1.多肽文庫(kù)篩選概念
多肽文庫(kù)是指大量特定長(zhǎng)度且序列不同的小肽的集合,它包括了該長(zhǎng)度短肽中各種(或絕大部分)氨基酸序列的排列組合。多肽文庫(kù)是一種強(qiáng)大的篩選工具。它用于從大批量多肽中篩選極少量具有關(guān)鍵生物活性的多肽,。
2.多肽文庫(kù)類型
(1)重疊肽庫(kù):單個(gè)肽可以分成幾個(gè)重疊的片段。由此產(chǎn)生的重疊肽庫(kù)隨后可用于包括連續(xù)和線性表位作圖在內(nèi)的過程,。
(2)截斷肽庫(kù):截斷肽庫(kù)可用于預(yù)測(cè)確定表位活性的最小長(zhǎng)度氨基酸,。
(3)丙氨酸肽掃描文庫(kù):每個(gè)氨基酸殘基都被丙氨酸單獨(dú)和系統(tǒng)地取代。該庫(kù)可以快速確定每個(gè)氨基酸對(duì)肽功能的貢獻(xiàn)。
(4)隨機(jī)肽庫(kù):隨機(jī)肽庫(kù)被設(shè)計(jì)為序列優(yōu)化的工具,,選定的位置同時(shí)被所有20種天然氨基酸取代,,可以增加肽活性。
(5)亂序肽庫(kù):亂序庫(kù)在所有肽庫(kù)中具有較高的變異性,。所得肽通常用作陰性對(duì)照,,以表明特定序列對(duì)蛋白質(zhì)功能或活性至關(guān)重要。它也是一種用于尋找新線索的隨機(jī)篩選工具,。
(6)位置肽庫(kù):肽序列中選定的位點(diǎn)或區(qū)域被系統(tǒng)地替換為所有其他天然氨基酸,。這允許識(shí)別增強(qiáng)肽活性的氨基酸。
3.多肽文庫(kù)篩選應(yīng)用
多肽文庫(kù)在蛋白質(zhì)組學(xué)及其相關(guān)領(lǐng)域應(yīng)用范圍非常廣泛,,如藥物研發(fā)(科研級(jí) Bevacizumab ( cat:YR1001 )),、蛋白-蛋白相互作用、抗原表位篩選,、GPCR配體篩選,、蛋白功能分析、酶底物或抑制劑篩選,、信使分子研發(fā)及多肽/蛋白信號(hào)對(duì)答等,。
4.多肽文庫(kù)篩選技術(shù)亮點(diǎn)
(1)可以高通量生產(chǎn),篩選效率高
(2)可快速制備可溶抗原
(3)可以準(zhǔn)確的定位抗原決定簇,,廣泛用于藥物開發(fā)
5.卡梅德生物能夠?yàn)榭蛻籼峁└哔|(zhì)量的肽庫(kù)篩選服務(wù)
基于噬菌體平臺(tái),,卡梅德生物擁有多樣性文庫(kù),如下圖2,,可以為客戶構(gòu)建隨機(jī)7肽文庫(kù),,12肽文庫(kù),15肽文庫(kù)等,。卡梅德生物提供的T7噬菌體展示平臺(tái)是一種超高通量的配體篩選方式,,通過該技術(shù)平臺(tái)可以構(gòu)建多達(dá)1013/ml個(gè)經(jīng)過噬菌體展示的多肽或抗體克隆,平均可以做到獨(dú)立克隆數(shù)為109-1010/ml,,經(jīng)過后續(xù)多輪淘篩可以提供多達(dá)105有效多肽或抗體的序列,。
6.卡梅德生物為客戶提供肽庫(kù)篩選服務(wù)的全流程介紹
肽庫(kù)篩選主要分為以下大致流程:目的蛋白質(zhì)量驗(yàn)證,噬菌體滴度檢測(cè),,噬菌體擴(kuò)大培養(yǎng),,噬菌體淘選,測(cè)序,,流程圖如下:
6.1目的蛋白質(zhì)量驗(yàn)證
目的蛋白進(jìn)行SDS-PAGE電泳,,要求蛋白純度>95%,才能進(jìn)行下一步文庫(kù)篩選,。
6.2噬菌體滴度檢測(cè)
TG1菌株接種到LB培養(yǎng)基進(jìn)行活化培養(yǎng),,LB培養(yǎng)基添加瓊脂糖后,,按照梯度稀釋法培養(yǎng)噬菌體,培養(yǎng)完成的噬菌體涂布至瓊脂平板,,進(jìn)行噬菌斑計(jì)數(shù),。
6.3噬菌體擴(kuò)大培養(yǎng)
TG1菌株培養(yǎng)至OD600 0.4 ~0.6后,接種到經(jīng)過擴(kuò)大培養(yǎng)的宿主菌種,,震蕩離心,,上清即為噬菌體培養(yǎng)物。
6.4噬菌體淘選
將純化的目的蛋白用96孔酶標(biāo)板進(jìn)行抗原包被過夜,,脫脂內(nèi)粉進(jìn)行封閉,,加入擴(kuò)大培養(yǎng)的噬菌體孵育,緩沖液多次洗脫,,進(jìn)行噬菌體滴度測(cè)定,濃縮純化后等待下一輪篩選,。重復(fù)以上步驟2次,,完成后兩輪篩選。
6.5測(cè)序
從第三輪篩選后的細(xì)菌平板上挑取48個(gè)單克隆,,經(jīng)過擴(kuò)增培養(yǎng)后提取質(zhì)粒進(jìn)行測(cè)序,。
7.多肽噬菌體展示文庫(kù)篩選實(shí)驗(yàn)結(jié)果
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