病毒核酸檢測標(biāo)準(zhǔn)化:標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的種類及制備
病毒核酸檢測(nucleic acid test,NAT)現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于血液及其制品的病毒篩查,、臨床抗病毒/藥物治療療效監(jiān)測等,。但核酸檢測容易受到檢測樣本的基質(zhì)效應(yīng)和檢測病毒的基因變異等多種因素的影響,使得不同的實驗室應(yīng)用不同的方法學(xué)進(jìn)行核酸檢測的結(jié)果,,在量值,、靈敏度和特異性方面常出現(xiàn)較大的差異。為使不同實驗室,,不同方法間檢測的結(jié)果具有可比性,,就必須使檢測標(biāo)準(zhǔn)化, 而標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)是檢測標(biāo)準(zhǔn)化的核心,。
標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的種類
由于血清中病毒核酸的量值不能單獨(dú)應(yīng)用物理和(或)化學(xué)的方法進(jìn)行準(zhǔn)確測定,,必須通過一定的核酸擴(kuò)增或雜交過程并經(jīng)相應(yīng)的數(shù)據(jù)處理后才能推測出血清中病毒核酸的原始數(shù)值。所以傳統(tǒng)意義的一級參考測量程序(物理和化學(xué)方法)和一級標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)在核酸檢測中還不存在,。病毒核酸檢測標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)目前通常分為國際標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),、國家或地區(qū)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)和實驗室內(nèi)部的工作制劑等三個等級。
1.核酸檢測用國際標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)(reference material)
是指由WHO 多中心研究后由專門委員會認(rèn)可的,,經(jīng)過穩(wěn)定性和組成完整性檢驗的,,在國際范圍內(nèi)用作有關(guān)量的其他標(biāo)準(zhǔn)定值基礎(chǔ)的物質(zhì),目前均由英國國家生物學(xué)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)和質(zhì)控物研究所(National Institute for Biological Standards and Control,,NIBSC)研制并提供,。NIBSC于1997年建立了第一代HCVRNA 核酸檢測用國際標(biāo)準(zhǔn),分別于1999年,、2000年,、2002年和2003年建立了第一代HIVG1 RNA、HBV DNA,、Human parvovirus B19和HAV RNA 核酸檢測用國際標(biāo)準(zhǔn)(表9G1),。核酸檢測用國際標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)沒有高純度要求,其產(chǎn)量也沒必要滿足常規(guī)實驗室要求,,通常制備一批次可供5~10年應(yīng)用,。
2.國家或地區(qū)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)
主要面向一個國家或地區(qū)。在有國際標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的情況下,,可溯源至國際標(biāo)準(zhǔn),,如衛(wèi)生部臨床檢驗中心研制的HBV DNA 和HCV RNA 國家標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)。在沒有國際標(biāo)準(zhǔn)的情況下,國家標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)管理組織可以建立國家標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)并自行規(guī)定單位,,諸如意大利HCV RNA 國家標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),。
3.實驗室內(nèi)部用的核酸檢測工作制劑
是指相關(guān)診斷試劑生產(chǎn)廠家,在實際工作中用于校準(zhǔn)或檢查實物量具,、測量儀器或標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的工作標(biāo)準(zhǔn),。如Roche、Chiron 和Bayer等公司自己用的核酸檢測工作標(biāo)準(zhǔn)國家或地區(qū)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)和實驗室內(nèi)部的工作制劑等的量值應(yīng)溯源至國際標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),。其測定值的不確定度也應(yīng)大于并包含上一級標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的不確定度。
標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的制備
目前,,病毒核酸檢測用國際標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的制備已經(jīng)程序化,,HCV RNA、HIVG1 RNA,、HBV DNA,、Humanparavo virus B19和HAV RNA的第一代國際標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),都是按照WHO 的固定程序制備的,。
