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數(shù)字PCR技術(shù)發(fā)展和原理

來源:北京伯聯(lián)商貿(mào)有限公司   2021年08月27日 15:55  
 在定量PCR時,,我們常常糾結(jié)一個問題,究竟是相對定量還是定量呢,?如今,,你無需糾結(jié)了,因為數(shù)字PCR(digitalPCR)來了,。盡管這兩種技術(shù)有些類似,,都是估計起始樣品中的核酸量,但它們有一個重要的區(qū)別,。定量PCR是依靠標(biāo)準(zhǔn)曲線或參照基因來測定核酸量,,而數(shù)字PCR則讓你能夠直接數(shù)出DNA分子的個數(shù),是對起始樣品的定量,。因此特別適用于依靠Ct值不能很好分辨的應(yīng)用領(lǐng)域:拷貝數(shù)變異,、突變檢測、基因相對表達(dá)研究(如等位基因不平衡表達(dá)),、二代測序結(jié)果驗證,、miRNA表達(dá)分析、單細(xì)胞基因表達(dá)分析等,。[1-2]
  技術(shù)發(fā)展
  20世紀(jì)末,,Vogelstein等提出數(shù)字PCR(digitalPCR,dPCR)的概念,,通過將一個樣本分成幾十到幾萬份,,分配到不同的反應(yīng)單元,每個單元至少包含一個拷貝的目標(biāo)分子(DNA模板),,在每個反應(yīng)單元中分別對目標(biāo)分子進(jìn)行PCR擴增,,擴增結(jié)束后對各個反應(yīng)單元的熒光信號進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。[1][3]
  數(shù)字PCR是一種核酸分子定量技術(shù),。當(dāng)前核酸分子的定量有三種方法,,光度法基于核酸分子的吸光度來定量;實時熒光定量PCR(RealTimePCR)基于Ct值,,Ct值就是指可以檢測到熒光值對應(yīng)的循環(huán)數(shù),;數(shù)字PCR是的定量技術(shù),基于單分子PCR方法來進(jìn)行計數(shù)的核酸定量,,是一種定量的方法,。主要采用當(dāng)前分析化學(xué)熱門研究領(lǐng)域的微流控或微滴化方法,,將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或微滴中,每個反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于或者等于1個,。這樣經(jīng)過PCR循環(huán)之后,,有一個核酸分子模板的反應(yīng)器就會給出熒光信號,,沒有模板的反應(yīng)器就沒有熒光信號,。根據(jù)相對比例和反應(yīng)器的體積,就可以推算出原始溶液的核酸濃度,。
  原理
  PCR實際上是一個在模板DNA,、引物(模板片段兩端的已知序列)和四種脫氧核苷酸等存在的情況下,DNA聚合酶依賴的酶促合成反應(yīng),,擴增的特異性取決于引物與模板DNA的特異結(jié)合,。

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