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如何正確獲取離體根系圖像

來源:點將(上海)科技股份有限公司   2022年10月08日 15:04  

分析原理

       通過掃描儀將離體洗好的根系掃描獲取圖像,,使用專業(yè)根系分析軟件對根系圖像分析,得到根系長度、平均直徑,、表面積,、體積、根尖數(shù)等根系表型數(shù)據(jù),。分析的直接對象是圖片,,所以獲取高質(zhì)量的根系圖片獲得準(zhǔn)確數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)。

         適用于DJ-GX02根系分析儀,。

適用對象:

離體洗根后的植物根系

圖像獲取設(shè)備:

        儀器標(biāo)配含有經(jīng)過嚴(yán)格校準(zhǔn)的掃描儀以保證圖像的質(zhì)量,。每臺掃描儀配有專用控制軟件,用于參數(shù)設(shè)置和圖像獲取,、保存,。

       如果使用普通掃描儀,只有掃描頭部位的光源,,也就是下方照光,,因為根系的立體結(jié)構(gòu),根系在背景板上會留下陰影,,掃描出來的圖像上,,根系附近就有陰影,圖像不夠清晰,,影響分析,。


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       雙光源投射掃描,上方照光,,下方掃描成像,,得到根系的投影。由于光源來自于上方,,沒有根系的地方將是白色的背景,,有根系的地方光受根系遮擋,根系呈現(xiàn)黑色,,四周邊界清晰,,根與背景區(qū)分非常明顯,對分析非常有利,。

圖片關(guān)鍵詞圖片關(guān)鍵詞

掃根成像:

      使用投射掃描時,,需要將上光源的背景板取下,否則背景板將上光源遮擋,,掃描的圖像將一團黑,。

圖片關(guān)鍵詞 圖片關(guān)鍵詞

        放置定位框,按照如圖所示的方向,,注意定位框凹陷一端(箭頭所指)的位置,。為了放置根盤直接壓在上光源玻璃板上,隨貨配有增高墊,如左下圖所示,,放置在面板上,。

圖片關(guān)鍵詞 圖片關(guān)鍵詞


洗好的根系放置在根盤內(nèi),隨貨配有3種不同尺寸的根盤,,選擇適合根系大小的,,放入根系和清水,細小的根系在水中會分散開,,便于成像,。

 對于根系基部比較大的根系,比如樹苗,、玉米的根,,可將根系分別剪下來,平鋪到根盤中,;

 如果一個根系上根的數(shù)量很大,,可以分多次掃描,分析時將根盤的數(shù)據(jù)累加,;

圖片關(guān)鍵詞

     掃描根系可以提前預(yù)覽,,保存只有根系的圖像,拋棄根盤的區(qū)域,,便于后面軟件直接自動分析,。

圖片關(guān)鍵詞


掃描參數(shù)的設(shè)置:

        掃描參數(shù)決定了掃描圖像的質(zhì)量,參數(shù)中最為關(guān)鍵的是分辨率,,一般設(shè)置300ppi即可,,滿足絕大多數(shù)樣品的成像需求;如果樣品非常細小,,可以選擇更高的分辨率值,,比如600ppi;設(shè)置是在成像控制軟件界面,。更高的分辨率意味著圖像占的內(nèi)存更大,。

圖片關(guān)鍵詞

    圖像掃描完成后,要保存到計算機硬盤中,,選擇jpg、tiff均可,。建議先將所有根系的圖像全部掃描完成后再進行圖像分析,,軟件有批處理分析功能。

3副根系掃描圖

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