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高通量篩選大腸桿菌重組蛋白生產(chǎn)用酵母營養(yǎng)素

來源:貝克曼庫爾特國際貿(mào)易(上海)有限公司   2022年06月13日 23:22  

隨著重組DNA技術(shù)的迅猛發(fā)展,,外源基因在不同宿主中的表達(dá)使得各種重組蛋白的工業(yè)生物生產(chǎn)成為可能,。選擇合適的宿主是生物工藝設(shè)計(jì)中的關(guān)鍵步驟之一,具體取決于:


1.上游培養(yǎng)效率


2.易于基因編輯和分子工具的可用性


3.翻譯后修飾的能力,,如糖基化


4.蛋白質(zhì)(用于下游加工和作為生物制藥成分等)的分泌能力


目前,多種生物已被應(yīng)用于重組蛋白的生產(chǎn),,尤其是大腸桿菌,,易于基因改造,具有在酵母水解物等多種基質(zhì)上快速生長并產(chǎn)生高蛋白滴度的優(yōu)勢,。已成為迄今為止業(yè)界追捧的主力軍,。


典型的生物工藝優(yōu)化通常需要進(jìn)行一些初步試驗(yàn),以發(fā)現(xiàn)適用于宿主菌株并提高目的重組蛋白表達(dá)的培養(yǎng)基成分(特別是氮基營養(yǎng)素),。對于此類應(yīng)用需求,,能夠提高實(shí)驗(yàn)效率和參數(shù)準(zhǔn)確度的高通量篩選平臺(tái)成為熱門工具。貝克曼庫爾特BioLector通過在線測量關(guān)鍵培養(yǎng)參數(shù)提供可放大的高通量分析,。


本案例為通過BioLector對多種酵母營養(yǎng)素就生物量生長和重組蛋白的形成進(jìn)行評(píng)估和比較,,篩選出了適合大腸桿菌重組蛋白生產(chǎn)和誘導(dǎo)時(shí)間的理想培養(yǎng)基。


方法


培養(yǎng)菌株:大腸桿菌BL21(DE3)pET-28a(+)EcFbFP,。


培養(yǎng)基:以標(biāo)準(zhǔn)TB培養(yǎng)基(Carl Roth)為參照物,,對多個(gè)TB 樣(Terrific 液)培養(yǎng)基進(jìn)行比較。不同的TB 樣培養(yǎng)基使用不同的酵母提取物,。


BioLector培養(yǎng)條件:在接種至微孔板之前,,先在250 mL搖瓶中進(jìn)行預(yù)培養(yǎng), 37°C培養(yǎng)6小時(shí),。然后使用48孔梅花板(MTP-BOH2)在 BioLector中進(jìn)行培養(yǎng),。溫度 37°C ,振搖速度:1400 rpm,。分別在每個(gè)培養(yǎng)孔中填充800μL培養(yǎng)液用于非誘導(dǎo)實(shí)驗(yàn),,填充790μL用于誘導(dǎo)實(shí)驗(yàn)。誘導(dǎo)實(shí)驗(yàn)中,,在誘導(dǎo)時(shí)間點(diǎn)上添加 10μL 50μM 的 IPTG,。環(huán)境氧氣濃度保持在35%,避免培養(yǎng)物缺氧,。


BioLector在線測量:培養(yǎng)過程中對生物量,、EcFbFP(黃素?zé)晒獾鞍?、pH以及 DO進(jìn)行在線測量,。


結(jié)果


不同TB樣培養(yǎng)基的生物量生長情況:


3.1.png


培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中,,不同酵母營養(yǎng)素的培養(yǎng)基中生物量的生長情況如上圖所示:培養(yǎng)基不同,最終的光密度和生長速率也會(huì)不同,。ProCel 6 中的大腸桿菌OD最高,,培養(yǎng)基 ProCel 3 中的大腸桿菌的OD低。ProCel 6為本特定工藝的最高生長速率,。


3.2.png


上圖為培養(yǎng)過程的DO值,。培養(yǎng)基 ProCel 3 和 ProCel 4 中的培養(yǎng)物未達(dá)到0%的氧飽和度,,這表明由于耗氧量有限,該培養(yǎng)基中的菌株代謝活性較低,。相反,,其他培養(yǎng)物包括TB標(biāo)準(zhǔn)培養(yǎng)基,均在短時(shí)間內(nèi)達(dá)到0%的氧飽和度,,表明菌株代謝活性高,。


不同酵母營養(yǎng)素TB樣培養(yǎng)基的產(chǎn)物生成:


通過將IPTG 添加到培養(yǎng)物中來誘導(dǎo) T7 聚合酶的表達(dá)促進(jìn)黃素?zé)晒獾鞍椎纳伞ioLector使用梅花板為48個(gè)培養(yǎng)物提供了獨(dú)立的培養(yǎng)空間,,因此可測試不同的誘導(dǎo)時(shí)間點(diǎn),。使用自動(dòng)化工作站整合BioLector后的 RoboLector 系統(tǒng)還可以自動(dòng)進(jìn)行培養(yǎng)誘導(dǎo)。


