NanoTemper 助力小分子靶向無序蛋白(IDP)的研究
前列腺癌是quan球男性zui常見的癌癥之一。早期、低級別的癌癥可以通過手術(shù)或放射成功治療。對于患有前列腺以外的高級別腫瘤的患者,,標(biāo)準(zhǔn)治療與雄激素治療相結(jié)合,。雄激素消融阻斷前列腺腫瘤賴以生長和存活的男性激素,,最初是有效的,;然而,在沒有雄激素的情況下,,前列腺癌會再次生長,,并發(fā)展為更具侵襲性的形式,稱為去勢抵抗型前列腺癌(CRPC),??谷萸傲邢侔┗颊卟豢杀苊獾貢剐奂に丿煼óa(chǎn)生耐藥性,部分原因是雄激素受體(AR)突變或剪接變體能夠恢復(fù)AR信號,。
上海奕拓生物和上海Chinese Academy of Sciences生物與化學(xué)交叉研究中心朱繼東/朱光亞團隊合作的研究顯示配體活化的AR可以形成轉(zhuǎn)錄活性的聚合物,。AR的結(jié)構(gòu)化和非結(jié)構(gòu)化區(qū)域都有助于AR的有效相分離,無序N端起主要作用,。AR液-液相分離行為具有轉(zhuǎn)錄活性和抗雄激素功效,。抗雄激素可以以配體獨立的方式促進AR抗性突變體的相分離和轉(zhuǎn)錄活性,。該研究進行了基于相分離的表型篩選,并鑒定了ET516分子,,ET516特異性破壞AR聚合物,,有效抑制AR轉(zhuǎn)錄活性,并抑制表達AR抗性突變體的前列腺癌細(xì)胞的增殖和腫瘤生長,。研究的結(jié)果表明液-液相分離是一種新的耐藥機制,,并表明靶向相分離可能為藥物發(fā)現(xiàn)提供一種可行的途徑。
doi.org/10.1038/s41589-022-01151-y
在這項研究中,,來自于NanoTemper的微量熱泳動MST互作技術(shù)以及nanoDSF蛋白穩(wěn)定性技術(shù)發(fā)揮了重要的作用,。
圖注:微量熱泳動(MST)實驗,作者用AR (NTD,1-555aa)–mEGFP
蛋白與不同濃度的ET516(藍(lán)色)以及Enza(紅色)孵育進行MST實驗,。mEGFP蛋白用作陰性對照(綠色),。使用親和力分析軟件擬合數(shù)據(jù)。結(jié)果表明,,ET516與NTD的親和力Kd值25µM,,表明ET516可以作為很好的候選分子。
圖注:與ET516孵育的AR AF-1(144-450 aa,,0.3 mg/mL)中的TSA測定
加熱過程從25℃增加到81.5℃,,升溫速率為1℃/min。記錄發(fā)射強度比(Em350nm\/Em330nm),,分析熒光強度比(左圖)和一階導(dǎo)數(shù)(右圖),。
監(jiān)測蛋白內(nèi)源熒光的nanoDSF實驗顯示,ET516處理后AR AF-1中的熒光比率呈劑量依賴性下降,,進一步證實了ET516和AF-1的相互作用,。熱位移TSA結(jié)果表明,AF-1是典型的固有無序蛋白,,其在加熱過程中沒有明顯的發(fā)射強度變化,;然而,與ET516孵育誘導(dǎo)了AF-1熔化溫度的劑量依賴性變化,,表現(xiàn)為球狀蛋白,,表明ET516與重新分布后穩(wěn)定的構(gòu)象AF-1結(jié)合。Promethus系列儀器通過內(nèi)源熒光檢測,,無需加入染料,,對緩沖液沒有要求,高精準(zhǔn)的檢測精度可以保證即使是極小結(jié)構(gòu)變化造成的Tm值shift都可以很好表征,。
對于固有無序蛋白,,因為其蛋白的無序性的特性,其他常規(guī)方法難以進行檢測,。在這篇工作中,,通過MST技術(shù)及nanoDSF技術(shù),很好的篩選到目的分子,。
Monolith系列分子互作儀基于MST技術(shù),,不依賴于分子量的改變,蛋白用量少,,對于蛋白聚集耐受度高,,可以輕松表征不同類型的分子間相互作用。
生物分子互作儀 Monolith X
Promethus系列儀器,,以nanoDSF技術(shù)為核心,,通過檢測蛋白內(nèi)源熒光監(jiān)測蛋白的穩(wěn)定性,,該技術(shù)檢測蛋白濃度寬泛,低濃度也可輕松表征,,媲美DSC的高精準(zhǔn)檢測結(jié)果,,快速高通量的檢測速度,在小分子篩選上具有不可比擬的優(yōu)勢,。
蛋白穩(wěn)定性分析儀 PR Panta
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