一:eDNA采樣硬件選擇
在魚類資源調(diào)查中,,國際上普遍認可的專業(yè)采樣設備為美國Smith公司生產(chǎn)的多通道水體基因采樣器或便攜式eDNA采樣器,。
可參閱文獻:
eDNA Sampler: A fully integrated environmental DNAsampling system
多通道水體基因采樣器
便攜式eDNA采樣器
設備優(yōu)勢
1,、可記錄采樣點流速,、GPS,、溫度等信息
2,、內(nèi)置計算機,可導出采樣日志,、為每個樣品標注采樣編碼
3,、采樣飽和后具有震動反饋功能,可設置定量采水
4,、具備遠程藍牙遙控采水功能
5,、可進行多通道的同步采樣
6、自封濾膜(技術(shù)):采用合成樹脂材料自動對樣本進行脫水處理,,使DNA信息能在室溫下保存90天不降解(傳統(tǒng)采樣方式需要對樣品進行乙醇加注,、冷凍、防腐等措施,,費時費力,,往往會在采樣點浪費大量時間)
①降低污染——傳統(tǒng)樣品處理方式需要現(xiàn)場對樣品進行防腐處理,會增加污染可能,。
②提高DNA含量——與傳統(tǒng)使用乙醇相比,,檢測到的DNA含量是其2倍。
③提高效率——現(xiàn)場無需準備乙醇及緩慢的過濾工作,,無需準備冷凍措施低溫保存樣品,,即便是沒有相關(guān)從業(yè)經(jīng)驗的人員即可快速上手實現(xiàn)標準化的采樣工作。
設備標配自封濾膜套裝self-preserving packs——封裝后即可郵寄至我司合作實驗室分析
二:樣品(q)PCR分析并出具報告
樣品分析由上海蔚雨科技有限公司合作實驗室進行分析,,用戶所使用的濾膜必須為廠家提供的自封式濾膜,,郵寄至廠商接收點(常溫,、無需使用乙醇等固定液),2周內(nèi)即可獲取結(jié)題報告,。
自封式濾膜可參閱文獻:
A self‐preserving, partially biodegradable eDNA filter
1,、流程
環(huán)境DNA提取——設計合成引物接頭——PCR擴增產(chǎn)物純化——PCR產(chǎn)物定量均一化——測序文庫構(gòu)建——高通量測序——生成報告
2、樣品報告包括但不限于:
相關(guān)產(chǎn)品
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