植物基因組提取試劑盒的用途與合成方法,!
一、背景
本試劑盒采用可以特異性結(jié)合DNA的離心吸附柱和*的緩沖液系統(tǒng),,能提取多種植物細胞/組織中的基因組DNA,。離心吸附柱可以高效、專一吸附DNA,,可限度去除雜質(zhì)蛋白及細胞中其他有機化合物,。提取的基因組DNA片段大,純度高,,質(zhì)量穩(wěn)定可靠,。
二、適用范圍
使用本試劑盒回收的DNA可適用于各種常規(guī)操作,,包括酶切,、PCR,、文庫構(gòu)建、Southern雜交等實驗,。
三,、保存條件
本試劑盒在室溫(25℃左右)干燥條件下,可保存1年,;更長時間的保存可置于2–8℃,。2–8℃保存條件下,若溶液產(chǎn)生沉淀,,應在使用前置于37℃下溶解沉淀至溶液澄清后再使用,。單獨包裝的RNaseA收到后-20℃保存。
四,、純度檢測
基因組DNA片段的大小與樣品保存時間,、操作過程中的剪切力等因素有關(guān)。提取的DNA片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與純度,??膳渲?.8-1.0%瓊脂糖凝膠,使用λ/HindIII判斷基因組的大小,,完整的基因組大小應在23kb以上,。使用分光光度計檢測時,OD260/OD280比值應為1.7–1.9之間,,如果洗脫時不使用洗脫緩沖液,,而使用去離子水洗脫,比值可能偏低,,但并不表明DNA純度不高,。
五、準備工作
1,、準備液氮,;65℃水浴,;無水乙醇,;1.5ml滅菌離心管。
2,、按照標簽所示在緩沖液AP3和漂洗液PW中加入無水乙醇,,混勻后蓋緊瓶蓋后室溫貯存?zhèn)溆谩?/span>
3、每次使用前請檢查緩沖液AP1,,緩沖液AP2和緩沖液AP3是否有沉淀生成,,如果出現(xiàn)沉淀,37℃溫浴至沉淀溶解后再使用,。
六,、操作步驟
如非指出,,所有離心步驟均為使用臺式離心機在室溫下離心,。
1,、取適量植物新鮮組織500mg-1g加入液氮充分研磨,取約100mg粉末置于1.5ml離心管中,,加入400 μl 緩沖液AP1和6 μl RNaseA (10mg/ml),,漩渦震蕩1分鐘。
2,、將離心管放在65℃水浴10分鐘,,水浴過程中顛倒離心管以混合樣品數(shù)次。
3,、加入130 μl 緩沖液AP2,,顛倒混勻,冰浴5分鐘,。
4,、12,000rpm離心5分鐘。
注:此步驟離心去除去垢劑,,蛋白以及多糖等雜質(zhì),。
5、取上清(通常為400 μl)轉(zhuǎn)移到過濾柱CF中,,12,000rpm 離心1分鐘,。
6、將濾出液轉(zhuǎn)移到1.5 ml離心管中,,加入1.5倍體積(例如400 μl的上清液加600 μl緩沖液AP3)緩沖液AP3(使用前請注意是否已經(jīng)加入無水乙醇),,立即顛倒混勻,簡短離心以去除管蓋內(nèi)壁的水珠,。
7,、吸取步驟6中的混合液加入到吸附柱CG中(吸附柱放入收集管中),12,000 rpm離心1分鐘,,倒掉廢液,,吸附柱CG放回收集管中。
注:離心吸附柱的容積是700μl,,如果一次不能*上柱,,可以分次上柱離心,保證全部溶液全部加到離心柱中,。
8,、向吸附柱CG中加入500 μl漂洗液PW(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12,000 rpm離心1分鐘,,倒掉廢液,,吸附柱CG放入收集管中,。
9、重復步驟8,。
10,、可選步驟:如果離心柱的吸附膜上有顏色,向吸附柱CG中加入500 μl無水乙醇,,12,000 rpm離心1分鐘,,倒掉廢液,吸附柱CG放入收集管中,。
11,、將吸附柱CG放回廢液收集管中,12,000 rpm離心2分鐘,。
注:此步驟非常重要,,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除。漂洗液中乙醇的殘留會影響后續(xù)的酶反應(酶切,、PCR等)實驗,。
12、將吸附柱CG轉(zhuǎn)入一個干凈的1.5ml離心管中,,向吸附膜的中間部位懸空滴加50-100 μl經(jīng)65℃水浴預熱的洗脫緩沖液EB,,室溫放置2分鐘,12,000 rpm g離心2分鐘,。
注,;1.洗脫緩沖液體積不少于50 μl,體積過小影響回收效率,。
2.洗脫液的pH值對于洗脫效率有很大影響,。若用水做洗脫液應保證其pH值在7.0-8.5范圍內(nèi),pH值低于7.0會降低洗脫效率,。
13,、DNA產(chǎn)物-20℃保存。
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