,細(xì)胞質(zhì),,細(xì)胞核,;也分泌于細(xì)胞連接、突觸和多巴胺能神經(jīng)元膜結(jié)合處,。

•WB:HAP1,、HEK293-T細(xì)胞裂解液 ;人,、大鼠腦組織裂解液 ,;重組人Alpha-synuclein蛋白(?ab51189 。

BDNF

分泌型

•WB:重組人/小鼠/大鼠BDNF蛋白(?ab9794) ,;人,,大鼠和小鼠的腦,海馬和小腦組織裂解液

BrdU

細(xì)胞核

•IHC:來自BrdU 處理的小鼠的未染色切片(?ab129956),。

 •ICC:BrdU處理的HeLa 細(xì)胞,。



附錄3 熱門靶標(biāo)蛋白陽性對(duì)照及藥物處理?xiàng)l件


靶標(biāo)名稱

細(xì)胞系

試劑處理

產(chǎn)品

c-Fos

HeLa

血清饑餓36小時(shí),20% FBS(2小時(shí))

?ab214672

Jurkat

血清饑餓過夜,,PMA(200 nM,, 4 小時(shí))

RAW 264.7

血清饑餓過夜,PMA(200 nM,, 4 小時(shí))

Cleaved Caspase-3

HAP1

星形孢菌素(2 μM,, 24小時(shí))

?ab32042

HeLa

星形孢菌素(2 μM, 24小時(shí))

cleaved N-terminal DFNA5 / GSDME

SH-SY5Y

Etoposide(60 μM ,,14小時(shí))

?ab222408

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▼組織或細(xì)胞中修飾后(磷酸化,、乙酰化和泛素化等)的靶標(biāo)蛋白含量底,,可導(dǎo)致無信號(hào)或信號(hào)弱現(xiàn)象

可通過如下建議解決:


通常情況下,,在未處理的組織或細(xì)胞中,大部分翻譯后修飾狀態(tài)下的蛋白含量較少,。


參考文獻(xiàn)或產(chǎn)品說明書,,誘導(dǎo)增加靶標(biāo)蛋白含量。我們整理了25個(gè)熱門靶標(biāo),,在不同細(xì)胞系中檢測(cè)其翻譯后修飾形式,,需藥物處理?xiàng)l件及對(duì)應(yīng)的產(chǎn)品,供大家參考(附錄3),。


裂解緩沖液中使用相應(yīng)去修飾酶抑制劑,。(例如靶蛋白磷酸化檢測(cè),裂解液中需增加磷酸酶抑制劑)


陽性對(duì)照(參考產(chǎn)品說明書中誘導(dǎo)試劑和條件,,處理樣本,。)


附錄3 翻譯后修飾靶標(biāo)蛋白陽性對(duì)照及藥物處理?xiàng)l件

靶標(biāo)名稱

細(xì)胞系

試劑處理

產(chǎn)品

eNOS(phospho S1177)

HUVEC

Pervanadate(100 uM,10分鐘)

?ab215717

JAK2(phospho Y1007 + Y1008)

Jurkat

Pervanadate(50 mM ,,5分鐘)

?ab32101

C6 

Pervanadate(50 mM,,5分鐘)

Hepa1-6

Pervanadate(100 µM,,30分鐘)

MEF

Pervanadate(100 µM,30分鐘)

MLKL(phospho S345)

L-929

20 ng/ml TNF alpha,,100 nM Smac mimetic和20 µM z-VAD(8小時(shí))

?ab196436

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注:具體細(xì)胞系處理信息請(qǐng)參考產(chǎn)品說明書


▼靶標(biāo)蛋白是分泌型蛋白,,檢測(cè)時(shí)分泌到細(xì)胞外,若檢測(cè)的樣本為全細(xì)胞裂解液,,會(huì)出現(xiàn)無信號(hào)或信號(hào)弱現(xiàn)象

可通過如下建議解決:


使用 Brefeldin A(BFA)抑制蛋白分泌,,提取全細(xì)胞裂解液。


如果全細(xì)胞裂解液中檢測(cè)不到靶蛋白,,建議提取細(xì)胞培養(yǎng)上清中的蛋白,。




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