其過程包括原材料的選擇和分裝,、穩(wěn)定性和均勻性檢驗、多中心合作研究定值,、WHO認(rèn)可三個階段,。
下文就原材料的選擇和分裝進(jìn)行介紹。
一,、原材料的選擇原則
在選擇用于制備病毒核酸標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的原材料時,,通常應(yīng)該遵循如下基本原則。
1.基質(zhì)相同或相近的原則
核酸檢測用標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)所選的原始材料,,基質(zhì)應(yīng)和使用的要求相一致或盡可能接近,,這樣可以消除方法基質(zhì)效應(yīng)引入的系統(tǒng)誤差。如臨床日常檢測的標(biāo)本使用的是血清(漿),,則相應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的基質(zhì)也應(yīng)是血清(漿),;如臨床標(biāo)本的基質(zhì)為細(xì)胞,則標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的基質(zhì)亦應(yīng)為細(xì)胞,。目前WHO認(rèn)可的核酸用國際標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)所選的原始材料,,是應(yīng)用混合的陰性血漿[HBGsAg(-)、抗HCV(-),、HCV RNA(-),、HIV 抗原檢測(-)、HIVG1 RNA(-),、HAV RNA(-)和Parvovirus B19(-)]稀釋陽性血漿得到,,陽性血漿中含有相應(yīng)經(jīng)過滅活處理的野生型病毒。
2. 原始材料的均勻性原則
由于原始材料可能為多個來源,因此必須嚴(yán)格混勻以保證材料的均勻性,。原始材料可以分成相同的幾份或不同的幾份,,一次制備兩批次或多批次的候選國際標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),如NIBSC在制備第一代HCV 核酸檢測用國際標(biāo)準(zhǔn)時,,除制備了兩批次凍干粉候選標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)外,,還制備了一批次的液體候選標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),這樣可以監(jiān)測制備過程對標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的影響是否相同和選擇國際標(biāo)準(zhǔn)的*佳保存形態(tài),。
3.有代表性及靶病原體含量高的原則
篩選的自然存在的病毒應(yīng)具有代表性,,并且目的分析物含量要高。要注意病毒的不同的基因型的分布,、病毒核酸常用于核酸擴(kuò)增檢測區(qū)域的保守性,,避免使用含有已發(fā)生變異的特殊病毒的原材料。
4.容易大量獲得
易大量獲得,,可有效地保證標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的制備原材料有足夠的來源,,一次也可大量制備,也可有效地保證成品的均一性,。
5.無純度要求
用于病毒核酸制備的原材料可以是純的病原體或培養(yǎng)物,,也可以是混雜在臨床標(biāo)本的混合物,只要其基質(zhì)中不含影響檢測的物質(zhì)即可,。
6.生物安全性
用于病毒標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)制備的原材料一般均來自于感染者的標(biāo)本,,均具有生物傳染危險性,因此,,在不影響靶核酸的穩(wěn)定性的情況下,,應(yīng)盡可能在制備前進(jìn)行滅活處理。理想情況下,,是采用無生物傳染危險性的原材料如體外克隆表達(dá)的病毒樣顆粒來制備,。
7.防污染
處理原始材料時,要注意防止物理,、化學(xué)和微生物方面的污染,。
8.人工合成的病毒核酸的篩選
選擇人工合成的病毒核酸作為相應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)制備的原材料時,合成核酸片段序列選擇,、長度和理化特性應(yīng)適用于臨床使用的商品試劑盒,,特別要注意的是適用于不同的核酸純化方法。其生物安全性,、易獲得性,、使用的方便程度均應(yīng)明顯好于天然候選物。但裸露的RNA 容易受核糖核酸酶的降解而穩(wěn)定性差,。
二,、原材料的分裝
標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)在液體分裝時,,會造成分裝體積的不均勻。因此在分裝過程中,,每隔一定數(shù)量都會抽取一分裝單位進(jìn)行稱量,,并通過稱量結(jié)果計算分裝的變異系數(shù)。如NIBSC在制備病毒核酸檢測用HAV RNA,、HCV RNA,、HIV RNA、HBV DNA和B19 DNA國際標(biāo)準(zhǔn)時,,采用稱重的方法確定分裝的不確定度分別為0.29% 或0.39%,、3.2%、0.4%和0.6%,、0.63%和0.71%,。并在分裝時盡量避免生物的,化學(xué)的或灰塵污染,,操作可以在清潔級的房間內(nèi)操作或在配備高效微粒空氣過濾器的層流柜中操作,。分裝應(yīng)盡快在短時間內(nèi)完成,,以確保同一批次所有的分裝單元是在同一時間同樣條件下分裝。
此外,,分裝用分配器,、檢測用儀器均應(yīng)進(jìn)行校準(zhǔn)。所有用于制備的玻璃器皿或一次性消耗品均應(yīng)經(jīng)過高壓滅菌消毒,。用于制備RNA的玻璃器皿應(yīng)經(jīng)過去核糖核酸酶的處理,,一次性消耗品應(yīng)為無脫氧核糖核酸酶和核糖核酸酶的制品。
本文內(nèi)容摘自李金明教授主編《實時熒光PCR 技術(shù)》(第2版)第9章 病毒核酸檢測的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)及其應(yīng)用,。
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