超微量紫外可見分光光度計是通過檢測物質(zhì)波長處或某一波長范疇內(nèi)光的吸收度,,對物質(zhì)進(jìn)行定量與定量分析的儀器設(shè)備,,目前已成為現(xiàn)代分子生物學(xué)、藥物學(xué),、食品科學(xué)等領(lǐng)域的常用儀器,。常用于核酸,蛋白定量以及細(xì)菌生長濃度的定量,。
2,、核酸的純度檢測
3,、蛋白質(zhì)直接定量
4,、比色法蛋白質(zhì)定量(顏色反應(yīng))
5,、OD600(菌落密度)
1,、核酸的定量
核酸的定量是超微量分光光度計使用頻率的功能,。可以定量溶于緩沖液的寡核苷酸,,單鏈,、雙鏈DNA,以及RNA,。核酸的吸收峰的吸收波長260nm,。每種核酸的分子構(gòu)成不一,因此其換算系數(shù)不同,。定量不同類型的核酸,,事先要選擇對應(yīng)的系數(shù)。測試后的吸光值經(jīng)過上述系數(shù)的換算,,從而得出相應(yīng)的樣品濃度,。
分光光度計的設(shè)計原理和工作原理,允許吸光值在一定范圍內(nèi)變化都是正常的,,即儀器有一定的準(zhǔn)確度和精確度,。影響吸光值A(chǔ)的幾個因素如下:
(1)核酸本身物化性質(zhì)和溶解核酸的緩沖液的pH值,離子濃度等:在測試時,,離子濃度太高,,也會導(dǎo)致讀數(shù)漂移,因此建議使用pH值一定,、離子濃度較低的緩沖液。
(2)樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素:由于樣品中不可避免存在一些細(xì)小的顆粒,,尤其是核酸樣品,。這些小顆粒的存在干擾測試效果。為了盡可能減少顆粒對測試結(jié)果的影響,,要求核酸吸光值至少大于0.1A,,吸光值最好在0.1-1.5A。在此范圍內(nèi),,顆粒的干擾相對較小,,結(jié)果穩(wěn)定。從而意味著樣品的濃度不能過低,,或者過高(超過光度計的測試范
(3)操作因素,,如混合要充分,否則吸光值太低,,甚至出現(xiàn)負(fù)值;混合液不能存在氣泡,,空白液無懸浮物,否則讀數(shù)漂移劇烈;必須使用相同的比色杯測試空白液和樣品,,否則濃度差異太大;換算系數(shù)和樣品濃度單位選擇一致;不能采用窗口磨損的比色杯;樣品的體積必須達(dá)到比色杯要求的最小體積等多個操作事項,。
2,、核酸的純度檢測
除了核酸濃度,超微量分光光度計同時顯示幾個非常重要的比值表示樣品的純度,,如:
(1)A260/A280的比值,,用于評估樣品的純度,因為蛋白的吸收峰是280nm,。純凈的樣品,,比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8或者2.0,,表示存在蛋白質(zhì)或者酚類物質(zhì)的影響,。
(2)A230表示樣品中存在一些污染物,如碳水化合物,,多肽,,苯酚等,較純凈的核酸A260/A230的比值大于2.0,。
(3)A320檢測溶液的混濁度和其他干擾因子,。純樣品,A320一般是0,。
3,、蛋白質(zhì)直接定量
這種方法是在280nm波長,直接測試蛋白,。超微量分光光度計可以直接顯示出樣品的濃度,,或者是選擇相應(yīng)的換算方法,將吸光值轉(zhuǎn)換為樣品濃度,。由于緩沖液中存在一些雜質(zhì),,一般要消除320nm的"背景"信息,設(shè)定此功能"開",。與測試核酸類似,,要求A280的吸光值大于0.1A,的線性范圍在1.0-1.5之間,。蛋白質(zhì)直接定量方法,,適合測試較純凈、成分相對單一的蛋白質(zhì),。紫外直接定量法相對于比色法來說,,速度快,操作簡單;但是容易受到平行物質(zhì)的干擾,,如DNA的干擾;另外敏感度低,,要求蛋白的濃度較高。
4,、比色法蛋白質(zhì)定量(顏色反應(yīng))
蛋白質(zhì)比色法測定的基礎(chǔ)是蛋白質(zhì)構(gòu)成成分:氨基酸與外加的顯色基團(tuán)或者染料反應(yīng),,產(chǎn)生有色物質(zhì),。有色物質(zhì)的濃度與蛋白質(zhì)反應(yīng)的氨基酸數(shù)目直接相關(guān),從而反應(yīng)蛋白質(zhì)濃度,。
比色方法一般有BCA,,Bradford,Lowry等幾種方法,。
由于各種方法反應(yīng)的基團(tuán)以及顯色基團(tuán)不一,,所以同時使用幾種方法對同一樣品得出的樣品濃度無可比性。所以在選擇比色法之前,,最好是參照要測試的樣本的化學(xué)構(gòu)成,,尋找化學(xué)構(gòu)成類似的標(biāo)準(zhǔn)蛋白作標(biāo)準(zhǔn)品。
比色法定量蛋白質(zhì),,經(jīng)常出現(xiàn)的問題是樣品的吸光值太低,,導(dǎo)致測出的樣品濃度與實際的濃度差距較大。因為比色皿中的顏色是有一定的半衰期,,所以每種比色法都列出了反應(yīng)測試時間,,所有的樣品(包括標(biāo)準(zhǔn)樣品),都必須在此時間內(nèi)測試,。時間過長,,得到的吸光值變小,換算的濃度值降低,。反應(yīng)溫度,、溶液PH值等都是影響實驗的重要原因。此外,,非常重要的是,,最好是用塑料的比色法。避免使用石英或者玻璃材質(zhì)的比色皿,,因為反應(yīng)后的顏色會讓石英或者玻璃著色,導(dǎo)致樣品吸光值不準(zhǔn)確,。
5,、OD600(菌落密度)
實驗室確定細(xì)菌生長密度和生長期,多根據(jù)經(jīng)驗和目測推斷細(xì)菌的生長密度,。在遇到要求較高的實驗,,需要采用分光光度計準(zhǔn)確測定細(xì)菌細(xì)胞密度。通過檢測600nm處細(xì)胞生長培養(yǎng)的吸光度,,從而監(jiān)測微生物或其他細(xì)胞培養(yǎng)的生長率,。OD600是追蹤液體培養(yǎng)物中微生物生長的標(biāo)準(zhǔn)方法。實驗中偶爾會出現(xiàn)菌液的OD值出現(xiàn)負(fù)值,,原因是采用了顯色的培養(yǎng)基,,即細(xì)菌培養(yǎng)一段時間后,,與培養(yǎng)基反應(yīng),發(fā)生變色反應(yīng),。
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