氣相色譜中的凈化系統(tǒng)也可以認(rèn)為是氣路系統(tǒng)的一部分，其作用主要是凈化載氣中殘留的雜質(zhì),。讓氣相色譜能穩(wěn)定正常的工作,。

凈化裝置的作用：凈化器的功能是幫助GC分析的質(zhì)量和分析結(jié)果的穩(wěn)定性，延長(zhǎng)色譜柱的壽命和減少檢測(cè)器的噪音,。凈化器主要是去除氣體中水分,、烴,、氧。存在氣源管路及氣瓶中的水分,、烴、氧會(huì)產(chǎn)生噪音,、額外峰和基線(xiàn)毛刺,，尤其對(duì)ECD和PIO檢測(cè)器影響更為顯著，個(gè)別情況下還會(huì)破壞色譜柱,。通常水分存在于氣體容器的表面和氣體管路內(nèi)，不僅會(huì)影響組分的分離,，還會(huì)使固定相降解,，縮短柱子的壽命。氧的破壞作用最嚴(yán)重,，即使很微量的氧也會(huì)破壞毛細(xì)管柱,，氧會(huì)使固定相氧化，從而破壞柱性能和柱壽命,，氧化物還會(huì)引起基線(xiàn)噪音的漂移,，并隨著柱溫升高破壞性急劇增大。

吸附劑的活化：由于分子篩凈化的原理是篩分作用,，所在針對(duì)不同氣體可以采用不同類(lèi)型的分子篩達(dá)到不同凈化要求（脫水的同時(shí)脫除其他的物質(zhì)）,，可以參考說(shuō)明書(shū)，活化條件也隨之而異,?？偟膩?lái)說(shuō)，活化后殘留的水分會(huì)影響脫水的效率,，殘留的水越少,，則脫水的效率越高。凈化管中所用的吸附劑（分子篩,、活性炭,、硅膠）及催化劑（脫氧劑）用前必須活化，失活后可再生重復(fù)適用,。

凈化器的安裝：為了提高凈化效果,，凈化器安裝順序需要注意的是氣體必須從凈化器上部進(jìn)入，底部流出,。凈化管進(jìn)出口必須用玻璃棉或燒結(jié)的不銹鋼堵好,，以防止凈化劑的粉末吹入氣相色譜儀的氣路系統(tǒng)，損壞閥件的性能和色譜性能,。