首先選擇一個(gè)固定的誘導(dǎo)時(shí)間點(diǎn),。分別為培養(yǎng)啟動(dòng)后的3小時(shí)、3.75小時(shí)和4.5小時(shí),。下圖所示為每種TB樣培養(yǎng)基在誘導(dǎo)時(shí)間下所測熒光的平均值,。熒光動(dòng)力學(xué)清晰地表明不同培養(yǎng)基有不同的EcFbFP(黃素?zé)晒獾鞍祝┍磉_(dá)水平。


表現(xiàn)出*熒光信號(hào)的兩個(gè)樣本為:ProCel 2,,誘導(dǎo)點(diǎn)為3.75小時(shí),;ProCel 5,誘導(dǎo)點(diǎn)為 3 小時(shí),。經(jīng)過 7.7 小時(shí)的培養(yǎng),,ProCel 5 的熒光值達(dá)到102.94a.u.,而ProCel 2 的熒光值達(dá)到 101.82 a.u.,。本方法的不足之處在于未比較不同樣本的生物量對蛋白質(zhì)產(chǎn)量的影響,。經(jīng)過3小時(shí)的培養(yǎng),一些培養(yǎng)物的OD已達(dá)到6,,而其他培養(yǎng)物僅達(dá)到3,。當(dāng)誘導(dǎo)具有不同光密度的培養(yǎng)物時(shí),可能會(huì)對在每種酵母營養(yǎng)素上生長的實(shí)驗(yàn)大腸桿菌的蛋白質(zhì)生產(chǎn)性能造成誤解,。


3.3.png


鑒于此,,我們采用了一種新方法,將誘導(dǎo)點(diǎn)與生物量信號(hào)耦合,。使用BioLector的信號(hào)驅(qū)動(dòng)RoboLector,,依賴于特定生物量的誘導(dǎo)對于每個(gè)單獨(dú)的孔都是可行的。為自動(dòng)化工作站設(shè)置3,、6或8的OD目標(biāo)值,,以根據(jù)孔內(nèi)培養(yǎng)物的生長動(dòng)力學(xué)自動(dòng)添加IPTG以誘導(dǎo)蛋白質(zhì)生產(chǎn)。


如下圖所示,,ProCel 2表現(xiàn)最佳,,最終值為 146.23 a.u.,,培養(yǎng)時(shí)間是 12.3 小時(shí);ProCel 5表現(xiàn)次之,,最終值為138.1 a.u.,。與之前進(jìn)行的一系列實(shí)驗(yàn)相比,本實(shí)驗(yàn)中的排名與在特定時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行誘導(dǎo)的實(shí)驗(yàn)不同,。這一觀察證明了最佳工藝條件的重要性,,并使這些條件具有可比性。此處數(shù)據(jù)表明:與之前的實(shí)驗(yàn)相比,,本實(shí)驗(yàn)中的熒光值更高,。正如該領(lǐng)域諸多論文中所強(qiáng)調(diào)的那樣,誘導(dǎo)時(shí)間確實(shí)是一個(gè)關(guān)鍵參數(shù),。同樣,,在優(yōu)化大腸桿菌重組蛋白生產(chǎn)的過程中,也必須評(píng)估誘導(dǎo)劑的濃度,。另外,,與對照TB培養(yǎng)基相比,這里測試的一些酵母氮源產(chǎn)生了更高的重組蛋白產(chǎn)量,。這些結(jié)果凸顯了選擇培養(yǎng)基成分的重要性,,這些成分能夠在特定的生物工藝中實(shí)現(xiàn)高而穩(wěn)定的產(chǎn)量。


3.4.png


結(jié)論


通過BioLector系統(tǒng),,貝克曼庫爾特可為用戶提供適用于各種應(yīng)用領(lǐng)域的高通量篩選平臺(tái),。其*的梅花形微孔板尤其適用于好氧培養(yǎng),如同實(shí)驗(yàn)室生物反應(yīng)器,,BioLector系統(tǒng)通過非侵入式傳感器使客戶能夠獲取更多的在線測量參數(shù),。正如本應(yīng)用,通過BioLector系統(tǒng)可輕松實(shí)現(xiàn)培養(yǎng)基的篩選,,整合自動(dòng)化工作站的RoboLector,,還可實(shí)現(xiàn)更多功能。補(bǔ)料,、pH調(diào)控以及文中所述的誘導(dǎo)功能,,所有這些均可在小規(guī)模實(shí)驗(yàn)中實(shí)現(xiàn),幫助客戶同時(shí)兼顧成本和效率,。


3.5.png


RoboLector高通量自動(dòng)化微型生物培養(yǎng)平臺(tái)


欲了解該應(yīng)用詳情,,請掃描下方二維碼下載應(yīng)用指南《利用BioLector進(jìn)行大腸桿菌重組蛋白生產(chǎn)用酵母營養(yǎng)素的篩選》


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