1.多肽文庫篩選概念
多肽文庫是指大量特定長度且序列不同的小肽的集合,它包括了該長度短肽中各種(或絕大部分)氨基酸序列的排列組合。多肽文庫是一種強大的篩選工具,。它用于從大批量多肽中篩選極少量具有關(guān)鍵生物活性的多肽,。
2.多肽文庫類型
(1)重疊肽庫:單個肽可以分成幾個重疊的片段,。由此產(chǎn)生的重疊肽庫隨后可用于包括連續(xù)和線性表位作圖在內(nèi)的過程,。
(2)截斷肽庫:截斷肽庫可用于預測確定表位活性的最小長度氨基酸,。
(3)丙氨酸肽掃描文庫:每個氨基酸殘基都被丙氨酸單獨和系統(tǒng)地取代,。該庫可以快速確定每個氨基酸對肽功能的貢獻,。
(4)隨機肽庫:隨機肽庫被設計為序列優(yōu)化的工具,,選定的位置同時被所有20種天然氨基酸取代,,可以增加肽活性。
(5)亂序肽庫:亂序庫在所有肽庫中具有較高的變異性,。所得肽通常用作陰性對照,,以表明特定序列對蛋白質(zhì)功能或活性至關(guān)重要。它也是一種用于尋找新線索的隨機篩選工具,。
(6)位置肽庫:肽序列中選定的位點或區(qū)域被系統(tǒng)地替換為所有其他天然氨基酸,。這允許識別增強肽活性的氨基酸。
3.多肽文庫篩選應用
多肽文庫在蛋白質(zhì)組學及其相關(guān)領(lǐng)域應用范圍非常廣泛,,如藥物研發(fā)(科研級 Bevacizumab ( cat:YR1001 )),、蛋白-蛋白相互作用、抗原表位篩選,、GPCR配體篩選,、蛋白功能分析、酶底物或抑制劑篩選,、信使分子研發(fā)及多肽/蛋白信號對答等,。
4.多肽文庫篩選技術(shù)亮點
(1)可以高通量生產(chǎn),篩選效率高
(2)可快速制備可溶抗原
(3)可以準確的定位抗原決定簇,,廣泛用于藥物開發(fā)
5.卡梅德生物能夠為客戶提供高質(zhì)量的肽庫篩選服務
基于噬菌體平臺,,卡梅德生物擁有多樣性文庫,如下圖2,,可以為客戶構(gòu)建隨機7肽文庫,,12肽文庫,15肽文庫等,。卡梅德生物提供的T7噬菌體展示平臺是一種超高通量的配體篩選方式,,通過該技術(shù)平臺可以構(gòu)建多達1013/ml個經(jīng)過噬菌體展示的多肽或抗體克隆,平均可以做到獨立克隆數(shù)為109-1010/ml,,經(jīng)過后續(xù)多輪淘篩可以提供多達105有效多肽或抗體的序列,。
6.卡梅德生物為客戶提供肽庫篩選服務的全流程介紹
肽庫篩選主要分為以下大致流程:目的蛋白質(zhì)量驗證,噬菌體滴度檢測,,噬菌體擴大培養(yǎng),噬菌體淘選,,測序,,流程圖如下:
6.1目的蛋白質(zhì)量驗證
目的蛋白進行SDS-PAGE電泳,要求蛋白純度>95%,,才能進行下一步文庫篩選,。
6.2噬菌體滴度檢測
TG1菌株接種到LB培養(yǎng)基進行活化培養(yǎng),LB培養(yǎng)基添加瓊脂糖后,,按照梯度稀釋法培養(yǎng)噬菌體,,培養(yǎng)完成的噬菌體涂布至瓊脂平板,,進行噬菌斑計數(shù)。
6.3噬菌體擴大培養(yǎng)
TG1菌株培養(yǎng)至OD600 0.4 ~0.6后,,接種到經(jīng)過擴大培養(yǎng)的宿主菌種,,震蕩離心,上清即為噬菌體培養(yǎng)物,。
6.4噬菌體淘選
將純化的目的蛋白用96孔酶標板進行抗原包被過夜,,脫脂內(nèi)粉進行封閉,加入擴大培養(yǎng)的噬菌體孵育,,緩沖液多次洗脫,,進行噬菌體滴度測定,濃縮純化后等待下一輪篩選,。重復以上步驟2次,,完成后兩輪篩選。
6.5測序
從第三輪篩選后的細菌平板上挑取48個單克隆,,經(jīng)過擴增培養(yǎng)后提取質(zhì)粒進行測序,。
7.多肽噬菌體展示文庫篩選實驗結(jié)果
相關(guān)產(chǎn)品
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